Всматриваюсь в бездну транскриптом расповых эмбрионов с разными условиями культивирования. Вижу, одна супероксид дисмутаза зарепрессировалась, другая наоборот, активировалась. Решила узнать, в чем соль. Ищу что-то про Cu-Zn Superoxide Dismutase. Нахожу. Ноты. И музыку.
In the music, the 153 amino acid sequence of the protein is played through 3 times. The first read-through is a duet between oboe and flute, playing the more polar (water-soluble) and nonpolar (water-insoluble) amino acids respectively. In the second repetition of the sequence, other instruments represent the regions of secondary structure: trumpets for the beta strands, chimes for alpha helix, and tubular bells for the turns... This second voice is an allusion to the dimeric form of the active enzyme.
Гобой и флейта, труба и арфа, alpha helix и beta strand. Угу. Там много такого.
И еще бонус. Недавно случайно наткнулась - продукт косметиЦкий с особенно широким спектром кислотности. Для эффективного удаления эпидермиса, шо ли?

In the music, the 153 amino acid sequence of the protein is played through 3 times. The first read-through is a duet between oboe and flute, playing the more polar (water-soluble) and nonpolar (water-insoluble) amino acids respectively. In the second repetition of the sequence, other instruments represent the regions of secondary structure: trumpets for the beta strands, chimes for alpha helix, and tubular bells for the turns... This second voice is an allusion to the dimeric form of the active enzyme.
Гобой и флейта, труба и арфа, alpha helix и beta strand. Угу. Там много такого.
И еще бонус. Недавно случайно наткнулась - продукт косметиЦкий с особенно широким спектром кислотности. Для эффективного удаления эпидермиса, шо ли?

Tags:
no subject
Date: 2011-10-18 12:58 pm (UTC)no subject
Date: 2011-10-18 01:09 pm (UTC)Употреблять при температуре от -500 до 500 С
Date: 2011-10-18 02:39 pm (UTC)Re: Употреблять при температуре от -500 до 500 С
Date: 2011-10-19 07:22 am (UTC)вовнутрь!
no subject
Date: 2011-10-18 01:11 pm (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 07:22 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-18 02:32 pm (UTC)рН какой кому пропишут, гля на этикетку - есть такой, попадает в интервал.
no subject
Date: 2011-10-18 04:29 pm (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 07:28 am (UTC)no subject
no subject
Date: 2011-10-19 07:31 am (UTC)Спасибо, прикольно!
Date: 2011-10-18 05:04 pm (UTC)http://ru.wikipedia.org/wiki/Миссия_на_Марс
Re: Спасибо, прикольно!
Date: 2011-10-19 07:26 am (UTC)Re: Спасибо, прикольно!
Date: 2011-10-19 10:13 am (UTC)Пъ.Съ. А вообще при просмотре всю дорогу не оставляло ощущение, что это голливудизация советских НФ-рОманов Мартынова ("Фаэтонцы", из трилогии "Звездоплаватели") и Владко ("Аргонавти Всесвіту") - всё такое знакоменькое-знакоменькое...
no subject
Date: 2011-10-18 05:43 pm (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 07:27 am (UTC):-)
Date: 2011-10-18 06:19 pm (UTC)Про лосьон прочитала на их сайте. Сильно впечатлилась - он от всего и сразу защищает. Бум брать!
Re: :-)
Date: 2011-10-19 07:24 am (UTC)за Музыку
Date: 2011-10-18 07:30 pm (UTC)Она меня тогда тоже порадовала, вот краткое содержание:
Conversion of amino-acid sequence in proteins to classical music
Что сделали авторы этой работы :.
Расположили аминокислоты в ряд по изменению гидрофобности. Первой присвоили ДО октавой ниже среднего ДО на пианино, и каждая следующая а/к-та - следующая нота вверх. Получили 20-ти нотный натуральный звукоряд, охватывающий 2,5 октавы. В музыке, полученной из последовательности Human thymidylate synthase A (ThyA) по этому правилу, по мнению авторов, оказались слишком велики скачки между некоторыми нотами. Они встречаются нерегулярно, что не дает возможность услышать связную мелодию.
Мелодия http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2007-8-5-405-s1.mp3
Тогда некоторые аминокислоты объединили (например, Tyr-Phe,Val-Ala, Thr-Ser, и др) и присвоили паре одну ноту. Получили 13-ти нотный звукоряд. Каждой нотной ступени присвоили аккорд (натуральное трезвучие), построенный на этой ступени. Аккорды аминокислот внутри пары отличаются тем, что одна звучит, как основное трезвучие, а вторая - как его первое обращение.
Мелодия http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2007-8-5-405-s2.mp3
Затем авторы задумались о разных длительностях аккордов, которые до этого звучали как четверти. Длительность аккорда данной аминокислоты поставили в зависимость от частоты использования её кодона в человеке. Диапазон встречаемости кодонов разделили на четыре части. Чем выше частота, тем длиннее звучание - от 1/8 до целой.
Мелодия http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2007-8-5-405-s3.mp3
Вполне удовлетворённые услышанным, авторы "озвучили" Huntingtin protein человека. В нём есть участок из 21 глутамина и пролин-богатый участок, каковые прекрасно различаются в представляющей этот белок музыке. В связи с этим, видимо, авторы предполагают, что "озвучивание" последовательностей поможет в работе учёным с ослабленным зрением. (Я заплакал.)
Мелодия http://genomebiology.com/content/supplementary/gb-2007-8-5-405-s4.mp3
В дальнейшем авторы планируют присвоить функционально разным последовательностям генома звучание разных инструментов. Различие в звучании предлагается использовать при знакомстве обучающихся с функциями частей генома.
В целом, считают авторы, каждый белок дает свою музыкальную тему, импровизировать на которую можно как за фортепиано, так и на рабочем месте, при изменении свойств белка.
--------------------------------------------------------------------------------
В общем (заплакав) я понял, что исследователи, способные к синестетическому восприятию (например, цветной слух, цветное зрение и и др), вероятно, оценят новые возможности исследования и изменения свойств белков. Также развитие этого направления может привлечь в молекулярную биологию музыкантов, композиторов, теоретиков музыки, что поможет ей совершить новый скачок в развитии, как ранее случилось после прихода физиков.
Теперь пришло время лириков!!!!
Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 07:07 am (UTC)А так же присвоить каждой градации серого соответствующую аминокислоту и перевести портрет Эйнштейна в их последовательность, получившуюся последовательность перекодировать в ДНК. Цифрам 0...9 поставить в соответствие аминокислоты и выразить число Пи в виде последовательности аминокислот, синтезировать этот белок ....и много чего еще можно предложить неугомонным исследователям.
Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 07:21 am (UTC)Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 10:56 am (UTC)Но сама идея озвучит геном веселая, фантазия внутре забурлила. Вот геном Amoeba dubia длиной
670,000,000,000 это уже не шлягер, на оперу тянет. Думаю где то кто то ищет и скрытые послания в геноме, что то такое попадалось читать. Вы, думаю, по молодости не в курсе, но было время 0,25 литра водки Столичной стоило 1,49 и 0,5 литра Московской 2,87. Оказалось: рупь 49 в степени 2,87 = 3,14 Скушно водку просто пить....
Вращение планет Солнечной системы переложеное на музыку из той же оперы
http://www.informationisbeautiful.net/2010/the-solar-system-music-boox/
Есть еще Гарик Исраелян, работает в Институте астрофизики на Канарских островах.
"Идея появилась год назад, и началось все, конечно же, с научных изысканий. Исраелян занимался исследованием акустических волн в атмосферах звезд.....звезды играют свою «музыку» в другом акустическом диапазоне – на 20-30 октав ниже диапазона пианино. Для того, чтобы ее услышать, надо лишь сместить ее в доступный человеческому уху акустический диапазон, но волновая формула звука при этом не меняется. Вот вам и связь музыки и астрофизики."
Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 07:25 am (UTC)Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 07:58 am (UTC)А если это Вы о работах по озвучиванию сиквенсов - то какой уж тут размах. Всего две статьи :-).
Re: за Музыку
Date: 2011-10-19 07:59 am (UTC)Re: за Музыку
Date: 2011-10-29 05:08 am (UTC)Re: за Музыку
Date: 2011-10-29 11:05 am (UTC)И ещё раз спасибо progenes за инфу.
Re: за Музыку
Date: 2011-10-29 03:58 pm (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 05:48 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 07:32 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-19 07:34 am (UTC)Идея озвучить ген (я ведь правильно понимаю, что именно они там озвучили?) - очень понравилась своей оригинальностью. Никогда б даже не подумал, что такое может быть. :)))
Re: своей огригинальностью
Date: 2011-10-19 10:17 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-20 11:23 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-29 09:08 pm (UTC)no subject
Date: 2011-11-01 08:52 am (UTC)no subject
Date: 2011-11-05 12:34 pm (UTC)