Я лишь предложил (ниже по тексту, в комментариях) одновременно травить мышек антибиотиком - чтобы создать условия для направленного отбора в популяции их кишечных симбионтов:

"Берем обычных лабораторных мышей - делим их на четыре группы.
Две группы кормим ГМО-модифицированной едой с геном устойчивости к антибиотику, две группы - обычной едой.
Соответственно, в каждой из групп одну группу дополнительно лечим курсом антибиотиков.
Так повторяем в ритме обычных сезонных инфекций, с поправкой на короткую жизнь мышиных хомикадзе.

Потом делаем всем четырем группам хомикадзе харакири и высеваем в чашки Петри их кишечную флору.

Ну а дальше - смотрим, сколько бактерий выработали устойчивость к антибиотику по каждой из групп."

Насколько я понимаю - приведенный Вами эксперимент проводился без травли мышей антибиотиком.