[personal profile] progenes
Next-Generation Digital Information Storage in DNA

ДНК кодирует 2 бита на нуклеотид или 455 триллиона битов на грамм (16х1020 нуклеотидов. Для сравнения геном человека3,27х109 нуклеотидов длиной) , не ограничена плоским слоем и может все еще читаться тысячелетие спустя, несмотря на деградацию при хранении в неидеальных условиях. Первые попытки сохранять информацию в ДНК были предприняты в 1988 году. Тогда удалось закодировать 7920 битов. Теперь вот новый подход. В этой работе взяли html драфт книжки на 53425 слов, 11 джпегов и 1 джава-скрипт (простите, лень переключать раскладку) и закодировали это все в 54898 штук коротких нуклеотидных кусков, в каждом по 96 битов. Затем это все распечатали на струйном принтере. Нет, ну серьезно. Ну хорошо, почти серьезно. Биочипы делаются по принципу струйных принтеров. Ну как вам это объяснить? Ладно, в следующий раз объясню, как работает Illumina HiSeq. Короче, это все потом обратно прочитали, сложили и раскодировали книжку с картинками.
В отличии от попытки 1988 года, эти авторы закодировали не два, а один бит на нуклеотид: аденин и цитозин - 0, а гуанин или тимин - 1.
В общем у них получилась плотность 5.5 petabits/mm3 at 100x synthetic coverage. По приблизительным подсчетам содержимое интернета помещается на пластинке размером с ноготь на мизинце, а всю информацию, которая есть на Земле, можно закодировать в 4 гр ДНК.

Хороших вам выходных!

Date: 2012-09-14 01:31 pm (UTC)
From: [identity profile] v-s-c.livejournal.com
Ну и какова скорость записи/чтения?

Я к тому, что ДНКу приплели, как мне кажется, для красоты. Можно было просто отдельные атомы переставлять, как 10-20 лет назад. И плотность была бы больше. ,-)

Date: 2012-09-14 01:34 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Скорость записи-чтения пока не очень, но скорость растет, а цена считки неумолимо падает. Для архивирования и сохранения в вечной мерзлоте сойдет.

(no subject)

From: [identity profile] v-s-c.livejournal.com - Date: 2012-09-14 01:36 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] paracloud.livejournal.com - Date: 2012-09-14 02:17 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] v-s-c.livejournal.com - Date: 2012-09-14 02:23 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] rempel.livejournal.com - Date: 2012-09-14 02:31 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] paracloud.livejournal.com - Date: 2012-09-14 05:45 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:54 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] alexeymitin.livejournal.com - Date: 2012-09-14 05:40 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-15 04:18 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 02:34 pm (UTC)
vitus_wagner: My photo 2005 (white)
From: [personal profile] vitus_wagner
Ну, надо будет потом приделать туда еще немножко ДНК, чтобы оно ещё и размножалось.

(no subject)

From: [identity profile] 2hard4u.livejournal.com - Date: 2012-09-14 03:23 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:19 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] 2hard4u.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:22 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:27 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-15 04:27 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-15 09:17 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] alef-grizley.livejournal.com - Date: 2012-09-15 07:08 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-15 09:18 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] alef-grizley.livejournal.com - Date: 2012-09-15 10:21 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-16 08:36 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-16 09:31 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-16 10:25 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-17 06:43 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-22 01:55 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] saruyoshi.livejournal.com - Date: 2012-09-22 04:14 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] pharmazevt.livejournal.com - Date: 2012-09-16 08:33 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] alef-grizley.livejournal.com - Date: 2012-09-17 05:12 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com - Date: 2012-09-14 10:51 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com - Date: 2012-09-14 04:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:55 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] toman-k.livejournal.com - Date: 2012-09-15 03:53 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com - Date: 2012-09-14 10:54 pm (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 01:33 pm (UTC)
From: [identity profile] kirrr.livejournal.com
плотность это конечно хорошо, а какая скорость записи/считывания информации при таком спосбе?

Date: 2012-09-14 01:36 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Density, stability, and energy efficiency are all potential advantages of DNA storage, while costs and times for writing and reading are currently impractical for all but century-scale archives. However, the cost of DNA synthesis and sequencing have been dropping at exponential rates of 5- and 12-fold per year, respectively – much faster than electronic media at 1.6-fold per year.

(no subject)

From: [identity profile] kirrr.livejournal.com - Date: 2012-09-14 01:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] rempel.livejournal.com - Date: 2012-09-14 02:30 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] toman-k.livejournal.com - Date: 2012-09-15 03:56 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 01:37 pm (UTC)
From: [identity profile] staerum.livejournal.com
Хо-хо, у нас уже накопилось на целый ноготок информации. Неплохо.

Date: 2012-09-14 01:37 pm (UTC)
From: [identity profile] mnement.livejournal.com
Хочется почитать полностью статейку, только доступа нет:(

Date: 2012-09-14 02:24 pm (UTC)
ext_605364: geg MOPO4 (geg_MOPO4)
From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com
Напомнило анекдот: «С какой скоростью печатаете? — 500 знаков в минуту! Но такая фигня получается…»

Кроме скорости, есть ещё такая штука, как надёжность. Какая вероятность, что ни один, самый маленький, битик информации не потеряется через пару лет?

Date: 2012-09-14 02:29 pm (UTC)
From: [identity profile] rempel.livejournal.com
это лечится повторением одной и той же информации многократно, и сравнением ее с другими копиями в процессе хранения

(no subject)

From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com - Date: 2012-09-14 04:53 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:53 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com - Date: 2012-09-15 07:53 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-15 08:06 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com - Date: 2012-09-15 03:12 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] sabotagecat.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:21 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] toman-k.livejournal.com - Date: 2012-09-15 04:09 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 02:26 pm (UTC)
From: [identity profile] baron6011.livejournal.com
Впечатляет!

Date: 2012-09-14 02:28 pm (UTC)
From: [identity profile] rempel.livejournal.com
Это еще в стар-треке было:
один умный шпион кодировал информацию с человеческих компьютеров ДНК, а потом вкалывал ее ничего не подозревающим посторонним, которые летели на его шпионскую планету по своим делам. :))

Date: 2012-09-14 02:32 pm (UTC)
ext_605364: geg MOPO4 (geg_MOPO4)
From: [identity profile] gegmopo4.livejournal.com
Ничто не выдавало геномодифицированного курьера — ни лиловый цвет кожи, ни шипастый гребень, ни волочащийся трёхметровый хвост.
Edited Date: 2012-09-14 02:37 pm (UTC)

(no subject)

From: [identity profile] oldodik.livejournal.com - Date: 2012-09-14 05:19 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] rempel.livejournal.com - Date: 2012-09-14 08:07 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] oldodik.livejournal.com - Date: 2012-09-15 12:02 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:57 pm (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 03:29 pm (UTC)
From: [identity profile] pessimister.livejournal.com
> геном человека3,27х10^9 нуклеотидов длиной
Получается, что человека можно сохранить на жесткий диск, а затем, как вы говорите, "распечатать на струйном принтере"?

Date: 2012-09-14 10:59 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
я не совсем понимаю, какой "струйный принтер" имеется в виду, но я уже один такой я ношу с собой.
готов распечатать человека совершенно безвозмездно, благо картриджа хватает тысяч на 700 копий...

(no subject)

From: [identity profile] neograff.livejournal.com - Date: 2012-09-15 01:38 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 03:32 pm (UTC)
From: [identity profile] gul-kiev.livejournal.com
> всю информацию, которая есть на Земле, можно закодировать в 4 гр ДНК

Информация, которая содержится в ДНК, включена в множество всей информации, которая есть на Земле? ;-)

Date: 2012-09-14 07:14 pm (UTC)
From: [identity profile] cass1an.livejournal.com
А сколько суммарная масса той ДНК в человеке? Ну получится полкило максимум по планете...

(no subject)

From: [identity profile] cikavo.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:16 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] tbapb-xl.livejournal.com - Date: 2012-09-14 09:32 pm (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 04:11 pm (UTC)
From: [identity profile] zloradskij.livejournal.com
Человеческий геном состоит из 3 120 000 000 комплементарных пар, и половина из этого находится в сперматозоиде - 1 560 000 000.
Каждая пара или аденин-тиминовая, или гуанин-цитозиновая, а также они могут быть направлены в одном из двух направлений, так что есть 4 возможных значения, или 2 бита.
В статьях что я читал количество сперматозоидов, выделяющихся при эякуляции человека, изменялось от 50 до 500 миллионов. Я буду использовать число 200 000 000 для расчетов.
Мужской оргазм в среднем длится 5 секунд.
Суммируя все вышесказанное, мы получаем 1.560*10^9 * 2.000*10^8 * 2 бита, то есть 78 000 терабайт данных.
Я не знаю с какой скоростью грузовики из Одессы возили диски, но когда я кончаю, я передаю информацию со скоростью 15 600 тб/сек.
http://bash.im/quote/393532

Date: 2012-09-14 05:41 pm (UTC)
From: [identity profile] snysmymrik.livejournal.com
С максимальной скорость информацию передаёт Юсэйн Болт. Как он разгоняет своё ДНК, а?

(no subject)

From: [identity profile] cass1an.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:15 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] snysmymrik.livejournal.com - Date: 2012-09-19 07:38 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] progenes.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] toman-k.livejournal.com - Date: 2012-09-15 04:23 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 05:43 pm (UTC)
From: [identity profile] stzozo.livejournal.com
Научиться только быстро записывать, быстро считывать и удобно хранить.

А еще лучше - компьютер из молекулярных нитей.
Я в школе такой изобретал.

Date: 2012-09-14 06:09 pm (UTC)
From: [identity profile] nashev.livejournal.com
Наверняка пятый стих Евгения Онегина в переводе на кхмерский, будучи записан в UTF-21 и сохранён в ДНК, кодирует гемоглобин.

Date: 2012-09-14 06:50 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Замечательно!

(no subject)

From: [identity profile] nashev.livejournal.com - Date: 2012-09-14 07:24 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] the-toad.livejournal.com - Date: 2012-09-14 06:51 pm (UTC) - Expand

Date: 2012-09-14 06:53 pm (UTC)
From: [identity profile] the-toad.livejournal.com
В общем и целом, это лишний раз подтверждает, что нас создали пришельцы (ушёл глумливо хохотать).

Date: 2012-09-14 09:39 pm (UTC)
From: [identity profile] tbapb-xl.livejournal.com
коли изобретут такие носители информации,
могу спорить в течении не более 5 лет появиться новый цифровой формат медиа 4ДименшнТруСенсГалактик3ДМягкийЛамповыйЗвук...
где например супротив обычного кино, записана песенка любого насекомого в лесу и полная боиграфия каждой травинки...
чтоб на ногте мизимнца поместилось строго не более 3 часов видео.

Date: 2012-09-15 12:37 am (UTC)
From: [identity profile] microcoding.livejournal.com
Интересные у вас мысли :)

(no subject)

From: [identity profile] vladicusmagnus.livejournal.com - Date: 2012-09-15 11:48 am (UTC) - Expand

Date: 2012-09-15 07:14 am (UTC)
From: [identity profile] 109.livejournal.com
отлично. кстати, комментаторы, беспокоящиеся о скорости, наверное не знают, что прочесть целиком современный терабайтный диск случайным доступом занимает МЕСЯЦ.

Date: 2012-09-15 12:39 pm (UTC)
From: [identity profile] 2hard4u.livejournal.com
Вы с каким размером блока считали? Если блок 4k, то примерно 12 дней, если блок 512k, то 6 часов. А если под современным диском подразумевается SSD, то 0,8-2 часа (в зависимости от модели).

(no subject)

From: [identity profile] 109.livejournal.com - Date: 2012-09-15 08:01 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] 2hard4u.livejournal.com - Date: 2012-09-15 09:51 pm (UTC) - Expand

Date: 2012-09-15 12:05 pm (UTC)
From: [identity profile] vchernik.livejournal.com
Не удержался перепостил http://vchernik50.livejournal.com/348967.html

Date: 2012-09-16 10:55 am (UTC)
From: [identity profile] mvmn.livejournal.com
"следующий раз объясню, как работает Illumina HiSeq"
Очень интересно
http://www.eurofinsdna.com/service-corner/faqs-products-services/faqs-genome-sequencing/general-technical-questions/what-is-the-principal-of-the-illumina-hiseq-2000-sequencing-technology.html
"Принтер", печатающий DNA? Не представлял, что такое существует.

Date: 2012-09-17 04:50 am (UTC)
From: [identity profile] kapsh.livejournal.com
Здесь уже вспоминали анекдот про сперматозоиды и яйцеклетку-файрволл?

Date: 2012-09-17 03:18 pm (UTC)
From: [identity profile] direqtor.livejournal.com
Теперь компьютерные вирусы будут кодировать в настоящих. А Касперский выпустит свою новую биоверсию...

Date: 2012-09-17 05:59 pm (UTC)
From: [identity profile] andrew-diletant.livejournal.com
Вот не удержусь. Баян, конечно, но очень в тему :)

1. Одна человеческая клетка содержит 75Мб генетической информации
2. Один сперматозоид содержит 37.5Мб.
3. В одном миллилитре содержится около 100 млн сперматозоидов.
4. В среднем, эякуляция длится 5 секунд и составляет 2.25 мл спермы.
5. Таким образом, пропускная способность мужского члена будет равна:
(37.5Мб x 100M x 2.25)/5 = (37 500 000 байт/сперматозоид x 100 000 000 сперматозоид/мл x 2.25 мл) / 5 секунд = 1 687 500 000 000 000
байт/секунду = 1 687.5 Петабайт/с

Получается, что женская яйцеклетка выдерживает эту DDoS-атаку на полтора петабайта в секунду, пропуская только один выбранный пакет данных и является самым офигенным в мире фаерволом...

Date: 2012-09-20 06:08 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
Принтер для синтеза аджилентовский. Illumina HiSeq - это для чтения прибор.

Date: 2012-09-21 08:48 am (UTC)
From: [identity profile] si14.livejournal.com
А тем временем...

http://www.naturalnews.com/037262_GMO_Monsanto_debate.html

GMO-promoting scientists are the most despicable humanoid creatures to have ever walked the surface of this planet. To call them "human" is an insult to humanity. They are ANTI-human. They are demonic. They are forces of evil that walk among the rest of us, parading as authorities when in their hearts and souls they are actually corporate cowards and traitors to humankind. To pad their own pockets, they would put at risk the very future of sustainable life on our planet... and they do it consciously, insidiously. They feed on death, destruction, suffering and pain. They align with the biotech industry precisely because they know that no other industry is as steeped in pure evil as the biotech industry. GMO pushers will lie, cheat, steal, falsify and even mass-murder as many people as it takes to further their agenda of total global domination over the entire food supply... at ANY cost.
...
The hundreds of millions of consumers who eat GMO are being murdered right now, with every meal they consume... and they don't even know it. GMO-pimping scientists are laughing at all the death they're causing. They enjoy tricking people and watching them die because it makes their sick minds feel more powerful. These were the geeks in school who were bullied by the jocks. But now, with the power of genetic manipulation at their fingertips, they can invoke their hatred against all humankind and "bully" the entire world with hidden poisons in the food. That makes them smile. It's the ultimate revenge against a world that mistreated them in their youth. Death to everyone!

И они это серьёзно.

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 5th, 2026 07:18 am
Powered by Dreamwidth Studios