Про селекцию и не только.

[progenes]

Хотела уже закрыть тему про ГМО, как вспомнила, что забыла рассказать о прелестях традиционной мирной селекции. В самом деле, нафига нам страшные ГМО, у которых гены чужие, продукты которых могут вдруг оказаться аллегренными. Если при слове "селекционер" у вас встает перед взором такой себе добрый дедушка-селекционер с колоском в руках, среди бескрайних полей, то я сейчас вам это быстренько исправлю на хохочущего

демона.

Итак, сегодня, среди наиболее перспективных направлений в селекции (традиционной), рассматривается так называемый TILLING (Targeting Induced Local Lesions in Genomes) подход. Для этого берут организм, желательно с неплохо изученым геномом, и обрабатывают его EMS (Ethyl methanesulfonate). Это очень сильный мутаген, тератоген и карциноген. (Тут уже вполне можно выключить верхнее освещение и подсветить лицо фонариком снизу).

Если не очень переусердствовать с реагентом, то можно подобрать такую удачную концентрацию, когда еще не все потомство подохнет, а только 30%, а оставшиеся в живых будут иметь одну мутацию на каждые 170 000 нуклеотидов. Это очень много. Это фактически половина всех генов становятся уродами, а организмы едва теплят свое существование. Я не зря сказала про хорошо изученный геном, потому что TILLING позволяет нам из тысяч организмов найти того уродца, где изменен нужный нам ген. Конечно, помимо этого нужного нам гена там все поломано, но нас это пока не интересует. Ну например, корни там уродские, колосок кривой, листочки с пятачок, это все ерунда, главное, что у него содержание крахмала классное (или оно способно расти на песке без воды, или его не жрет никакой долгоносик)! А теперь мы его скрещиваем с нормальным хорошим живым организмом. Потомство тоже будет не очень ахти, но если каждый раз отбирать более-менее живенькое с этим самым хорошим содержанием крахмала (или другим приятным нам признаком) и дальше скрещивать, то уже за десяток поколений мы получим очень похожее на нормальное, но с нужным нам мутировавшим геном (благодаря молекулярно-биологическим подходам мы можем его физически отслеживать).

Или вот еще хороший метод для обхода трансгенности. Вот у нас рапс, да? А вот у нас арабидопсис, родственник, но с рапсом в природе не скрещивается. То есть скрещивается, но потомство не выживает. У арабидопсиса есть полезный ген, который мы могли бы без лишнего геморроя перенести в рапс. Но тогда на рапсе придется писать ГМО и волновать потребителя. Берем рапс и скрещиваем с арабидопсисом, а гибридный зародыш выращиваем в культуре инвитро методом "сохранения зародышей" (Пускает звуковым фоном что-то леденящее кровь и фонарик у подбородка меняет цвет на красный). То есть мы не один ген переносим, мы два генома разламываем и смешиваем. Один из сохраненных зародышей рапса будет иметь ген, который нам надо (плюс еще половина генов из арабидопсиса). Потомство от этого урода мы используем как донор для последующих скрещиваний. Уж сколько там в геноме наломается, словами не передать, но зато потребителю уже не страшно.  Это я не придумала, это уже так делают.

Вот если кто боится, что в результате трансгенности вдруг случайным образом получится какой-то аллергенный белочек (один), или вдруг какая устойчивость к долгоносикам, которая нашу экологию погубит, то оцените вероятность того же самого при таких монстрозных подходах. Но ничего, селекционеры делают реверанс в сторону ГМО паранойиков:"We have demonstrated the application of TILLING, a nontransgenic, reverse genetics technology, to generate a large amount of variation in the waxy loci of both allohexaploid and allotetraploid wheat, two species with genomes among the largest and most complex of flowering plants. By generating and identifying a large allelic series in three target genes, we were able to generate useful mutations in the waxy loci and to demonstrate the potential of TILLING for wheat crop improvement. "

Comments

Предложение

[apollo-13.livejournal.com]

"Если при слове "селекционер" у вас встает перед взором такой себе добрый дедушка-селекционер с колоском в руках, среди бескрайних полей, то я сейчас вам это быстренько исправлю на хохочущего "

Мне кажется предложение не закончено. Хохочущего кого?

[kotyhoroshko.livejournal.com]

вот питання виникло. є 50 гектарів поля. треба чимось засадити. може порадиш шось? я серйозно :)

[algebraic-brain.livejournal.com]

Про TILLING понял, а про рапс/арабидопсис нет. Они не скрещиваются в природе - каким образом их все-таки скрещивают, и главное что значит выращиваем в культуре инвитро методом "сохранения зародышей"? Хотел еще спросить, но понял, что надо повторить школьный курс биологии, наверное... :)

Re: Предложение

[progenes.livejournal.com]

глюк тэга. "Хохочущего демона" Хотя можно что-нить вставить на свое усмотрение :-)

[progenes.livejournal.com]

щоб засадити чим-небуть ненужним, треба спитати, хто це купить. Я ж не знаю, що там на ринку зараз в ціні. Можна лісом :-)

[progenes.livejournal.com]

Это называется "embyo rescue" http://www.publish.csiro.au/paper/BT9940493.htm То есть получить межвидовой гибрид это не сложно. Проблема в том, что гибридный эмбрион абортируется. Если его изолировать и поместить в специальную среду, то его можно выходить. http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1439-0523.1990.tb01288.x

[algebraic-brain.livejournal.com]

Теперь примерно понял. Т.е. он выхаживается и используется далее примерно так-же как в примере про TILLING?

Re: Предложение

[algebraic-brain.livejournal.com]

Мне кажется, можно было написать так:

<lj-cut text="демона"> демона

Тогда текст тэга был бы скрыт, в ленте "второго демона" никто бы не видел, а здесь текст был бы нормальный.

Но сам не пробовал :)

[progenes.livejournal.com]

совершенно верно!

Re: Предложение

[progenes.livejournal.com]

щас попробую

Еще вопрос про межвидовое скрещивание

[(Anonymous)]

Помнится, с межвидовым скрещиванием была еще проблема стерильности потомства, которую Карпеченко решил с помощью тетраплоидии.

Здесь делают так же? А то как еще можно получить гибриды, которые можно использовать для будущих скрещиваний...

Re: Еще вопрос про межвидовое скрещивание

[hoegni.livejournal.com]

Это я был. Сорри, глюк входа в систему.

[erdweibchen.livejournal.com]

Йоооу...

Re: Еще вопрос про межвидовое скрещивание

[progenes.livejournal.com]

Я не спец в гибридах, скажу сразу. Я думаю, что не все эмбрионы, которые можно получить при межвидовом скрещивании можно выходить способом сохранения зародышей. И не все сохраненные зародыши будут фертильными. Но будут и фертильные. Уже дошли до того, что культуру пыльцы можно додиференцировать до гаплоидного растения. Наверняка решает как-нить один фактор транскрипции и никто толком не скажет, как.

[progenes.livejournal.com]

Я почему это написала. На каждой конференции, на каждой, обязательно будет пару постеров и доклад про TILLING. Каждый раз я подхожу к постеру, изучаю, фигею и забываю. На этот раз записала. Существуют коллекции TILLING-мутантов, ты можешь отправить последовательность гена, в ответ получишь посылочку с семенам мутантами по этому гену, причем тебе скажут точно, где этот ген мутирован. И тут у меня наступал кризис. Я не могла понять, как они привязывают фенотип к мутации, если у нас кроме этого гена, еще пол-генома разворочено. В этом смысле нок-ауты лучше. Но вот как поняла, что это "доноры" для селекции, так все стало на свои места.

Re: Еще вопрос про межвидовое скрещивание

[progenes.livejournal.com]

вот в статье "some of the plants showed up to 95 % pollen fertility " . Но я тут подумала и придумала, что стерильность, если она обусловлена дефектом в пыльце можно обойти, опылив нормальной пыльцой и переведя мутацию в гетерозиготное состояние. Иногда такое делают, если ген в гомозиготном состоянии вызывает стерильность.

[beauty-eva.livejournal.com]

Спасибо, благодаря твоим стараниям прозреваю в отношении ГМО все больше и больше:-).

[nature_wonder.livejournal.com]

тут есть один ньюанс. Это работает все-таки с родственными видами, и гены огурца с генами мыши таким образом не смешаешь. А вот трансгенными технологиями вполне.

[panchul.livejournal.com]

Отличный пост. В меморис!

[erdweibchen.livejournal.com]

Интересно, ярые противники ГМО в курсе?

[progenes.livejournal.com]

ну мы же знаем...

[progenes.livejournal.com]

хехе

[progenes.livejournal.com]

ну прям отличный. у меня и получше бывали ;)

[progenes.livejournal.com]

думаю, что вряд ли

[vilgeforce.livejournal.com]

А как же страшная и смертельная радиация, которой травку облучают и она лучше/краше расти начинает? :-)