Сильно

Mar. 9th, 2011 11:12 am
progenes: (Default)
[personal profile] progenes
Получила результаты экспрессионного анализа, секвенирование РНК по методу 454. 48 проб. На выходе увесистый ZIP, в распакованом виде около 300 гигов (но я все еще не распаковала), а это уже около 2000 (2 тыщ) штук разнообразных файлов, преимущественно Excel, которые при открытии весело сообщают, что ячейки в таблице закончились.

readmy доброжелательно гласит:
The probability of gene A expressed equally between two samples can be calculated with the following formula:

2x(1-p(i|x))

(if p(i|x)>0.5)

p(i|x)=(N2/N1)y*(x+y)!/x!y!(1+N2/N1) (x+y+1)

НЕРВНО РЖУ. Даже если открывать файлы, чтобы посмотреть, что там в них внутри, не вникая в содержание, то по минуте на каждый файл - это чистых 4 дня рабочего времени. И это только глянуть мельком! Мне кажется, биоинформатика уже укусила себя за хвост.

Пысы. А у нового Excel есть ограничение по количеству ячеек в таблицах? И о чем эта формула вообще? УМОРА! Я вот даже еще совершенно не огорчилась, я просто ошарашена. Моя задача - это все ПЕРЕСЧИТАТЬ! Пойду лучше горох подготовлю на высадку.

Date: 2011-03-09 10:31 am (UTC)
From: [identity profile] giggster.livejournal.com
а я б прі відє такої формули, пішов би наївся б гороху і плюнув на все. раптом сама порахується.

Date: 2011-03-09 10:46 am (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
та от да. я втомилась, поки її набрала.

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Dec. 29th, 2025 08:02 pm
Powered by Dreamwidth Studios