progenes: (lab)
progenes ([personal profile] progenes) wrote2007-07-03 02:01 pm
Entry tags:

Выделяем ДНК!

Я думаю, это должно быть интересно, посмотреть под руки лабораторным трудящимся и понаблюдать за рутинным процессом выделения ДНК из растений. Итак, выделение ДНК в




Сначала ми идем в теплицу и выбираем себе жертву. Отрываем у нее несколько листочков и возвращаемся в лабораторию.




Затем одеваем резиновые перчатки. Во-первых, это красиво, во-вторых, таким образом мы защищаем свои руки от химреактивов.



Берем ступку, наливаем в нее жидкого азота, опускаем туда свежесорваный листочек и растираем по возможности в пыль и добавляем немного (приблизительно 500 микролитров) экстракционного раствора. Раствор для экстракции содержит поваренную соль и детергенты (такие, как в стиральном порошке), а белки выпадают в осадок.



Переносим суспензию в маленькую пробирку, которая на лабораторном сленге называется эппендорф. Теперь нам надо основательно осадить, все что выпало в осадок: белки и обломки клетки.



Для этого нам понадобится центрифуга, куда мы вставляем эппендорфы с растительным экстрактом ДНК. Закрываем и нажимаем кнопочку. Центрифуга раскручивается до 13000 оборотв в минуту и все, что не растворилось в экстракционном растворе, осаждается на дно эппендорфа.



А над осадком будет раствор ДНК, который мы осторожно отбираем пипеткой и выливаем в стаканчик со спиртом. ДНК в спирте выпадает в осадок в виде сопли (простите за сравнение, но из песни слова не выкинешь).



Ее вполне можно намотать на стекляную палочку и полюбоваться. Но это скорее для демонстрации изумленной публике. А потом эту соплю мы опускаем в чистый эппендорф и откручиваем на центрифуге еще раз. На этот раз осадок это как раз то, что нам нужно. То есть относительно чистая ДНК.



Мы отбираем пипеткой остатки спирта, подсушиваем осадок и растворяем в 50 микролитрах воды. Эппендорф подписываем и ставим в коробочку в холодильник на минус 80°C до следующего опыта.


Домашнее задание: Выделение ДНК из клубники в домашних условиях.

Контрольные вопросы:
Что это за сопля на палочке:
1. Кто-то неудачно чихнул?
2. Раствор зарос грибом?
3. ДНК!

Вопросы для размышления:
1. А где РНК?
2. А если я посмотрю это под микроскопом то увижу хромосомы как на картинке?
3. Ну и где тут гены?
4. А если выделить не из листочка, а из цветка, то это будет какая-то другая ДНК?
5. Для того, чтоб выделить ДНК из меня, мне что, пальчик отрубить и растереть?


Завтра будем измерять концентрацию и разглядывать ДНК в ультрафиолете.

[identity profile] ddodo.livejournal.com 2007-07-03 02:30 pm (UTC)(link)
Ты прелесть. :)

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:08 pm (UTC)(link)
ну что это такое! где конструктивная критика?!

[identity profile] choana.livejournal.com 2007-07-03 02:56 pm (UTC)(link)
Fotozhop!!!z 2x malusinkih lystochkiv(0.0002 gr) stoka soplej DNA-NEVERU!!!))
stanislavskij

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:09 pm (UTC)(link)
от хулиганка! это я очень хорошо растерла (краснеет, но продолжает врать)!

[identity profile] choana.livejournal.com 2007-07-03 03:26 pm (UTC)(link)
prikolna userpychka) fioletovi rukavychky-v nas v takogo koloru lysh prybyrayut'-vony tonki??? chy tovsti chy spec dlya kartynky?))pit vid pipetky mabyt' pofnuvsya))
she odne pytannya u vas vsi hodyat' postijno v xalatax v labi? v nikoly- tilky koly pracuyut' z chymos' duzhe nebezpecnym...

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:10 pm (UTC)(link)
у нас є (загинає пальчики) фіолетові, блакитні і салатові. Всі лабораторні, слабоалергенні, без пудри, латексні і не дуже. особисто я люблю фіолетові.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:12 pm (UTC)(link)
в халатах ходять канєшно тільки лаборанти і салаги-докторанти на першому році роботи, а решта, звичайно, псує одяг, витираючи об штани фенол, облизуючи пальці бісля етідіума броміда.

[identity profile] ddodo.livejournal.com 2007-07-03 05:32 pm (UTC)(link)
:)))

nu chesno nihto v molec labi ne nosyt' halaty nikagda....

[identity profile] choana.livejournal.com 2007-07-09 07:33 am (UTC)(link)
ne a serezno?
fenol ob shtanci -a sho robyat' shtanci pid vytyazhkoyu??
Eth Br xixixi ce treba sdelat' pytki v lageryah dlya cellbiologystov -a nu govori infu a to budesh oblyzyvat' EthBr container)))

Re: nu chesno nihto v molec labi ne nosyt' halaty nikagda....

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-09 09:41 am (UTC)(link)
та я ж серйозно. Звичайно, в ізотопці в халатику. А так дуже рідко. Може коли фенолю то часом вдягаю.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:13 pm (UTC)(link)
Епендорфік пізнала. Тепер всьо. Для тебе скоро тільки на голубих екранах.

[identity profile] larissa35.livejournal.com 2007-07-03 06:01 pm (UTC)(link)
Ne skazhy. Shche zahyst.

[identity profile] 0lenka.livejournal.com 2007-07-03 05:05 pm (UTC)(link)
Про отрубленный пальчик порвало два раза. Первый - когда я поняла, почему триллеры про злобных генетиков и их монстров столь популярны. Второй - когда до меня дошло, что делают во Львове с отходами борьбы за чистоту языка :)))

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:15 pm (UTC)(link)
Сейчас тебя порвет в третий раз. Я действительно не знаю, что там растирают нонче? Сначала я была уверена, что у людей, если они не трупы, ДНК выделяют из клеток крови. Но потом я подумала, что у эритроцитов с ДНК туго. Я разволновалась, но потом успокоила себя, что там есть другие клетки, которые наверняка с ДНК. Правда ж?

[identity profile] ddodo.livejournal.com 2007-07-03 05:31 pm (UTC)(link)
Там лейкоцитов хватает. Кровь берут, это проще всего.
Я когда анализ крови сдаю, беру с собой пару пробирок. "А теперь мне вот сюда нацедите, пожалуйста". Лицо лаборанта представь? Вот только ради этого уже можно. :)) Внутривенно колоть я сама не умею. А случалось по-быстрому из пальца кубик-два. Для особо любимых коллег, на отрицательнный контроль. :))

Мышам хвосты режут, кролям уши.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:35 pm (UTC)(link)
Ты меня успокоила! Тогда скажи, что мазок изо рта для типирования так это того... для ПЦРа, достаточно, да? Они ж наверное даже скорее всего просто клетки лизируют и ПЦРят маркерными праймерами.

[identity profile] ddodo.livejournal.com 2007-07-03 06:06 pm (UTC)(link)
Достаточно. Не только изо рта. :))))

Ну да, чаще всего лизируют и на ДНК сорбент сажают. Потом промыть и снять с сорбента. И то все больше экспресс-методов, без промывки.

[identity profile] ddodo.livejournal.com 2007-07-03 06:07 pm (UTC)(link)
Кровь - это когда надо много и вдумчиво. Под сиквенс, скажем, для определения мутаций.

[identity profile] 0lenka.livejournal.com 2007-07-03 05:36 pm (UTC)(link)
А я, честно говоря, тоже не сильно в курсе, но, если по логике - то соскоба эпителия должно хватать :) ваткой за щеку и до свидания. Если, конечно, в утреннем анамнезе не было орального секса. А то такие результаты будут...

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:39 pm (UTC)(link)
Там и до митохондриальной евы и рукой подать.

[identity profile] kotyhoroshko.livejournal.com 2007-07-03 05:27 pm (UTC)(link)
вже хочу стати мікробіологом

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-03 05:36 pm (UTC)(link)
Так, Макс. Я б оце тебе послала б зараз читать все спочатку, але я збираюсь переписати дещо більш доступно. Так що поки що не читай. Але запам"ятай. Не мікробіологом! А молекулярним біологом!

[identity profile] kotyhoroshko.livejournal.com 2007-07-03 05:52 pm (UTC)(link)
так ті молекули такі мікроскопічні! значить мікробіолог :))

[identity profile] 1inuxoid.livejournal.com 2007-07-05 08:47 am (UTC)(link)
нанобіологом? :)

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-05 08:51 am (UTC)(link)
кстаті, ми скоро будемо тут віртуально міряти ДНК приладом "нанодроп"

[identity profile] 1inuxoid.livejournal.com 2007-07-05 09:04 am (UTC)(link)
нанокрапля? цікаво

[identity profile] drunk-sincerely.livejournal.com 2007-09-04 08:30 am (UTC)(link)
перепрошую, а це часом не Mosquito 4b вiд Labtech?

[identity profile] drunk-sincerely.livejournal.com 2007-09-05 11:50 am (UTC)(link)
маю на увазi прилад..

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-09-05 11:56 am (UTC)(link)
чесно не знаю. не дивилась. треба буде глянути

[identity profile] ldoroshe.livejournal.com 2007-07-03 06:30 pm (UTC)(link)
я колись таке робив, але ДНК було зовсім трошечки.

[identity profile] progenes.livejournal.com 2007-07-05 08:54 am (UTC)(link)
нічого, досягається тренуванням.

[identity profile] zloradskij.livejournal.com 2009-10-11 04:19 am (UTC)(link)
красно дякую, дуже цiкаво!

[identity profile] elenachernakova.livejournal.com 2013-06-01 05:19 pm (UTC)(link)
хотелось бы картинки :( не показывает