Фигасе. Вот это и я, понимаю, биоинформатики.

[progenes]

Next-Generation Digital Information Storage in DNA

ДНК кодирует 2 бита на нуклеотид или 455 триллиона битов на грамм (16х10²⁰ нуклеотидов. Для сравнения геном человека3,27х10⁹ нуклеотидов длиной) , не ограничена плоским слоем и может все еще читаться тысячелетие спустя, несмотря на деградацию при хранении в неидеальных условиях. Первые попытки сохранять информацию в ДНК были предприняты в 1988 году. Тогда удалось закодировать 7920 битов. Теперь вот новый подход. В этой работе взяли html драфт книжки на 53425 слов, 11 джпегов и 1 джава-скрипт (простите, лень переключать раскладку) и закодировали это все в 54898 штук коротких нуклеотидных кусков, в каждом по 96 битов. Затем это все распечатали на струйном принтере. Нет, ну серьезно. Ну хорошо, почти серьезно. Биочипы делаются по принципу струйных принтеров. Ну как вам это объяснить? Ладно, в следующий раз объясню, как работает Illumina HiSeq. Короче, это все потом обратно прочитали, сложили и раскодировали книжку с картинками.
В отличии от попытки 1988 года, эти авторы закодировали не два, а один бит на нуклеотид: аденин и цитозин - 0, а гуанин или тимин - 1.
В общем у них получилась плотность 5.5 petabits/mm³ at 100x synthetic coverage. По приблизительным подсчетам содержимое интернета помещается на пластинке размером с ноготь на мизинце, а всю информацию, которая есть на Земле, можно закодировать в 4 гр ДНК.

Хороших вам выходных!

Comments

[v-s-c.livejournal.com]

Ну и какова скорость записи/чтения?

Я к тому, что ДНКу приплели, как мне кажется, для красоты. Можно было просто отдельные атомы переставлять, как 10-20 лет назад. И плотность была бы больше. ,-)

[kirrr.livejournal.com]

плотность это конечно хорошо, а какая скорость записи/считывания информации при таком спосбе?

[progenes.livejournal.com]

Скорость записи-чтения пока не очень, но скорость растет, а цена считки неумолимо падает. Для архивирования и сохранения в вечной мерзлоте сойдет.

[progenes.livejournal.com]

Density, stability, and energy efficiency are all potential advantages of DNA storage, while costs and times for writing and reading are currently impractical for all but century-scale archives. However, the cost of DNA synthesis and sequencing have been dropping at exponential rates of 5- and 12-fold per year, respectively – much faster than electronic media at 1.6-fold per year.

[v-s-c.livejournal.com]

Посмотрим, как она будет расти, скорость чтения (ну и записи).

[staerum.livejournal.com]

Хо-хо, у нас уже накопилось на целый ноготок информации. Неплохо.

[mnement.livejournal.com]

Хочется почитать полностью статейку, только доступа нет:(

[progenes.livejournal.com]

http://sci-hub.org/

[mnement.livejournal.com]

спасибо, не знал такой штуки

[kirrr.livejournal.com]

понятно, что это медленный способ, но сколько именно времени занимает кодирование и секвенирование одной книжки?

[paracloud.livejournal.com]

Вопрос даже не в скорости чтения (записи), сколько в скорости поиска.
Доступ не произвольный - записать и считать можно только всё сразу, все эти петабиты.

[v-s-c.livejournal.com]

Честно говоря, я это и имел в виду. ;-)

[gegmopo4.livejournal.com]

Напомнило анекдот: «С какой скоростью печатаете? — 500 знаков в минуту! Но такая фигня получается…»

Кроме скорости, есть ещё такая штука, как надёжность. Какая вероятность, что ни один, самый маленький, битик информации не потеряется через пару лет?

[baron6011.livejournal.com]

Впечатляет!

[rempel.livejournal.com]

Это еще в стар-треке было:
один умный шпион кодировал информацию с человеческих компьютеров ДНК, а потом вкалывал ее ничего не подозревающим посторонним, которые летели на его шпионскую планету по своим делам. :))

[rempel.livejournal.com]

это лечится повторением одной и той же информации многократно, и сравнением ее с другими копиями в процессе хранения

[rempel.livejournal.com]

а какая разница? Можно же кодировать одновременно разные куски, и читать одновременно с многих копий. Т.е. вопрос в количестве секвенаторов.

[rempel.livejournal.com]

можно читать начиная с любого места. Или с многих мест одновременно, на разных читалках, с разный копий. Копий-то можно сделать сколько хочешь.

[gegmopo4.livejournal.com]

Ничто не выдавало геномодифицированного курьера — ни лиловый цвет кожи, ни шипастый гребень, ни волочащийся трёхметровый хвост.

[vitus_wagner]

Ну, надо будет потом приделать туда еще немножко ДНК, чтобы оно ещё и размножалось.

[2hard4u.livejournal.com]

Боюсь кто-то уже придумал это четыре миллиарда лет назад.

[pessimister.livejournal.com]

> геном человека3,27х10^9 нуклеотидов длиной
Получается, что человека можно сохранить на жесткий диск, а затем, как вы говорите, "распечатать на струйном принтере"?

[gul-kiev.livejournal.com]

> всю информацию, которая есть на Земле, можно закодировать в 4 гр ДНК

Информация, которая содержится в ДНК, включена в множество всей информации, которая есть на Земле? ;-)

[zloradskij.livejournal.com]

Человеческий геном состоит из 3 120 000 000 комплементарных пар, и половина из этого находится в сперматозоиде - 1 560 000 000.
Каждая пара или аденин-тиминовая, или гуанин-цитозиновая, а также они могут быть направлены в одном из двух направлений, так что есть 4 возможных значения, или 2 бита.
В статьях что я читал количество сперматозоидов, выделяющихся при эякуляции человека, изменялось от 50 до 500 миллионов. Я буду использовать число 200 000 000 для расчетов.
Мужской оргазм в среднем длится 5 секунд.
Суммируя все вышесказанное, мы получаем 1.560*10^9 * 2.000*10^8 * 2 бита, то есть 78 000 терабайт данных.
Я не знаю с какой скоростью грузовики из Одессы возили диски, но когда я кончаю, я передаю информацию со скоростью 15 600 тб/сек.
http://bash.im/quote/393532

[gegmopo4.livejournal.com]

Ну вот если повторить, то и чудеса миниатюризации исчезают. Плотность информации становится сравнимой с записанной небиологическим способом.