1. Для клеточных перепрограммистов нет ничего святого. Из мочи выделили клетки и перепрограммировали их в нейрональные. Спрашиваете, что это за клетки в моче? Эпителиальные случаются. В этот раз использовали технологию из серии 4, когда гены-факторы перепрограммирования не встраиваются в геном, а просто болтаются в цитоплазме, закодированные в эписомальном векторе. Эпителиальные клетки перерограммировались в плюрипотентную, которую посадили расти на коктейль, способствующий дифференциации в астроциты. Говорят, что эта уринотерапия (из комментов) при лечении, как его, Альцгеймера может пригодиться.

Вот еще успешный пример. Клетки имунной системы перепрограммировали с помощью вируса почти СПИДа и вылечили лейкемию. Биг фарма, такие дела.

2. Редактор журнала Plant physiliology отобрал статью генноинженерных лоббистов, которые рассуждают на тему "поломаем ли мы геном, нарушим ли мы его стабильность, если встроим туда какой левый ген и как это будет выглядить в сравнении с нормальной хорошей естественной селекцией". Это такой базовый обзор текущих представлений и знаний о геноме и того, что там происходит. Можно брать за основу лекции студентам. Вкратце - геном вообще очень пластичный, там постоянно что-то случайно мутирует, гомологично и негомологично рекомбинирует, перескакивает с места на место. Подискутировали даже любимую пугалку анти ГМО борцов 35S промотор, у которого обнаружился потенциальный сайт рекомбинации. Таких потенциальных сайтов у нормальной хорошей пшеницы приблизительно миллион, а к хлопка 40 тысяч.

Если притягивать за уши аналогию, то она будет приблизительно такая (несколько утрирую): с неба валится камнепад огромными булыжниками, а мы стоим под ним и дискутируем, каков риск получить конъюктивит от попадания пылинки в глаз.

3. Годовой отчет успехов сельского хозяйства Германии в картинках. К сожалению, на немецком, но если кто интересуется  темой (особенно некоторые директора агрохолдингов), то стоит переводить и читать. Текст простой, картинки ясные. Буквально несколько примеров.
В сельском хозяйстве прямо или опосредовано задействовано 11% всех трудящихся Германии.
Продуктивность сельского хозяйства за 20 лет возросла в два раза.
В 1900 году один фермер кормил четырех человек, в 1950 - 10 человек, в 2010 году -131 человек.
Потребление: в 1900 году на питание уходило половина доходов, а в 2010 - 14,7% (без учета деликатесов - 11,5%).
Экологически ориентированное хозяйство занимает 6,1% всех площадей. Из всех ЕС стран Германия стоит на третьем месте после Испании и Италии. Переход на экологическое земледелие выгодно только в одном случае - если продукты продавать намного дороже. Расходы на пестициды уменьшаются, возрастает в два раза стоимость персонала, на треть уменьшается добыча молока (я знаю, что не добыча, просто так смешнее), в два раза урожайность пшеницы (при этом стоимость этой же пшеницы вырастает в два раза). Мнения потребителей тщательно изучается и на первом месте стоит мнение потребителей, что это намного здоровее. Так что теперь под этим соусом и будем потреблять.

В отчете также обзор мировых сельхоз рынков по культурам, а также прогнозы импорта-экспорта в свете общей экономической ситуации. Что интересно, Россия - третий по значимости торговый партнер Европы после Китая, причем из России в Европу экспортируется на 90 миллиардов евро больше, чем импортируется туда.

Апд. И чтоб два раза не вставать.
4. Геномщики еще раз согласны с этнографами, что цыгане родом из северозападной Индии, откуда они свалили полторы тысячи лет тому назад.
5. Зеленый чай со всех сторон хорош. Поверьте на слово.
6. Земля ночью. Просто красивая картинка о том, кто будет за собой последним выключать свет.
7. Камчатский вулкан Плоский Толбачик с космоса.
8. Британский food minister Owen Paterson весь такой за ГМО. Уэльским борцам против ГМО будет против чего бороться.

Ухты!

Dec. 5th, 2012 11:07 am
progenes: (Default)
Тайны Стивена Хокинга: интервью ведут дети.

Авторы книг о приключениях мальчика Джорджа в космосе, астрофизик Стивен Хокинг и его дочь, писатель Люси Хокинг ответили на вопросы российских школьников (участников программы "Школы Розового Жирафа"). Это Илья Колмановский во всем виноват [livejournal.com profile] larkinvalley.

Выдержка
Арина Курашова, 8 лет:
А могло ли быть так, что миллиарды лет назад жизнь была, скажем, на Марсе и оттуда попала на Землю?


Мы думаем, что в прошлом на Марсе было теплее, чем сейчас, и влажность была выше. В настоящий момент марсоход NASA на Марсе выясняет, могли ли условия на этой планете в прошлом подходить для существования хотя бы простейших форм жизни. Этот марсоход, который носит имя «Кьюриосити» («Любопытство»), уже нашёл свидетельства того, что когда-то на Марсе была жидкая вода, а другие эксперименты показали, что под поверхностью планеты и на её полюсах и сейчас есть вода, но замёрзшая. Сейчас планета Марс – это холодная пустыня, и на её каменистой, изрытой кратерами поверхности нет никакой жизни. Но что если в прошлом всё было совсем по-другому? Что, если жизнь действительно зародилась на Марсе, а потом была перенесена на Землю? Солнечная система в самом начале была очень неспокойным местом, в ней то и дело происходили мощные столкновения, повсюду летали огромные камни. Возможно, что какой-то большой камень откололся от поверхности Марса, а Земля подхватила его – а вместе с ним и жизнь. Этот процесс – перенос жизни с планеты на планету – называется «панспермия». Если жизнь и вправду попала на Землю с Марса, значит, все мы марсиане. Но это, конечно же, не объясняет нам, откуда взялась жизнь на Марсе.


ПыСы: кстати, марсианские хроники отслеживает [livejournal.com profile] alien3

via [livejournal.com profile] sergepolar

Вот, а вы говорите, образованию конец, блогосфера загибается.
1. Что не может не радовать - рунет отлично переварил крысиную историю Сералини и без моего скромного участия.
[livejournal.com profile] asena написала статью в Слон. ГМО: нас пугают, а нам не страшно
Марина Аствацатурян Шумно и гамно про крыс и ГМО
По слухам пишется еще статья, если выйдет, то повешу ссылку.
Была также потасовка на science-freaks .
2. Оказалось также, что солидные медиа тоже не купились на жареное. Во-всяком случае не все, не сразу и не совсем. Например Forbes Cancer In Rats: Real Scientists Deeply Unimpressed. Politics Not Science Perhaps?
3. Продолжаю мониторить прессу. После того, как первая волна истерического цунами спала, начался настоящий праздник. Встречаются интересные блоговые заметки.
Why I think the Seralini GM feeding trial is bogus
Was it the GMOs or the BPA that did in those rats?
...in which I blow a gasket and get very uppity about this GM-food study which appears to have everyone going nuts at the moment
Seralini anti-Monsanto study was so poorly conducted it harms the anti-GMO movement
Genetically modified corn and cancer – what does the evidence really say?
4. Анти-ГМО движение празднует кризис в Брюсселе. Сералини заявляет о давлении на него ГМО-лоббистов, при этом его статья стала наиболее читаемой за все времена, среди всех открытых статей издательства Springer (хо-хо, вот кому это по-настоящему выгодно! ), обогнав несчастные гемодинамические параметры при интенсивной терапии септического шока.
5. Монсанта отписалась официальным пресс-релизом, дескать, посмотрим на результаты поближе, а потом поговорим.
6. Интереснее всего реакция научного комьюнити. Нельзя сказать, что Real Scientists Deeply Unimpressed. Очень даже вполне себе импрессыд. В двух местах собирают подписи с просьбой взглянуть на сырые результаты.
Раз: Urge Dr. Seralini to release data from studies on biotech corn with rats
Два: Please release data from your biotech corn study.
Откровенно говоря, интереснее всего вопрос: чем все это закончится.
Помнится, как-то в старших классах я украсила реферат про партию изображением Ленина. Получился, он, честно скажем, не очень. Нечто дьявольское сквозило в светлом облике вождя. Учительница, глядя на это безобразие, побледнела и велела немедленно поменять титульный листок на что-то нейтральное: флаг там, серп и молот. И сказала, что Ленина не каждому художнику разрешено рисовать.

Я к тому, что веселая коллекция химической иконописи пополнилась новыми экспонатами. К воде, которая сильно напоминает формальдегид и восьмилучевым снежинкам в нейчур, добавилась пестрая органика эмоций. Особенно досталось АТФу.

Как раз сегодня пришел свежий Laborjournal, там рецензия на книжку - раскраску Bildatlas Genexpression von Fritz Höffeler. В целом отзыв положительный, но зануды все-равно прицепились к определению псведогена, который как бы без функции. Сегодня мы знаем, что в какой закапелок генома не сунься, у него обязательно какая-то функция найдется. Я вообще картинки люблю, поэтому заинтересовалась. Оказывается, Fritz Höffeler довольно известный иллюстратор всякой биологии.
В комментариях спросили, какие инструменты нынче растительные биологи юзают. Под катом краткий обзор инструментального набора начинающегоботаника. )
1. Вот какая ты, красная пленка!

-магнитно-резонансный "срез" говорящей головы. Я так полагаю, что голова кому-то что-то втирает с целью добиться следующего пункта

-магнитно-резонансный "срез" секса (начиная с 1.38 минуты)

-и, как результат, магнитно-резонансный "срез" рождения ребенка. заснято днями в берлинской клинике на красную пленку


2. Смешное How to Be The Lab Bastard от [livejournal.com profile] mstislavl

3. Полемическое от [livejournal.com profile] fregimus однобокоэ о том, как влияет физический труд на свежем воздухе, «органическая» пища — растения, выращенные без химических удобрений и животные без антибиотиков-прикормок, дауншифтинг, и с ним отсутствие стресса гонки потребления, а также воздержание от курения табака и прочей флоры на продолжительность жизни.

4. Интересное. [livejournal.com profile] kodak2004 подогнал две ссылочки, подробно не смотрела, но звучит интересно. Придумали генно-модифицированные бактерии, которые предупреждают образование рака в кишечнике.

http://ria.ru/science/20120613/672035422.html
http://www.pnas.org/content/109/26/10462.full
Я не пропала, у нас каникулы были. Тур по Германии - Голландии. Отведали

1. Археологический парк Ксантен. Раскопки древнеримской колонии плюс музей. Интересно и детям, и взрослым. Музей отличный. За день все можно посмотреть и руками потрогать.

2. Останавливались в Center Parcs Limburgse Pee. Условия так себе, но в стоимость входит билет на Флориаду, куда, собственно, мы и собирались.

3. Флориада 2012 в Венло. Поскольку мы завсегдатаи таких мероприятий и не пропускаем садоводческие выставки ни земельного, ни общенемецкого масштабов, то уже всего насмотрелись. От интернациональной Флориады, которая проводится раз в 10 лет, ожидали вообще чего-то грандиозного. По факту могу сказать, что неплохо, но в ландшафтном дизайне немцы впереди планеты всей и даже обычная БУГА, которая через год, поражает даже больше. Так что в следующем году в Гамбург на Бугу. Кто-то из Жжистов на Флориаде был и писал, повторяться не буду.

4. Парк аттракционов Efteling. Поскольку у нас ребеночек, то ему надо, кроме римлян и цветочков еще развлекух. Решили сходить на качели. Как обычно, такие парки хорошо, но только в межсезоньое. Поскольку каникулы из всей Европы только у нас, то в парке пусто и без очередей. Красота. Тема парка - сказочки. Совсем малышам тоже будет интересно. Рекомендую.

5. Dutch Open Air Museum. Исторический музей под открытым небом. Отличный парк. Интересно и познавательно. И детям, и взрослым. Опять таки, за день все можно посмотреть и руками потрогать.

6. Нет, еще не все. Возвращаемся в Германию. Буквально на границе парк развлечений Irrland. Отличная идея. Просто и со вкусом. Вместо каруселей - лабиринты из соломы, горки с ковриками из самолета Антонов, ангар с 200 тоннами кукурузы и трубами, чтобы строить кукурузный трубопровод, поросята и телята, лужи в песке и для родителей столики с грилями. По-моему, пару сотен столиков и грилей. В парке можно спокойно укатать целую ораву спиногрызов.

7. С горем пополам доехали до Майнца. Там виноградники. Туром по виноградникам с заходом в винодельню на дегустацию завершаем короткие каникулы.

8. Целый день поливали дачу, а то у нас натуральная засуха. Умопомрачительно цветут ирисы. Разгребу все дела, покажу.
Может кто помнит, а может быть кто и забыл, так я напомню, редакция strf ru проводила конкурс научно-популярных блоговых постов.
Под катом будут результаты, а до этого я немного расскажу, как мы судили. Это был довольно интересный опыт. В жюри нас было пятеро [livejournal.com profile] dok_zlo, [livejournal.com profile] feanoturi[livejournal.com profile] maksina, [livejournal.com profile] nature_wonder и я. Мы соорудили сеновал закрытый и там судили. Признаюсь, если бы не Денис Тулинов и который [livejournal.com profile] nature_wonder, который постоянно нас дергал и вежливо напоминал, то мы бы накрыли это судейство медным тазом и обрели позор на всю оставшуюся жизненьку.

Сначала нас завалили кучей постов без разбору. Мы придумали несколько размытые критерии для первого сита и отобрали простым большинством голосов жюри те 52, которые потом появились на сайте редакции в виде списка.

Затем наступил второй этап конкурса. Каждый член жюри выбрал из каждой номинации три наиболее приглянувшихся поста и сбросил в общий котел "лучших". Таким макаром сформировали второй список. Понятно, что вкусы у жюри отличаются, так что в некоторых номинациях было до шести постов.

Третий этап конкурса - тайное голосование. Каждый член жюри оценил посты в каждой номинации от 1го до 20ти баллов и как бы незаметно отправил свои результаты в редакцию. В редакции просуммировали баллы от каждого члена жюри и победителей вы сможете созерцать на сайте или под катом, если я не намудрила с хтмлом. )
Был такой Чаргафф. Вот именно он подготовил почву для открытия Уотсона и Крика.

Он посчитал, что количество азотистых оснований имеет определенную закономерность. А именно количество
аденина равно количеству тимина, а гуанина — цитозину (%A = %T and %G = %C). С открытием структуры ДНК, стало ясно почему так: в двуцепочечной ДНК азотистые основания соединяются по принципу комплементарности. Напоминаю, как...

ATC GAT AGA TAC AGA
TAG CTA TCT ATG TCT

В процентном соотношении количество GC пар может не соответствовать количеству АТ, но (еще раз) количество аденинов (А), будет равно количеству тиминов (Т), а количество гуанинов (Г) будет равно цитозинам (Ц). До этого момента ясно.

Как только досеквенировали полные геномы, обнаружилось вот что. Па-ба-ба-бам. Эта закономерность также справедлива для одноцепочечной ДНК. Приблизительно вот так.

ATATCAGTGCTTAA
Как видим, у наст тут A -5 штук, T - 5 штук, G -2 штуки, C-2 штуки.

Этак закономерность называется Chargaff Parity Rule 2. Врочем, это справедливо не для такого маленького отрезка, а когда мы весь геном учтем. И это правило не работает для вирусных геномов, а также геномов митохондрий и хлоропластов.

Биологическая причина такой закономерности не ясна. Ищут сейчас. Возможно ее и нету вовсе. Иногда мы можем искать смысл там, где его нет. Напомню известную коллекцию с буквами алфавита на крыльях бабочек.


Впрочем, это не исключает того факта, что русскоязычную википедийную статью не мешало бы дополнить. За одно поправить опечатку:

"До работ группы Чаргаффа господствовала так называемая «тетрануклеотидная» теория, согласно которой ДНК состоит из повторяющихся белков по четыре разных азотистых основания".

UPD: У известного нам[livejournal.com profile] galicarnax есть более интересные и более подробные посты на эту тему (жаль, не объединены общим тегом) — раз, два и три.
Мне везет на интересных людей. Вот есть у меня такой славный приятель, одессит, аквалангист и классный электрофизиолог из Лондона [livejournal.com profile] shao_s. Вот сходил он однажды с удочкой на рыбалку и...

"Пару лет назад, сидя в камышах в низовьях Днестра и распивая алкоголь с бывшим однокурсником, я без задней мысли спросил что-то вроде “И как оно там щас ваще, на Змеином?” С этого началась история, которая закончилась только недавно: ихтиологической статьёй в журнале Marine Biodiversity, где я, электрофизиолог, – corresponding author.

Сама статья здесь, а то, что я хотел по этому поводу написать в блог, взяли на сайт “Станиславский натуралист“. Если кто не читает по-украински – Гугл переводит более-менее пристойно. Говорю сразу: запятые в тексте – это не только мои, это ещё редакция сайта досыпала :о)"

Вот так и получился электрофизиолог- ихтиолог.

Настаиваю, что теперь пора Серегу отправить с лукошком за грибами и с сачком за бабочками. Узнаем много нового.
На фейсбуке, видимо, бурлит жизнь. В мейл приходят напоминалки:

Mox Perkalaba (который [livejournal.com profile] perkalaba_real) invited you to the event "PERKAKALBA EXPLOSION" Tuesday, May 17 at 8:00pm Location: LVIV

Облизнулась я, вздохнула, как через пару минут опять:

Kateryna Babkina invited you to the event "PERKALABA at Sullivan Room Kiev: concert-freaky-show. Saturday, June 4 at 7:30pm Location: Sullivan room

И чтоб два раза не вставать. [livejournal.com profile] v1adis1av сообщает:

V Всеукраинский фестиваль науки проводится с 19 по 21 мая 2011 (но разные мероприятия будут с 13 по 26 мая). Программа здесь; не только Киев участвует, но и Харьков, Львов, Донецк, Ужгород.... В частности, по физике и астрономии будут популярные лекции в Институте теорфизики (про тёмную материю, графен, кварк-глюонную плазму и проч. и проч.) и Голосеевской обсерватории (про гелиосейсмологию и воду на Марсе). В ИЯИ будет 17 мая день открытых дверей, желающие смогут посмотреть на циклотрон и ядерный реактор, только надо заранее сообщить учёному секретарю (координаты по ссылке).

Шо ж вы бессердечные такие, а?! Да, хочу! Но не могу! Сходите кто-нить вместо меня, а? Не пожалеете. Потом напоеете, как оно было.
Я понимаю, что уже задолбала всех своим ГМО, уж простите.

Вышла вторая серия энтомологических войн. Это краткий обзор сражений на полях оценки экологических рисков в контексте опасности для нецелевых насекомых, которые от ГМО дохнуть не должны. Но я все-же предлагаю освежить тему и начать с первой серии, а то будет непонятно, откуда пляски.

Хоть последний номер весь и космический, но биологи, они завсегда пролезут что-то сказать. Например [livejournal.com profile] shvarz написал «10 важнейших фактов о ВИЧ и СПИДе», а у себя в блоге расширил список до 20ти пунктов.

И чтоб два раза не вставать, когда-то давно со мной побеседовала редакция strf.ru, получилось много бла-бла-бла. Кто меня читает, тот и так читает, вряд ли он что-то новое узнает, но пусть уж тут висит.
Он-лайн журнал. В этом выпуске Milken Institute Review затрагивается также тема ГМО. Но и есть еще куча интересного про Северную Корею и экономику.


Раз уж я сегодня решила ссылками завалить, вот еще парочка.

[livejournal.com profile] terrink пишет цикл о Неинвазивная пренатальной диагностике.
Неинвазивная пренаталка, часть первая: клетки плода в материнской крови.
Неинвазивная пренаталка, часть вторая: анализ общей ДНК плазмы крови.
Неинвазивная пренаталка, часть третья: как отличить клетки ребенка от клеток мамы.

Ну и я в "Троицкий вариант. Наука. " написала первую серию энтомологических войн про ГМ-кукурузу и бабочку Монарха.

А вот тут анонс всего последнего номера.

e-learning

Jan. 27th, 2011 09:30 am
progenes: (Default)
Я тут волей-неволей углубилась в образование и у меня есть что сказать. Вот тут у [livejournal.com profile] don_beaver идет обсуждение виртуальной школы, а тут уже обсуждают практические моменты.

Буквально несколько цитат:

Если есть интерес и Интернет – сиди, учись. Вот задачи для поступления в вузы, вот художественная развивающая литература, а вот школьное Научное Общество, где можно заниматься наукой. А вот и ведущие учёные, которые готовы ответить на твои вопросы, а то и поруководить твоими занятиями.

Виртуальная школа не требует постоянного присутствия учителей, она, один раз накопленная, будет служить десятилетиями, хотя какое-то живое участие преподавателей потребуется. Я бы с удовольствием пошёл бы учителем в такую школу. Записал бы уроки по кольцам планет, по небесной механике... А то бы и школьное научное общество возглавил, если бы доверили.

По-хорошему, давно пора. Я в педагогическом припадке днями углубилась в тему e-learning с целью поискать что-то обучающее ребенку на немецком. И у меня открылись глазищи, буквально вывалились из орбит. )
Последний день перед рождеством прошел. Зимняя, ясная ночь поступила. Глянули звезды. Месяц величаво поднялся на небо посветить добрым людям и всему миру, чтобы всем было весело колядовать и славить Христа. Морозило сильнее, чем с утра; но зато так было тихо, что скрып мороза под сапогом слышался за полверсты. Еще ни одна толпа парубков не показывалась под окнами хат; месяц один только заглядывал в них украдкою, как бы вызывая принаряживавшихся девушек выбежать скорее на скрыпучий снег. Тут через трубу одной хаты клубами повалился дым и пошел тучею по небу, и вместе с дымом поднялась ведьма верхом на метле.


На метле - це я. Тут как раз скандальные страсти подоспели, я знаю, вы такое любите )

Обзор

Dec. 9th, 2010 10:16 am
progenes: (Default)
У меня завершился небольшой марафон, еще осталось гороховый урожай собрать, но уже чуток времени появилось.

Для затравки небольшой улов из ленты. )
Кто еще не видел, спешите. В "Троицком варианте" статья Михаила Гельфанда (он же [livejournal.com profile] prahvessor) Геном другого человека.

Любопытная дискуссия на эту тему развернулась у [livejournal.com profile] ivanov_petrov.

Profile

progenes: (Default)
progenes

July 2017

S M T W T F S
      1
2 345678
9101112131415
16171819202122
23242526272829
3031     

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 23rd, 2017 12:42 pm
Powered by Dreamwidth Studios