progenes: (Default)
progenes ([personal profile] progenes) wrote2013-04-30 02:53 pm

Футуризм

С ГМО в Германии мы помним, что не фонтан. Опять таки, дележ грантов вышел на новые горизонты. Заявку на изучение парочки генов можно писать, но этим можно только развеселить фонды. По крупному загрести можно крупными прожектами. Геномику и транскиптомику уже освоили, секвенированием геномов никого не удивишь, метаболомику подгребли, надо что-то новое. Новый челендж -феномика. В комбинации с другими -омиками.

На деле это неинвазивное фиксирование всевозможных параметров растений, у которых разные генетические бэкграунды. Ну что можно зафиксировать? Скорость роста, размер растения в процессе роста, площадь листа, прирост биомассы, цвет, архитекруру, эффективность фотосинтеза, отмирание, заражение болезнями и развитие этих болезней, измерение химического состава семян (да-да, неинвазивное), состояние почвы и пр. Для этого дела придумывают huge теплицы с huge растений, которые фотографируются в постоянном режиме и биоинформатики теперь уже не гены сортируют, а обрабатывают huge картинок. Короче, биоинформатики, внимание, сейчас imaging - новый тренд.

Ощутимого выхлопа от этого всего дела еще нет. Все, что я наблюдаю, это окольные пути, чтоб в результате этих huge усилий добраться до какого-то гена (одного) и его поанализировать традиционными методами. Но кто ищет простые пути?

Пока еще есть huge проблемы технического плана - листья перекрываются, заросли мха на земле флюоресцируют своим хлорофиллом и дают huge помехи, транспортировка растений - стресс и вообще, теплица, даже если она huge это слишком стандартно. Поэтому придумывают самоходные камеры, которые ездят по полям. Но опять таки, колеса по земле - это воздействите на корни и тоже стресс. В общем, делюсь я как-то своим скептицизмом с коллегой по поводу этих huge проектов, а он мне и говорит: Да, разумеется это все ерунда! Вот если бы такой летающий вертолет с камерой, это дааа.

Я открыла рот от удивления. Но потом подумала, что может в результате таких вот диких фантазий и рождается в будущем что-то действительно новое и интересное.

Это меня спросили в личке о проекте биохакерской группировки BioCurious Glowing Plants.
Я вам честно скажу, идея встроить флюоресцентные белки в растения и украсить ими себе жизнь появилась ровно тогда, когда такие белки вообще открыли. Обратите внимание на год. Уже и Нобелевскую премию дали, уже в каждой растительной лаборатории есть светящийся табак. Но до сих пор у нас нет ландшафтов как в фильме Аватар. Проблема в том, что для того, чтоб что-то купить, надо что-то продать. Чтоб GFP завсетился, его самого перед этим возбудить другой волной. Все красивые флюоресцентные картинки сделаны в ультрафиолете. Есть такие белки, которые и автофлюоресцируют, вроде люциферазы, но им тоже энергия надо.

Если я не ошибаюсь, один из последних удачных экспериментов по получению автофлюоресцирующих растений табака, был опубликован в 2010 году. Для ориентирования пару фактов - при полной темноте и при большом воображении можно видеть слабое и быстро угасающее зеленоватое свечение табака еще примерно 20 минут после того, как выключили свет. К слову, коллеги пробовали под это дело фирму организовать еще в 2010 году. Что-то мне подсказывает, что не все получилось, поскольку kickstarter кивает на кооперцию с Krichevsky. Это все, други мои, о передовом крае биотехнологии светящихся растений.



То есть до аллей светящихся растений еще очень-очень-очень далеко. Но! Возможно у них что-то действительно получится со светящимися растениями. В будущем. И что совершенно точно у них уже получилось, так это привлечь внимание широких слоев населения к биотехнологии и повыступать против идеи патентования генов.

[identity profile] victor-zagorski.livejournal.com 2013-04-30 01:01 pm (UTC)(link)
Т.е. к июлю, как господа рвутся, семена сколько нибудь долго флюоресцирующего растения получить вряд ли удастся?

[identity profile] progenes.livejournal.com 2013-04-30 01:02 pm (UTC)(link)
Вот пишут, что у них вроде как арабидопсис даже уже есть. Но что-то убедительных результатов мне не видно. Может плохо искала.

[identity profile] victor-zagorski.livejournal.com 2013-04-30 01:04 pm (UTC)(link)
Вот мне и странно, что они само растение не засняли. Только комп графика и всё.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2013-04-30 01:05 pm (UTC)(link)
нууууу... вообще-то, крокодилы летают, но очень низко. И крыльями не машут! .

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-04-30 01:18 pm (UTC)(link)
надо обратно фреоны возвращать, распылять с самолетов и ликвидировать озоновый слой. УФ будет - засветись! :))
Кстати, в прошлом году в одной пещерке на Ибице видела: стоят спец. лампы и подсвечивают УФ лужи, в которых кто-то флюоресцирующий обитает. :) Так что для парков и пр. декораций проблема с возбуждением свечения вполне решаема.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2013-04-30 01:39 pm (UTC)(link)
Ну можно ультрафиолетом подсвечивать. Но тогда нафига в растения "лампочку" встраивать?

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-04-30 01:55 pm (UTC)(link)
Ну растения-то не в УФ светятся :) Получится красиво и орригинально.

[personal profile] alll 2013-04-30 01:52 pm (UTC)(link)
После уборки озонового слоя они будут светится днём. Что как бы прикольно, но не совсем совпадает с желаемым. ;)

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-04-30 01:57 pm (UTC)(link)
днем - не видно будет. :) все будут по подвалам сидеть и в темных очках ходить. А ночью - самое оно

[personal profile] alll 2013-04-30 02:02 pm (UTC)(link)
Ночью конечно оно, но источник ультрафиолета - солнце, которое ночью не оно.

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-04-30 02:22 pm (UTC)(link)
обычно флюоресценция не "выключается" мгновенно :) У нас дома "звезды" на потолке в детской ещё пару часов вполне светят :))

хотя, естественно, самый разумный вариант - внешняя подсветка УФ. По крайней мере, в остальной "индустрии развлечений" это срабатывает :)

[identity profile] Андрей Гаврилов (from livejournal.com) 2013-05-02 03:12 am (UTC)(link)
все Ok, только вот распыление фреонов не поможет с этим. А фреоны возвращать неплохо бы и без таких планов )))

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-05-02 09:32 am (UTC)(link)
о! Вот подтянулись и отрицатели озоновых дыр и влияния фреонов на стратосферный озон.

[identity profile] Андрей Гаврилов (from livejournal.com) 2013-05-02 01:48 pm (UTC)(link)
>Вот подтянулись и отрицатели озоновых дыр

- забавная манера, вкладывать свои фантазии в уста собеседника. Вам так легче жить? Не отвечайте, вопрос риторический.

Что касается прочего - предпочитаю результаты научных исследований, а не зеленый пиар. Что и всем прочим рекомендую.

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-05-02 02:15 pm (UTC)(link)
Так я была не права? Вы согласны с тем, что кол-во озона до недавнего времени уменьшалось? И что фреоны способны разрушать озон в стратосфере? Согласны? Или это по-вашему "зеленый пиар"?


Что касается прочего - предпочитаю результаты научных исследований, а не зеленый дениалистский пиар.


[identity profile] Андрей Гаврилов (from livejournal.com) 2013-05-02 02:21 pm (UTC)(link)
я согласен с тем, что Вы, ничтоже сумняшеся, вкладываете свои фантазии в уста собеседника, и последующие указание Вам на это никаких адекватных ситуации действий не производит. Sad but true. Божья роса, таксаать. Ага.


> дениалистский пиар.

- "вот и опять, дорогая редакция, извините за неровный почерк" - классика жанра. Вы опять спорите с голосами в своей голове, полагая при том, что это спор с Вашим собеседником IRL. Ай-ай, беда-беда.
Edited 2013-05-02 15:19 (UTC)

[identity profile] silly_sad.livejournal.com 2013-05-12 08:54 am (UTC)(link)
простой вопрос:
ОТКУДА в стратосфере озон?

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-05-12 11:19 am (UTC)(link)
простой ответ: от солнца

[identity profile] silly_sad.livejournal.com 2013-05-12 12:05 pm (UTC)(link)
а теперь думайте головой при чём здесь фреоны.

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-05-12 12:09 pm (UTC)(link)
а теперь думайте головой, как этот этот ваш коммент связан с вашим вопросом про происхождение озона. Мне вот ваша логика не понятна.

[identity profile] silly_sad.livejournal.com 2013-05-12 01:04 pm (UTC)(link)
"Мне вот ваша логика не понятна"

ЧТД

[identity profile] anitka-rr.livejournal.com 2013-05-12 05:22 pm (UTC)(link)
сами с собой разговариваете? молодец!

[identity profile] nocturnal-kira.livejournal.com 2013-04-30 01:23 pm (UTC)(link)
У светящихся животных симбиотические бактерии. Может и растениям надо так-же? Дополнительную органеллу на базе какую нибудь бактерии.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2013-04-30 01:41 pm (UTC)(link)
Во! Но если бактерии подселять, то уж лучше азотфиксаторов. Давно бьются, но все никак.

[identity profile] nocturnal-kira.livejournal.com 2013-04-30 02:01 pm (UTC)(link)
Простым подселением не обойдёшься. Тут придётся целый специальный орган делать.

[identity profile] victor-zagorski.livejournal.com 2013-04-30 02:37 pm (UTC)(link)
Лучше сразу тех, кто холодный термоядерный синтез. А то азот хватать будут, а другие макро/микроэлементы нет. Непорядокс...

[identity profile] flavorchemist.livejournal.com 2013-04-30 07:59 pm (UTC)(link)
Где бы таких взять. Человеки то толком еще не научились.

[identity profile] victor-zagorski.livejournal.com 2013-05-01 01:17 am (UTC)(link)
В замученных дистилированной водой улитках вестимо.

))

[identity profile] misha-makferson.livejournal.com 2013-04-30 07:56 pm (UTC)(link)
В смысле чтобы не только бобовые почву обогащали, а все подряд рожь там, овощи всякие? По моему мощно.

[personal profile] alll 2013-04-30 01:52 pm (UTC)(link)
Светлячки негодуют.

[identity profile] kodusass.livejournal.com 2013-04-30 01:28 pm (UTC)(link)
Светящиеся - это круто. Пора столбить прочие примочки, например музыкальные растения от ветра не просто шуршащие листьями, а исполняющие Вивальди или Баха.

[personal profile] alll 2013-04-30 01:53 pm (UTC)(link)
С генами от Паганини.

[identity profile] the-toad.livejournal.com 2013-04-30 08:40 pm (UTC)(link)
Музыкальные растения до ветра :-) Пристраиваешься под таким растением "до ветра", а оно тебе мелодично Баха шелестит. Главное - следить за репертуаром растений, а то как жахнет какой металл, и получится как в анекдоте про "заодно" ::-)

[identity profile] shurikbarne.livejournal.com 2013-04-30 03:07 pm (UTC)(link)
пшеница с геном ботулотоксина, или мож какого абортива, для незолотого миллиарда, совсем чуть-чуть - и проблема перенаселения решена, во.

[identity profile] zloradskij.livejournal.com 2013-04-30 05:26 pm (UTC)(link)
А чего GFP? Люциферазу, как светлячки - они в видимом диапазоне.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2013-04-30 08:18 pm (UTC)(link)
Люцифераза в тексте!

[identity profile] zloradskij.livejournal.com 2013-04-30 08:21 pm (UTC)(link)
виноват, тормoзю.

[identity profile] stanpolozov.livejournal.com 2013-05-14 02:43 pm (UTC)(link)
Люциферазе нужен люциферин+О2.
То есть, нужно научить растение этот люциферин синтезировать.
И тогда никакие GFP не нужны :-)

[identity profile] -pg-.livejournal.com 2013-04-30 07:25 pm (UTC)(link)
Вспоминается шутка из какой-то НФ-книжки про "особо яркий сноп света, исходивший от большого скопления светящегося лишайника на потолке пещеры над письменным столом". :)

[identity profile] clayrat.livejournal.com 2013-04-30 07:25 pm (UTC)(link)
Вот только хотел написать про квадро- и прочие коптеры, как опередили.

А imaging это да, у нас директор закупил под это дело даже какого-то сверхмодного фенотипического робота! Там растения ездиют на конвеере, а оно их фотографирует.

[identity profile] misha-makferson.livejournal.com 2013-04-30 08:00 pm (UTC)(link)
>Вот если бы такой летающий вертолет с камерой, это дааа.
Гм. А вбить по краям поля столбики, натянуть тросики и пусть по тросикам над растениями камеры ездят это будет недостаточно футуристично? Кстати по тем же тросикам камере можно и электричество подавать.

[identity profile] weirdan.livejournal.com 2013-04-30 08:03 pm (UTC)(link)
Не, так вы слона не продадите грант не получите.

[identity profile] chieffa.livejournal.com 2013-05-01 09:48 am (UTC)(link)
"Заявку на изучение парочки генов можно писать, но этим можно только развеселить фонды"

Вот это как-то очень печально :(

[identity profile] rempat.livejournal.com 2013-05-02 12:40 pm (UTC)(link)
ГМО это ужас! Покупайте продукты из России

[identity profile] vovix-ldr.livejournal.com 2013-05-06 04:50 pm (UTC)(link)
Вы бы хоть тег sarcasm добавили, а то на полноценную шутку не тянет.