GFP

Oct. 8th, 2008 02:58 pm
progenes: (Default)
[personal profile] progenes
Итак, GFP. Даже не знаю, с чего начать. Пожалуй начну с того, что сейчас редкая молекулярно-биологическая лаборатория обходится без этого важного инструмента, даже у меня есть пробирочка с геном этого замечательного белка. И вовсе не удивительно, что его открытие отмечено самой высшей научной наградой. Ее справделиво разделили три пионера в этой области исследований -Osamu Shimomura, Martin Chalfie и Roger Tsien. И весьма несправедливо обойдены вниманием Douglas Prasher и Сергей Лукьянов.

Итак, что такое GFP? Это green fluorescent protein, который впервые выделил японец Osamu Shimomura из медузы Aequorea victoria в 1960 году. Он изучал природу биолюминесценции и показал, что есть белок aequorin, который при соединении с кальцием испускает синий свет. А другой белок, абсобрируя этот свет, флюоресцирует зеленым. Этот белок так и назвали green fluorescent protein. Shimomura интересовался в основном химией этой флюоресценции и вопросы практического применения белка его особенно не интересовали.
И только в 1987 году американец Douglas Prasher придумал использовать этот белок в качестве своеоразной молекулярной метки. Он выделил ген GFP и "привязал" его к гену гемоглобина таким образом, что готовый белковый продукт гемоглобина содержал флюоресцирующий GFP хвост. Стало возможным визуализировать гемоглобин под ультрафиолетом. Возможно это и стало тем поворотным моментом в прикладном лабораторном использовании GFP и привело к настоящей GFP-революции.

В 1988 году, когда Prasher уже вовсю клонировал ген GFP, Martin Chalfie только впервые о нем услышал на семинаре в по биолюминесценции в Columbia University. Его так вдохновила идея использовать светящийся протеин, что он не мог досидеть до конца семинара. Он придумал использовать его немного не так, как это делал Prasher. В то время, как Prasher "привязывал" GFP к белкам, Chalfie решил использовать его для исследования промоторов. Я уже писала однажды, что перед каждым геном находится "кнопка", которая включает или выключает ген. Это и есть промотор. Если создавать конструкции с промотором какого-то гена (о котором мы не знаем где он работает и когда, и при каких уловиях включается) и GFP, то мы можем визуализировать, когда же эта кнопка включается. Применил он это для изучения развития модельного объекта червяка Caenorhabditis elegans, о чем я тоже уже однажды писала, а визуализацию можно посмотреть в фильмах тут. Ген GFP Chalfie получил от Prasher, а уже в 1994 опубликовал собственную статю в Science.

Сергей Лукьянов решил идти другим путем и пока все ринулись искать другие флуоресцирующие протеины в разных медузах, он начал поиск в корралах. Это сначала выглядело странно, потому как кораллы сами по себе не флуоресцируют. Но ему повезло и он наткнулся на красный флуоресцирующий протеин, который назван DsRed. А в прошлом году Лукьянов сообщил о новом красном светящемся белке из морской анемоны, которую он приобрел в зоомагазине. Этот белок любовно назван Катюшка по имени сотрудницы Лукьянова Екатерины Мерзляк.

Roger Tsien в основном занимается физической природой флюоресценции белком, мутирует их, получает белки с различными спектрами флюоресценции, что для практического использования бесценная вещь. Можно раскрашивать клетки во все цвета радуги. На картинке не абстрактное искусство, а brainbow, нейроны, которые экспрессируют разные флюоресцирующие белки.
20ти секундный фильм о 3Д визувализации brainbow можно посмотреть на ютуб http://www.youtube.com/watch?v=y51la5gS5Ws




Получить организм со встроенным геном флуоресцирующего протеина на самом деле не сложно. Он работает и в бактериях, и в растениях, и в животных. Его используют и в декоративных рыбках , лабораторных мышах, мухах, кроликах, собаках и даже свиньях


Есть замечательный сайт о GFP с примерами интересного применения этого белка, вплоть до визуализации мыслительного процесса у мышей. Всем рекомендую.

Симпатяхи

Date: 2008-10-08 01:30 pm (UTC)
From: [identity profile] palindromer.livejournal.com
Даже неудобно признаваться, но я первым делом пошел не по ссылкам, чтобы ознакомиться с предметом поближе, а попросил GFP cats у google images (http://images.google.com/images?hl=ru&q=GFP+cats&btnG=%D0%9F%D0%BE%D0%B8%D1%81%D0%BA+%D0%BA%D0%B0%D1%80%D1%82%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%BA&gbv=2). Жалко, что пока в основном вариации одной и той же фотографии

Re: Симпатяхи

Date: 2008-10-08 01:38 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
дело в том, что получение трансгенных котов для решения базовых научных вопросов, дело неблагодарное. мало кто таким занимается. вот корейцы например протрансформировали для нужд фармацевтики.

Date: 2008-10-08 01:33 pm (UTC)
From: [identity profile] gulbe.livejournal.com
зільоний котік - ето ужас, канєшна

Date: 2008-10-08 01:49 pm (UTC)
From: [identity profile] gulbe.livejournal.com
пейдж кеннат бі дісплейд.
але куда смотрят защітнікі животних!

Date: 2008-10-08 01:51 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
защітнікі животних разоряють лабораторії, випускають мутантів на волю і пишуть листи з погрозами науковцям.

Date: 2008-10-08 01:58 pm (UTC)
From: [identity profile] gulbe.livejournal.com
скіки налічує твоя особиста колекція?

Date: 2008-10-08 01:59 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
я, іванко, працюю з горохом. його права ніхто не захищає, а сам він молчалівий

Date: 2008-10-08 02:02 pm (UTC)
From: [identity profile] gulbe.livejournal.com
нічо-нічо. от прийдуть до тебе виробники конті, продукція якого, як відомо кожному українцю, не містить гмо, і шо ти тада будеш робити?

Date: 2008-10-08 01:43 pm (UTC)
From: [identity profile] id-nax.livejournal.com
зелёная мышка - здорово.
жалко, он во фьюжнах не так бодро экспрессируется, как сам по себе((

Date: 2008-10-08 01:46 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
ну мы тут с шампанским и салютом, а вы тут про проблемы во фьюжнах. он и не во фьюжнах иногда не очень бодро

Date: 2008-10-08 01:51 pm (UTC)
From: [identity profile] id-nax.livejournal.com
мне не до салютов - лукьяновцев жалко

Date: 2008-10-08 01:52 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
А мне Prasher жалко. Вот не дал бы Chalfie клон, сам бы нобеля получил.

Date: 2008-10-08 01:56 pm (UTC)
From: [identity profile] giggster.livejournal.com
так а чьо досі доблесні генетики не скормілі нам всі ці флюорисцентні прєлєсті, щоб ми світилися в темряві на забаву тим самим генетикам. скушниє люді...

Date: 2008-10-08 01:58 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
да. можу дати тобі пожувати флюоресцирующій ячмінь. боюсь, що світитись будуть тільки какашки в ультрафіолеті і то не факт.

Date: 2008-10-08 02:00 pm (UTC)
From: [identity profile] giggster.livejournal.com
менше читайте сорокіна, товариш генетик!

Date: 2008-10-08 02:01 pm (UTC)
From: [identity profile] gulbe.livejournal.com
а чьо на забаву? очінь даже для дєла можна. он у нас в нових правидах руху по трасі бажано, шоб пішоходи - а хєр лі їм вашшє на трасі робити, особливо якшо траса через рідне село проходить - мали на собі елементи світящєгося в одязі. от тут би і пригодився цей ген.

Date: 2008-10-08 05:41 pm (UTC)
From: [identity profile] polryby3.livejournal.com
А какая там группировка в белке светится зелененьким да синеньким? Вроде собственная люминесценция аминокислот только в УФ-диапазоне...

Date: 2008-10-08 06:00 pm (UTC)
From: [identity profile] id-nax.livejournal.com
хромофор там из трёх, кажется, асинокислот: тирозин, серин и... и... не помню. Идёт автокатализ, потом одна из этих аминокислот окисляется кислородом. Ну, а чтобы свечение увидеть, УФ всё равно надо посветить))
а вообще вот тут
http://www.conncoll.edu/ccacad/zimmer/GFP-ww/structure.html
всё красиво изображено

Date: 2008-10-08 09:57 pm (UTC)
From: [identity profile] botalex.livejournal.com
А у меня фрэнд есть ra_net_ka. Она профессионально биолюминесценцией занимается. У нее теперь праздник! :)http://ra-net-ka.livejournal.com/18208.html
Edited Date: 2008-10-08 09:58 pm (UTC)

Date: 2008-10-09 01:28 am (UTC)
From: [identity profile] maycep.livejournal.com
А у меня тут недавно возникла идея (http://may-k.livejournal.com/profile), разрисовывать белки!:) Сегодня по такому случаю раскрасила GFP (http://maycep.livejournal.com/28321.html). Может быть Вам будет любопытно.

Date: 2008-10-09 06:52 am (UTC)
From: [identity profile] xelenka.livejournal.com
Руслан, зеленые котики - это, конечно, очаровательно и очень интересно, но я несколько разочарована... после всех этих газетных статей про "нобелевскую премию за зеленых макак" я надеялась прочитать у тебя более серьезно про "бесценную вещь для практического использования".
Думаешь, твоим читателям не будет это интересно?

Кстати, мне это кажется, или ты уже кое-что про это писала? Пойду поищу...

Date: 2010-10-04 11:58 am (UTC)
From: [identity profile] kosiakk.livejournal.com
здорово как =)

но ведь это не даром всё? для света однозначно нужна энергия.
получается, изменённая клетка не только светит, но ещё и чуточку недоедает?

или свечение возникает лишь под ультрафиолетом, внешним источником энергии?

Date: 2010-10-04 12:03 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
свечение возникает под ультрафиолетом

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 13th, 2026 08:57 pm
Powered by Dreamwidth Studios