Пару слов о генетике вируса гриппа.

[progenes]

Я пока прерву свои потуги касательно ГМО и напою о вирусе свиного гриппа, а то маразм в сети уже зашкаливает. Как раз ВОЗ в лице Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data(GISAID) открыло геномную последовательность злодейского вируса. Как мы видим, там как раз на сайте наплыв желающих посмотреть на вирус, не протолпиться, надо регистрироваться и то, только ученым. Но я вам расскажу сейчас, что это за монстр.

Итак, вирус гриппа (свиньи, лошадки, птицы, человека или курицы) это группка из восьми отдельных молекул РНК, суммарно порядка 13 тыщ нуклеотидов. Для сравнения, один порядочный ген содержит до 2 тыщ нуклеотидов, то есть генов в вирусе раз два и обчелся, а именно 11 (на некоторых отдельных молекулах РНК закодировано сразу два гена, поэтому). Каждый ген кодирует какой-то важный белок для конструкции вирусной капсулы или ферменты для раскодировки РНК.

1. Гемагглютинин HA
2. Нейраминидаза NA
3. Нуклеопротеин NP
4. Матриксовый белок М1
5. Матриксовый белок М2
6. Неструктурный белок NS1
7. Неструктурный белок NEP
8. РНК полимераза РА
9. РНК полимераза PB1
10. Запускатель клеточной смерти - апоптоза PB1-F2
11. И еще одна РНК полимераза PB2
Все.

Это все собирается в такую красивую гармоничную конструкцию



Эта вся бадья первым делом "синими" гемагглютининами цепляется к эпителиальным клеткам дыхательного пути, выпускает в клетку хозяина все свои восемь отдельных молекул РНК. На концах каждой молекулы есть хитрые последовательности, которые позволяют им сцепиться в хоровод, навесить на себя шапку (cap) и косить под классическую нормальную клеточную матричную РНК.
Клетка думает, что это что-то нужное и синтезирует белок как бы свой. Это с одной стороны. С другой стороны, РНК плывет в ядро, встраивается в геном и нарабатывает своей РНК побольше. Выплывает назад, собирается в чудовище, убивает клетку и идет гулять себе дальше. Итак, на каком-то этапе эти все 11 генов в составе 8ми молекул РНК плавают в клетке отдельно. Это важно.

Кроме того, что они там плавают, они еще и мутируют. Не мудрено, геном махонький, мутации подстерегают на каждом угду. Если мутация такая, что белок косой получается, вирус бесславно заканчивается свой путь в эволюции. Если мутации нейтральные или удачные, то они, соответственно фиксируются. Поболтался вирус в птицах, свиньях или людях сезон, глядишь, кое-какие нуклеотиды в генах поменялись. Ученые научились читать эти гены и в зависимости от мутаций называют вирусы H3N2, H1N1, H1N5 и так далее. Буковки в навании вируса для удобства и означают не что иное, как особенности мутации первых двух генов: гемагглютинина HA и нейраминидазы NA.

Если взять вирусы (как можно больше) с разных регионов мира в разное время, прочитать их и нанести на карту мира, можно прикинуть, где эти вирусы гуляли и который как мутировал. Это важно.

Теперь смотрим на гены нового свиного вируса H1N1. Оказалось, что ген гемагглютинина вроде обычный ничем не примечательный свиной американский ген, известный с 1999 года. Впрочем, остальные свиные американские вирусные гены - известный коктейль человеческого и птичьего вирусов. Однако гены нейраминидазы и матриксового белока М1 похожи на таковые из евразийских свиных вирусов, впервые зафиксированные в Таиланде. Я недаром отдельно отметила, что вирусная РНК способна какое-то время болтаться отдельно в клетке. Если теоретически один организм заразить миксом вирусов, то они там перепутываются и собираются заново с чужими РНКами (re-assorted). Свинья сама по себе подходящая биофабрика для подобных коктейлев, она, бедолага, восприимчива к человеческому, птичьему и к своему вирусу. В общем, как мы видим, комбинация получилась удачная.

Что касается вопроса о возможном искусственном получении подобного вируса, то тут вообще невозможно ничего толкового сказать. Я затрудняюсь сказать, насколько можно предугадать подобную эффективность нового монстра. Доктор Dr Frank Plummer, scientific director of the Winnipeg lab говорит:This is an interesting virus. It's a brand new virus, not only to humans but to the world. How it did that, where it did it, when it did it, I don't think we know yet.

UPD: Полезные ссылки от врачей
ОЧЕРЕДНОЙ СВИНОЙ ГРИПП: МИФЫ И РЕАЛИИ  от botalex 

Все о гриппе от uncle_doc , tanchik 

Comments

[0lenka.livejournal.com]

Ярко и образно :)

[progenes.livejournal.com]

Ура!

[chapeye.livejournal.com]

so maybe it actually is artificial?

[progenes.livejournal.com]

Розумієш, штучно насинтезувати 8 коротких молекул РНК - це завдання для студєнта. Інша справа - передбачити якості, особливості збірки в організмі, способ переносу і дію - це вже набагато важче. Тут є певні обмеження в знаннях, але над цим точно працюють і вивчають. Вчені вже давно попереджали, що свиня може підсунути нам свиню.
Тобто навіть якщо уявити, що там якась частина рукотворна (навіть результати мирних дослідів, врешті-решт віруси саме так і вивчають - культивують їх в качачих зародках, наприклад), то в даному випадку мені цей вірус виглядає скоріше як "удачне" стєчєніє обставин.

[govorilkin.livejournal.com]

аааагромадное спасибо за статью:)
а то по Инету бродят статьи раздражающие своей тупостью и поисками происков "тайного мирового правительства возглавляемого жЫдомассонами" тм :-/

[iime.livejournal.com]

Ну, знаете, жидомасоны тоже на многое способны, я бы так сразу не сбрасывал их со счетов.

[kotyhoroshko.livejournal.com]

ухти як класно написала.
мерсі

(я хамєть не буду, як нєкоториє(

[progenes.livejournal.com]

(сладкімі русалочьїми пеніямі) от спасібо! і мені приятно!

[xelenka.livejournal.com]

1. картинка маловата :)
2. я помню, во времена истерии по птичьему гриппу, рассказывали, о том, что ежели свинья заразится птичьим и человеческим гриппом одновременно, то они там мутируют и получится птичий грипп, который способен передаваться от человека к человеку. это оно или это самостоятельный "свиной" вирус, перемешавшийся с человеческим?

[progenes.livejournal.com]

1. Картинка не главное.
2. В ощем с некоторыми натяжками оно. Самостоятельный свиной вирус это тоже как бы уже перемешавшийся с человеческим и птичим.

[bison-bonasus.livejournal.com]

Отличное резюме :) Особенно мне понравилось про бесславное окончание эволюции )))))

[progenes.livejournal.com]

хехе!

[http://users.livejournal.com/_a_s_/]

Огромное спасибо и за грипп, и за ГМО.

[http://users.livejournal.com/_a_s_/]

Ой... ну и выразилась... Спасибо за статьи, конечно.

[younot.livejournal.com]

Рада, что вас нашла )
Интересная информация и даже много чего понятно (это спасибо за обычный язык) :)

[progenes.livejournal.com]

Пожалуйста!

[sergeyr.livejournal.com]

Я на форум утащу.

[progenes.livejournal.com]

Тащи. Можеш еще поправить ашипки и очепятки.

[ezdakimak.livejournal.com]

Ну судя по логике, если известно H_ и N_ - то уже ясно как лечить. Что-то, что действует либо на то, либо на другое. От птичьего лекарство сделали уже? А то я как-то упустил этот момент.

[progenes.livejournal.com]

Ну да, пока либо на нейраминидаза либо гемагглютинин. Ну можно еще репликацию подавлять. Думаю, что от птичьего лекарства пока не сделали, хотя я тоже не следила.

Аскольд.myopenid.com

[(Anonymous)]

гратиа. в своём <мета>блоге добавлю линк на "сюда".

Re: Аскольд.myopenid.com

[progenes.livejournal.com]

Это хорошо!

[murrka.livejournal.com]

respect, dazhe ja ponjala :)
ser'ezno, ochen' xorosho napisano.

[murrka.livejournal.com]

А насчет искуственного происхождения я бы поспорила. Вполне можно искуственно вывести такой штамм, это даже неочень сложно. Правда требует очень много денег и времени, есть куда более дешевые способы угробить человечество.

[l-i-d-y-a.livejournal.com]

Спасибо!
Я Вас зафрендила чтобы просвещаться - и не прогадала.

[progenes.livejournal.com]

ПОжалуйста!

[pirhospr.livejournal.com]

Русланочка, а что пишут на сайте ВОЗ по поводу от чего пошел такой мор? 149 человек за такой срок.. Даже при отсутсвии системы здравоохранения как-то не вяжется.
Разубедите меня, ретрог(р)ада, если будет минутка, что это не очередная игра для..например..заливки Мексики бетоном для создания там запасного космодрома США или выделения средств на выращивание экологически чистых хряков в Антарктиде и получения доступа к запасам пресной воды. А то что-то очень смешно жить.

Я присоединяюсь к вопросу

[velta-1.livejournal.com]

Во-первых, спасибо просветительница Вы наша! У Вас действительно талант популярзатора.

Во-вторых, вопрос. Я вчера за обедом у коллег поинтересовалась - тоже никто не в курсе: от чего реально мрут?
Все-таки, около 10% смертность, да не в какой-нибудь жопе земли, где ни врачей, не лекарств, а в достаточно цивилизованной Мексике - это очень много. Хотя поменьше, чем от SARS, но все равно.
Насколько я понимаю, летальность SARS происходила от вирусной пневмонии. А здесь чего? Чихнул - и помер, так не бывает. Этот штамм тоже склонен переходить в пневмонию, или во что-то другое?

[ludovikxiv.livejournal.com]

спасибо большое.
скажите пожалуйста - как с вам можно связаться для возможного получения интервью, я представляю сайт trust.ua мы готовим обширный материал о "свином гриппе". буду очень благодарен.

[progenes.livejournal.com]

Пожалуйста. Вы можете написать в личку, я дам контакты. Но я очень сомневаюсь, что я достаточно компетентна в вирусологии для дачи интервью. Вся эта информация доступны и открыта для минимально разбирающегося в генетике. Во-вторых, я еще завтра на работе, а потом дней на пять ухожу в отпуск и буду совсем недоступна.

[dona-fleur.livejournal.com]

спасибо за информацию, а то уже ужастики из СМИ замучили. И хорошо Вам отдохнуть!

[zafira-omry.livejournal.com]

Большое спасибо - за объяснения и ссылку. Очень не хватает информации от людей, которые профи. Я не против СМИ - но в последнее время всё сильней раздражает склонность к созданию истерических тонов.
Статьи о ГМО - это супер. Тоже очень не хватало :) внимательно читаю и думаю :)

Лайно

[(Anonymous)]

Здох пташиний грип, фармацевти заробили. Тепер вигадали свинячий. Зароблять і пустят в расход. Завтра буде колгоспний чи китайський. Тема кльова, адже піпл хаває. А ви, авторко, тут маструбуєте вумними поняттями, "какая я умная и красивая, но не при делах". І також заробляєте. Ненавиджу вас, потвор, що брешуть, постійно брешуть.
Скажіть, де той пташиний грип? Вже й не мре ніхто. А скільки птахофабрик винищили в Криму? Памятаєте? Тепер що, капец свинофермам?
А туберкульоз? В Україні щороку мруть мінімум по 20 000 чоловік, і нічого. Закривають лікарні. А тут 16 маріхуанщиків померло від передозу, а Ющ 50 лямів вже встиг вкрасти, тЮлька за свинями на кордоні бігає. Ганьба Вам, як рупору Брехні!!!

[nastyas.livejournal.com]

Спасибо, интересно!

Маленькая поправочка:
РНК плывет в ядро, встраивается в геном и нарабатывает своей РНК побольше

для точности лучше написать, наверное, что РНК переводится в форму ДНК, потом ДНК встраивается в геном и нарабатывает своей

[nastyas.livejournal.com]

ой, не дописалось...

...и нарабатывает своей РНК побольше.

А то непонятно получилось, геном-то ДНКовый, РНК ему не подходит по формату. :-))

[dr-tambowsky.livejournal.com]

Руслана, не пугайте так, грипп - это, конечно, РНК вирус, но всё-таки не ретровирус :) В геном он не встраивается, у него, вроде как, своя RNA-dependent RNA polymerase, нет? ;)

[yurvor.livejournal.com]

Если что, то эти вирусы в GenBank'е тоже дают (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/SwineFlu.html).

[softfan.livejournal.com]

в википедию статью измените про H1N1

[blacksun-rise.livejournal.com]

вы мне по-простому скажите
1. передача воздушно-капельным путём ?
2. какова вероятность подохнуть от вируса конкретно мне ?

спасибо

[alexlotov.livejournal.com]

"Я затрудняюсь сказать, насколько можно предугадать подобную эффективность нового монстра"

Американские биоинформатики (http://elementy.ru/news/430157) впервые в мире построили динамическую компьютерную модель живого организма на атомном уровне. Этой чести удостоился один из самых простых вирусов - вирус-сателлит табачной мозаики.

[di-halt.livejournal.com]

Хм, а какой смысл вирусу убивать клетку? Размножился и пошел дальше. Или клетка после такой встройки чужой РНК существовать нормально дальше не сможет и ее смерть это естественный процесс?

[posthum.livejournal.com]

Дякую :)
я на тебя ссылочку дал, ок?

[progenes.livejournal.com]

хех. конечно ок!