![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesНаучились, наконец, редактировать геномы в конкретном месте, причем в соматических клетках. Инструмент для текстовых правок называется TALEN (запомните это слово).
Мне один раз уже удалось накалякать твиттеропригодный пост. Повторим подвиг. Итак, ученые придумали инструмент, с помощью которого можно влезть в геном в нужное место, подкрутить там колесики и вылезти из геном обратно вместе с инструментами. При этом в новом организме следов вмешательства, кроме как подкрученного нуклеотидика, не остается. При желании можно нужный ген в конкретном месте поломать, починить, включить-выключить или встроить свои инициалы. Новая мутация от обычной случайной будет неотличима.
Есть такой белок. Называется transcription activator-like effectors (TALE).Этот белочек секретирует бактерия Xanthomonas с целью проникнуть в ядро растительной клетки и включить там нужные для бактерии растительные гены. Особенность этого TALE в его способности распознавать геномные последовательности и с ними связываться. Причем посредине этого белка есть вариабельная аминокислотная последовательность, которая может распознавать разные нуклеотидные участки. И в этом есть определенная закономерность - TAL-код, который недавно взломали . (Сейчас посмотрела, что это была Ула Бонас. Ого!) И оказалось, что конкретная аминокислотная комбинация распознает конкретные нуклеотиды и это можно предсказывать и конструировать.
Теперь к этой липучке приделали ножницы-нуклеазу N, которые режут в том самом месте, где приклеился указатель. Получился такой приборчик два в одном TALEN. После того, как сделан надрез, репаративные системы клетки немедленно попробуют его заделать. Этим можно воспользоваться и сыпнуть к месту разреза нужных нуклеотидов (авось, реперативные системы ошибутся и не то встроят), небольших олигонуклеотидов, которые тоже туда встраиваются или разрезать в двух неподалеку, а при репарации этот маленький кусок просто вылетит. ВОт так.
Раньше, вместо transcription activator-like effectors пробовали использовать липкие цинковые пальцы. Но у них ниже специфичность и сложнее сконструировать. А со взломкой TAL-кода открылись широкие возможности в применении. Причем эти ножницы можно тупо впрыскивать в яйцеклетку или даже в эмбрион и проводить genome editing in vivo с весьма впечатляющей эффективностью.
То есть вы берете тупо любой ген, копируете вот в это окно или сюда, и вам выдают специфическую последовательность ножниц. После чего заказываете синтетическую молекулу ножниц (да-да, по интернету) и приступаете к редакторским правкам.
Хоть я еще думаю, что публикуют только то, что получилось, а что там не получилось и в чем особенности метода будет видно попозже. Но уже сейчас это означает окончательный приход совершенно новой эры в биотехнологию растений и животных. С новыми рисками и с новыми возможностями. Ого-го-го!!!
Мне один раз уже удалось накалякать твиттеропригодный пост. Повторим подвиг. Итак, ученые придумали инструмент, с помощью которого можно влезть в геном в нужное место, подкрутить там колесики и вылезти из геном обратно вместе с инструментами. При этом в новом организме следов вмешательства, кроме как подкрученного нуклеотидика, не остается. При желании можно нужный ген в конкретном месте поломать, починить, включить-выключить или встроить свои инициалы. Новая мутация от обычной случайной будет неотличима.
Есть такой белок. Называется transcription activator-like effectors (TALE).Этот белочек секретирует бактерия Xanthomonas с целью проникнуть в ядро растительной клетки и включить там нужные для бактерии растительные гены. Особенность этого TALE в его способности распознавать геномные последовательности и с ними связываться. Причем посредине этого белка есть вариабельная аминокислотная последовательность, которая может распознавать разные нуклеотидные участки. И в этом есть определенная закономерность - TAL-код, который недавно взломали . (Сейчас посмотрела, что это была Ула Бонас. Ого!) И оказалось, что конкретная аминокислотная комбинация распознает конкретные нуклеотиды и это можно предсказывать и конструировать.
Теперь к этой липучке приделали ножницы-нуклеазу N, которые режут в том самом месте, где приклеился указатель. Получился такой приборчик два в одном TALEN. После того, как сделан надрез, репаративные системы клетки немедленно попробуют его заделать. Этим можно воспользоваться и сыпнуть к месту разреза нужных нуклеотидов (авось, реперативные системы ошибутся и не то встроят), небольших олигонуклеотидов, которые тоже туда встраиваются или разрезать в двух неподалеку, а при репарации этот маленький кусок просто вылетит. ВОт так.
Раньше, вместо transcription activator-like effectors пробовали использовать липкие цинковые пальцы. Но у них ниже специфичность и сложнее сконструировать. А со взломкой TAL-кода открылись широкие возможности в применении. Причем эти ножницы можно тупо впрыскивать в яйцеклетку или даже в эмбрион и проводить genome editing in vivo с весьма впечатляющей эффективностью.
То есть вы берете тупо любой ген, копируете вот в это окно или сюда, и вам выдают специфическую последовательность ножниц. После чего заказываете синтетическую молекулу ножниц (да-да, по интернету) и приступаете к редакторским правкам.
Хоть я еще думаю, что публикуют только то, что получилось, а что там не получилось и в чем особенности метода будет видно попозже. Но уже сейчас это означает окончательный приход совершенно новой эры в биотехнологию растений и животных. С новыми рисками и с новыми возможностями. Ого-го-го!!!
Tags:
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2012-10-09 11:33 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:34 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:38 am (UTC)Интересно, когда организм без транспозон сделают?
no subject
Date: 2012-10-09 11:40 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:40 am (UTC)А то ведь раньше скорее как слон в посудной лавке.
no subject
Date: 2012-10-09 11:41 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:42 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:43 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:44 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:46 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:46 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:47 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:48 am (UTC)Он откроет дорогу мелким ГМО-компаниям, аналогичным софтверным.
Мне заранее страшно. Как программер со стажем могу себе представить ЧТО из лучших побуждений будут сотворять полуграмотные
кодерыгенные инженеры после 2-3-х дней аврала.(А при бурном росте грамотных на всех не напасёшся)
Про то что будут пытаться сотворить из не самых лучших побуждений вообще лучше молчать.
С другой стороны -- при должном разуме и контроле -- будут получше и растения и животные в сельском хозяйстве. Исчезнут заморочки типа "Высокопродуктивные свиньи/утки/индейки заточены под соевый шрот, ваш подсолнечный жмых они жрать не будут." Теперь -- будут.
no subject
Date: 2012-10-09 11:49 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:54 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:54 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:56 am (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 11:56 am (UTC)- мы то до коммунизма не доживём. А вот дети...
- да, детей жалко.
no subject
Date: 2012-10-09 11:57 am (UTC)По логике перепрошьет часть клеток только.
no subject
Date: 2012-10-09 12:01 pm (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 12:03 pm (UTC)Так что, радио будет, а счастья - как обычно... :-)
no subject
Date: 2012-10-09 12:03 pm (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 12:04 pm (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 12:06 pm (UTC)no subject
Date: 2012-10-09 12:06 pm (UTC)