[personal profile] progenes
Тут у нас докторант-бедолага бодается с чужими трансгенами. Вроде точняк трансгены. Проверили саузерном - вставка есть. В рамках кооперации решено отправить растения в дружественную лабораторию, а оттуда любезно запросили в довесок к растениям праймеры для проверки трансгенности ПЦРом. Праймеры, это такие короткие последовательности ДНК (можно даже на бумажке буковки). А ПЦР это ПЦР. Ну вот докторант придумал праймеры и тестирует ПЦР. Прогнал форез и жалуется на результаты.

Смотрю - маркеры на месте, контрольная полоска с плазмидкой - есть. Дальше начинается бардак. В диком типе - полоска (а не должно быть) , в двух трансгенах - полосок нет (а должны). Зато есть жирнющая полоска правильного размера в совсем негативном контоле, содержащем воду.

Да, -говорит. Для контроля воду брал отдельно, чтобы не загрязнить плазмидой, наносил на гель на расстоянии от плазмиды, чтобы из кармана не перетекло. Воду перед этим проавтоклавировал.Говорю, ну знаешь, бывает и фальш-позитивные, и фальш-негативные, но чтобы в одном эксперименте было и то, и другое, такого не видела. В воде вообще замечательно. Посоветовала попроситься на работу к Люку Монтанье.

Напомню, Люк Монтанье это нобелевский лауреат за ВИЧ. Говорят, последнее время спятил и, видимо, хочет еще одну премию - шнобелевскую. Утверждает, что вода помнит ДНКу. Вот,- говорю,- ты с этим ПЦРом это экспериментально и докажешь.

И в завершение бонус. Одно уважаемое издание попросило цитату о новых технологиях. Поскольку цитата не подошла - разрешу ее себе опубликовать здесь. Даже две.
"To live, to err, to fall, to triumph, to recreate life out of life" . "Портрет художника в юности" Джеймса Джойса, кто не в курсе. Спрашиваете, причем тут технологии? Ну это Вентер пошалил и процитировал Джойса в геноме бактерии микоплазма.

Еще одна цитата, оттуда же (из генома микоплазмы): "What I cannot build, I cannot understand" - Ричард Фейнман.
Ну тут Вентер оскандалился, потому что оригинальная цитата Фейнмана такая:
“What I cannot create, I do not understand."
Когда Вентеру указали на ошибку, он ответил следующее: "We agreed what was on the Internet was wrong, so we’re going back to change the genetic code to correct it".

Короче, поменял докторант праймеры, все получилось как надо.

Date: 2011-10-27 02:36 pm (UTC)
From: [identity profile] kondybas.livejournal.com
Ну, предположим, неправильными праймерами неоднозначно метился фрагмент ДНК, в результате получался коктейль. А в контроле-то откуда?

Date: 2011-10-27 02:52 pm (UTC)
From: [identity profile] sapsilma.livejournal.com
докторантом неоднозначно метились пробирки с образцами по-моему. это все объясняет.

Date: 2011-10-27 02:57 pm (UTC)
From: [identity profile] stoshagownozad.livejournal.com
вот у меня тоже сильное ощущение, что он пробирки перепутал

Date: 2011-10-28 06:37 am (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
С водой вряд ли перепутал.

Date: 2011-10-28 06:47 am (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Первая мысль действительно такая. Но есть нюанс. на форезе видно, где в пробах есть геномная ДНК, а где ее нет. Если для ПЦРа плазмиды надо следовые количества темплейт, то для ПЦРа трансгена надо хорошенечко ДНКи бухнуть, до 1 мкг. на форезе от такого количества заметно трек. В общем, если и перепутал, то точно не воду с ДНК.

Бывает контаминация, если первой в мастермикс раскапать плазмиду носиком без запора. Потом она всюду "лезет" куда не надо. В общем, я грешу на загрязнение, но как?

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 6th, 2026 06:47 am
Powered by Dreamwidth Studios