А вторичная структура не зависит от направления синтеза протеина? Т.е. если одну и ту же последовательность прочитать сначала спереду-назад, а потом задом-наперёд? Белок не начинает сворачиваться уже на середине процесса, когда "хвост" ещё не вышел?