Книжка и испорченный телефон.

[progenes]

Я сейчас немного занята практической работой в лаборатории.
Немного теоретической. Пришла сегодня бандеролька. Читаю от кого пришла бандеролька? А от American Society of Agronomy, Crop Science Society of America и Soil Science Society of America. Открываю, а там...
Кликаем на Look Inside, а там Table of Contens. Статья намбер 3. Ну и Front Cover (скромно), тоже наш. Продукт дескрипшн: "Can we make a peanut less allergic? Can we grow a vaccine? Can a seed oil outperform fish oil? Can we develop a "super grain" that conquers world malnutrition? Biotechnology and its advancements offer a realistic means to improve the overall nutritional quality of seeds. Modification of Seed Composition to Promote Health and Nutrition gathers the current state-of-the-art information on biotechnological improvement of seed composition with a primary focus on improving the nutritional value of human food. Chapters included in this book, contributed by prominent scientists from around the world, will become a valuable resource for students and researchers engaged in modification of seed composition."
Мелочь, но приятно. Статьи статьями, а тут книжка, Hardcover. Как у взрослых.

Пока идет реакция, в поте лица пишу продолжение в ЖЖ про ГМО. Мутации там всякие. Интересно, но выходит сложновато. В это же время ко мне в журнал наведывается разгневанный народ. Обычное дело, но тут случай весьма
Товарищ у себя в журнале пишет:
"Например одна ошибка идиота генетика, самоуверенность его и его босов вызвала тяжелые случаи аллергии по всему миру, нанесла огромные убытки фермерам, которые вырастили томаты с каким-то механизмом профилактики гриппа у людей." и продолжает у меня в журнале
"Покажите у скольких людей будет аллергия на помидоры, в которых покопался один единственный придурок профессор, думая, что создает общеукрепляющие помидоры для организма, и которые пришлось снимать с производства."

Итак. Внимание. Томатов механизмом профилактики гриппа у людей никогда не выращивалось и общеукрепляющие пока тоже пока на страницах моего журнала и в лаборатории. Уточням стало быть, что человек имеет в виду, просим ссылочку. В ответ получаем посыл самой почитать в википедии.
Впрочем, через два коментария высокомерно заявляется:
"Странно, что вы не слышали про гниениеусточивые томатики и их замечательное влияние на устойчивость организма к антибиотикам."
Ага. То есть не профилактика гриппа и не общеукрепляющие. Устойчивые к гниению. Это хорошо. И с аллергией тоже проясняется:
"Вы привязыватесь к мелочам. Хорошо, аллегрии вызывали другие растения, а помидорчики вызвали устойчивость к антибиотикам."

Уточняем, как они вызывают устойчивость к антибиотикам. Я -то знаю, как они теоретически могут вызывать (under certain conditions), но мне ж интересно. Оказывается, товарищ считает:
"Там люди получали как я понимаю ежедневные порции антибиотиков в помидорчиках." O!
Неправильно считает, потому что порций антибиотиков в помидорчиках не было. Но пробует честно разобраться, используя немножко затерявшихся в голове школьных знаний:
"В помидорах были гены, которые не давали загнить, следовательно гены белков, устойчивых к антибиотикам. Белки попадали в желудок."

Теперь внимание, интересный момент. Речь идет о FlavrSavr томате с повышенной лежкостью. Интересен в этой технологии тот момент, что генная модификация в этом случае не подразумевает встраивание какого-то гена, который кодировал бы белок. Встраивается "обратный" кусок родного гена полигалакторуназы. Что получается. Этот "обратный" кусок комплементарно склеивается с мРНК, с которой должен считываться белок полигалакторуназа, разрушающая клеточную стенку. В результате мРНК разрушается и считывания не происходит. Чужеродного белка устойчивости в ГМО нет.

А что там с антибиотикоустойчивостью? Действительно, до недавнего времени трансгенные растения содержали в конструкции ген устойчивости к канамицину для отбора на канамициновой среде. Теоретически можно предположить, что если до кишечника ДНК дойдет в неразрушенном виде (что маловероятно, но при определенных условиях возможно), и именно ДНК, которая кодирует целый ген устойчивости до антибиотика (что тоже очень маловероятно, но с очень малой долей вероятности возможно) при очень определенных условиях попадет в геном кишечной палочки (для чего необходимы тоже специальные условия вроде теплового шока) и встроится в геном кишечной палочки, что придаст ей устойчивость к антибиотику канамицину, то это тоже ничего страшного в случае, если на устойчивую кишечную палочку не совершается селекционного давления канамицином (пациент в даный конкретный момент проходит терапию канамицином). Намного больше вероятность заполучить устойчивые к антибиотикам штаммы благодаря неаккуратному следованию врачебным рекомендациям. Тем не менее, несмотря на бесконечно малый риск, который на практике не показан, устойчивость к канамицину не используется в современной биотехнологии растений, предназначенных для комерческого культивирования.
В общем, ложечка нашлась, осадок остался "Историю про помидорчики знают все биологи, кто получал образование.Это классика дегенератизма в науке, её изучают в университетах.То, что вы не в курсе этой истории - показательно."

Comments

[shao-s.livejournal.com]

You're most welcome :o)

Не, ну давай я тоже в грязь лицом не ударю по части ВУмных слов, а то обидно: мол, мы тут лясы точим при занятом человеке. Я тоже от эксперимента отрываюсь, ага. Запись микротоков нейрона под влиянием G-протеин-регулируемого высвобождения кальция из эндоплазматического ретикулума при искуственно блокированных кальциевых транспортёрах.

"А ещё я знаю "карате", "джиу-джитсу", "кунг-фу", и много других страшных слов" :о)

[progenes.livejournal.com]

Ну G-протеином ты меня не испугал. Эта штука в каждой бочке затычка. О! А скажи мне, получается вы и мембраны эндоплазматического ретикулума меряете? Или вы потенциалы на внешней мембране при высобождении кальций из ретикулума? Я тебе когда-то про один дивный протеин рассказывала. Не знаем, с какого боку подобраться. Я подозревала, что он на мемране сидит, а его локализовали на ретикулуме. И вот эта штука вызывает массированную клеточную гибель. И я не понимаю как.

[shao-s.livejournal.com]

Ну, сейчас я пишу с внешней мембраны, под влиянием высвобождения из ретикулума. Насчёт писания с ретикулума... Я не встречал такого в литературе. В принципе, пэтч-кламп на митохондриях делают, на ядре тоже, так что методически невозможным его на ретикулуме не назовёшь. Но чисто практически это, как могу представить вот так, с кондачка, крайне сложно. Что, впрочем, не значит, что кто-нибудь уже не придумал методику для такого эксперимента. Может, я просто не встречал в статьях, потому что специально темой не интересовался.

[progenes.livejournal.com]

Но я поняла главное. Высвобождение кальция из ретикулума можно зафиксировать на внешней мембране. Это важно. То есть мне совершенно ясно, что этот протеин садится на ретикулум и что-то делает, что приводит в конечном счете к клеточной смерти. Надо еще пораскинуть мозгами, что можно придумать. Понимешь, фишка в том, что как только он экспрессируется, клетка тотчас дохнет. И эукариоты и прокариоты. Во всяком случае бактериальная, дрожжевая и растительная. Показано экспериментально. А цистеиновый доменчик похож на скорпионий яд, который вяжется на калиевые каналы. И я думала, что он валит таким образом. И убей меня не понимаю, что он может делать на ретикулуме. О! А на ретикулуме есть калиевые каналы?

[shao-s.livejournal.com]

На ретикулуме? Хм... Так вспомнить не могу, чтоб встречался, и ПабМед, вроде, не находит. Кажется мне, что там транспорт калия транспортёрами обходится. Но радикально утверждать не буду - тут вопрос надо изучить. Проблема в том, что я всю жизнь рецепторами и каналами внешней мембраны занимался, а не ретикулума. Это сейчас так, по касательной.

[Микола (from livejournal.com)]

Ну блін... Раз пішла така п'янка, то скажу і я: сьогодні остаточно схвалили та включили в базу вихідного коду мій патч до типобезпечної бібліотеки роботи з PostgreSQL. Патч лікує переповнення стеку при отриманні з бази великих вибірок (> 5*10⁶ записів). Конкретно, проблема була у використанні non-tail-recursive функції в алгоритмі конвертації raw-даних з бази в типи ocaml.

P.S.: написав, перечитав... Ваше з Русланкою кунг-фу страшніше.

[ursula-w.livejournal.com]

Я по-прежнему не говорю на этом языке, но патч, PostgreSQL и non-tail-recursive знаю :)

Но запись микротоков нейрона под влиянием G-протеин-регулируемого высвобождения кальция из эндоплазматического ретикулума и правда круче. Я аж обзавидовалась и замечтала вернуться в профессию...

[shao-s.livejournal.com]

В таких вещах главное - не пожалеть. Сначала что ушёл, потом что вернулся. Вот я в этой комбинации когда-то пожалел, что ушёл, и не пожалел, что вернулся. Но если вы не жалеете, что ушли - не факт, что надо возвращаться.

Эдакий трактат "о сущности суть несуществующего" :о)

[ursula-w.livejournal.com]

Вы знаете, я как та обезьяна, которая не могла разорваться между умными и красивыми - и в разработке интересно, и в науке жуть как хочется состояться: что-нибудь на микротоме порезать, да мацерировать, да титрануть, да электрофорезиком... И вуаля - открытие на Нобелевку! Как-никак лучшие годы жизни за этими занятиями прошли.

[shao-s.livejournal.com]

Лучшие годы жизни всегда впереди :о)

[ursula-w.livejournal.com]

Спасибо, Вы меня обнадежили :)

[shao-s.livejournal.com]

Я, кстати, это вполне серьёзно сказал.

[Микола (from livejournal.com)]

Там вообще много слов, которые любой носитель русского языка может распознать без особого труда. В отличии от "эндоплазматического ретикулума" :-)

В России это возможно? На таком уровне, я имею в виду.

[shao-s.livejournal.com]

Я отвечу: нет. По крайней мере, сейчас. Увы.

Такой уровень электрофизиологии сейчас есть в четырёх с половиной странах. В остальных (туда входят Россия и Украина) с бОльшей или меньшей успешностью надувают щёки.
Хотя стеклянный электрод для внутриклеточных отведений, на котором вся эта область науки держится, придумал Платон Костюк. Который и сейчас директор киевского Института Физиологии.

[shao-s.livejournal.com]

Это если ты об электрофизиологии спрашивал, а не о программировании :о)

[Микола (from livejournal.com)]

:-))
Ну звісно я питав про електрофізіологію.
Програмування на теренах колишнього СРСР тримає рівень бо не потрібна дорога матеріальна база. Хоча от наскільки довго воно іще цей рівень триматиме - хз.

[shao-s.livejournal.com]

З електрофізіологією справа не тільки в матеріальній базі. Тут є ще й така нематеріальна субстанція як "школи". Вони були за радянської влади в трьох містах СРСР: Києві, Москві та Казані. Зараз всі три практичено вимерли. Тому що висококласний нейрофізіолог надто легко знаходить собі роботу в країнах з вищезгаданої четвірки. Де робить те ж саме за гроші в 10-15 разів більші. За часів СРСР це лімітувалось кордоном на замку, а зараз не лімітується нічим. А "пряника", тобто можливості працювати на батьківщині за хоча б вдвічі менші гроші, немає.

[Микола (from livejournal.com)]

Якщо відійти в бік від науки, то мені важко повірити в те, що після кількох років в Лондоні ти поїдеш жити і працювати в Україну на відвічі меньші гроші.

[shao-s.livejournal.com]

З урахуванням різниці цін - зміг би, думаю. Лондон - місто напочуд дороге :о) Але тут є не тільки грошові резони, нажаль. Втім, як я тобі колись казав, моєю віддаленою мрією (і навіть принципово досяжною) є саме переїзд в Україну з відкриттям лабораторії світового рівню на західні гроші. А потім - робота на західні гранти, щоб від наших "достойників" не залежати.
Інша справа що, навіть якщо я досягну такого рівня, коли це стане можливо, не факт, що в мене все ще буде таке бажання. Є приклади перед очима.

[Микола (from livejournal.com)]

Мда... "Чудні справи твої, Господи" (с) Біблія

[ursula-w.livejournal.com]

Ой, мне так проще "эндоплазматический ретикулум" перевести или там "гиперплазию эндометрия" вкупе с "вариабельностью дескрипторов", чем "вони були за радянської влади" какое-нибудь. Очень сильно сбивает то, что вроде бы родственные русским слова используются в совершенно другом смысле. :(

[Микола (from livejournal.com)]

Это потому, что язык ретикулумов Вы целенаправлено изучали :-)

[ursula-w.livejournal.com]

Да нет, само приползло...