Сильно

[progenes]

Получила результаты экспрессионного анализа, секвенирование РНК по методу 454. 48 проб. На выходе увесистый ZIP, в распакованом виде около 300 гигов (но я все еще не распаковала), а это уже около 2000 (2 тыщ) штук разнообразных файлов, преимущественно Excel, которые при открытии весело сообщают, что ячейки в таблице закончились.

readmy доброжелательно гласит:
The probability of gene A expressed equally between two samples can be calculated with the following formula:

2x(1-∑p(i|x))

(if ∑p(i|x)>0.5)

p(i|x)=(N2/N1)^y*(x+y)!/x!y!(1+N2/N1) ^(x+y+1)

НЕРВНО РЖУ. Даже если открывать файлы, чтобы посмотреть, что там в них внутри, не вникая в содержание, то по минуте на каждый файл - это чистых 4 дня рабочего времени. И это только глянуть мельком! Мне кажется, биоинформатика уже укусила себя за хвост.

Пысы. А у нового Excel есть ограничение по количеству ячеек в таблицах? И о чем эта формула вообще? УМОРА! Я вот даже еще совершенно не огорчилась, я просто ошарашена. Моя задача - это все ПЕРЕСЧИТАТЬ! Пойду лучше горох подготовлю на высадку.

Comments

[bulochnikov.livejournal.com]

=Excel есть ограничение по количеству ячеек в таблицах?=

У Екселя 2008 и 2010 нет. Но у всех 32х битных Экселей есть ограничение по использованию памяти. Примерно в 2 гигабайта. Если переполнить, начинает ругаться и виснет.
У 64х битного Екселя 2010 никаких ограничений нет. Но для его установки надо 64хбитную Винду и соответственно 64х битный комп.
И ещё: Оффис или весь 64х битный или весь 32х битный. Совместить 32х битный Ворд и 64х битный Эксель не получится.

[progenes.livejournal.com]

Во! Вот спасибо! Информация важная и исчерпывающая.

[bulochnikov.livejournal.com]

Не совсем.
Забыл сказать, что ограничения всё же есть:
Строк не более 1600000 а столбцов что то около 16000 (или больше? Точно не помню). Но столько вы никогда не заполните. Тем более через клавиатуру. Так что можно считать, что ограничений нет.

[progenes.livejournal.com]

Уже поставила 2007й. Открывает без проблем.

[slipa-ol.livejournal.com]

починаючи з Excel 2007 робочий лист має 1 048 576 рядків і 16 384 стовбця (більше 17 міліардів клітинок). в 2003 було 65536 і 256 відповідно.

[drug123.livejournal.com]

Парочка исправлений:
- 2008 Экселя не существует, есть 2007. В нем, как и в 2010, количество строк ограничено числом 2³².
- Понятия "64-битный комп" не существует. Не вдаваясь в детали - любой совремненный (не старше 5 лет) компьютер гарантировано подойдет.

[drug123.livejournal.com]

Прошу прощения, под действием температуры перепутал грешное с праведным (адресацию памяти и ячеек). Чуть выше правильно подсказали: The number of rows is now 1,048,576 and columns is 16,384.