![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesGeorge Church и J. Craig Venter провели короткий курс синтетической геномики в рамках третьей культуры Edge для ученых, журналистов и культурных импресарио. С видео и короткими откликами участников тут.
О Крэйге Вентере я уже писала, а имя Джоджа Черча больше известно специалистам-молекулярщикам по первому методу секвенирования ДНК, который он разрабатывал вместе с Wally Gilbert.
Синтетическия геномика - новая область биологических исследований, комбинирующая науку и инженерию с целю получить новые биологические функции и системы. Синтетическая геномика все еще на стадии звездных карт, хотя она становится чем-то вроде Google Earth быстрее, чем думает большинство людей.
Вопросы, которые рассматривались на курсе (из откликов):
Жизнь - понятие качественное или количественное? Каждый прорыв в науке случается тогда, когда мы учимся что-то измерять, нежели качественно описывать. Например, тепло это не присутствие или отсутствие какой-то субстанции или качества, но скорее измеряемая характеристика комплекса термодинамических систем. Может ли это также присуще жизни?
Измерение саморепликации ДНК открывает нам такие количественные горизонты. Черч и Вентер приводят следующие аргументы в возможности подсчета количества жизни.
1. Минимальная самореплицирующая система содержит 151 ген, бактерия и дрожжи - около 4000, человек - 20000 генов.
2. Всех существующих возможных азотистых оснований для нуклеотидов 12 (6 пар), используется 4 (2 пары). (Примечание, в оригинале статьи пишут "There are 12 possible amino acid bases (6 pairs); we ended up using 4 bases (2 pairs); other biological systems are possible". Не верьте. Отклик писал программист Tim O’Reilly , бес попутал аминокислоты и нуклеотиды).
3. Человек - это скорее экологическое образование, а не только организм. Человеческий микробиом - 23 "кило" человеческих генов и 10 "кило" бактериальных.
4. Ранние оценки численности живых организмов ограничены тем, что можно было культивировать в лабораторных условиях; путем отбора проб ДНК в воде и почве, мы обнаружили, что мы недосчитались на много порядков.
5. Биомасса бактерий в земле и морях больше всей биомассы видимых растений и животных.
6. Снижение стоимости секвенирования генов опережает рост Закон Мура (1.5x/year): количество нуклеотидов, прочитанных за доллар растет на 10x в год.
В настоящее время революции в области геномики и синтетической биологии будут такими же глубокими, как формирование современной химии и физики из средневековой алхимии.
О Крэйге Вентере я уже писала, а имя Джоджа Черча больше известно специалистам-молекулярщикам по первому методу секвенирования ДНК, который он разрабатывал вместе с Wally Gilbert.
Синтетическия геномика - новая область биологических исследований, комбинирующая науку и инженерию с целю получить новые биологические функции и системы. Синтетическая геномика все еще на стадии звездных карт, хотя она становится чем-то вроде Google Earth быстрее, чем думает большинство людей.
Вопросы, которые рассматривались на курсе (из откликов):
Жизнь - понятие качественное или количественное? Каждый прорыв в науке случается тогда, когда мы учимся что-то измерять, нежели качественно описывать. Например, тепло это не присутствие или отсутствие какой-то субстанции или качества, но скорее измеряемая характеристика комплекса термодинамических систем. Может ли это также присуще жизни?
Измерение саморепликации ДНК открывает нам такие количественные горизонты. Черч и Вентер приводят следующие аргументы в возможности подсчета количества жизни.
1. Минимальная самореплицирующая система содержит 151 ген, бактерия и дрожжи - около 4000, человек - 20000 генов.
2. Всех существующих возможных азотистых оснований для нуклеотидов 12 (6 пар), используется 4 (2 пары). (Примечание, в оригинале статьи пишут "There are 12 possible amino acid bases (6 pairs); we ended up using 4 bases (2 pairs); other biological systems are possible". Не верьте. Отклик писал программист Tim O’Reilly , бес попутал аминокислоты и нуклеотиды).
3. Человек - это скорее экологическое образование, а не только организм. Человеческий микробиом - 23 "кило" человеческих генов и 10 "кило" бактериальных.
4. Ранние оценки численности живых организмов ограничены тем, что можно было культивировать в лабораторных условиях; путем отбора проб ДНК в воде и почве, мы обнаружили, что мы недосчитались на много порядков.
5. Биомасса бактерий в земле и морях больше всей биомассы видимых растений и животных.
6. Снижение стоимости секвенирования генов опережает рост Закон Мура (1.5x/year): количество нуклеотидов, прочитанных за доллар растет на 10x в год.
В настоящее время революции в области геномики и синтетической биологии будут такими же глубокими, как формирование современной химии и физики из средневековой алхимии.
Tags:
