[personal profile] progenes
Колись я посилалась на смішну і цікаву статтю "Чи може біолог поремонтувати радіо". Чудова нагода повторити урок. Нагадаю, для того, щоб встановити, яка деталь поламалась, біолог накупить купу подібних радіо, розстріляє їх з дробовика і почне порівнювати набуті ефекти з поламаним приймачем.


Нарешті, знайдуть дротика, видалення якого призведе до припинення віщання. Назовуть його ВВК (випадково відкритий компонент) і встановлять, що ВВК необхідний для зв'язку довгого об'єкту, що висувається, з приймачем. Довгий об'єкт назовуть СВК (найважливіший компонент) і його довжина буде прямо пропорційна до якості звуку. Продовження цієї історії читайте по лінку.

З геном FTO трапилась приблизно така ж історія. На цей ген натрапили, досліджуючи мутації, що пов'язані з ожирінням. Крім прочитання цілого геному, є багато різних дешевших методів, один з них генотипування одиночних нуклеотидних замін. Грубо кажучи, помітили, що часті заміни нуклеотидів (мутації) в одному гені корелюють з надмірною вагою. Тому ген назначили основним генетичним цапом відбувайлом за надмірну вагу(Fat mass and obesity-associated protein).

Що він конкретно робить і як пов'язаний з розвитком ожиріння, було не дуже ясно, тому на щойно відкриту наукову ділянку накинулись вчені. Перш за все замовили мишей і розстріляли їх з дробовика і виключили в них ген FTO. І.. нічого не трапилось. Хіба що пальці на лапках склеїлись (FTO - абревіатура від fused toes). Вирішили, що це через відмінність мишей і людей. У біологів до всього є пояснення. Це перевага біології перед точними науками.

Невдачі не відлякали вчених і вже незабаром з'явились роботи на культурах людських клітин (наприклад), де ніби показано, що ген якимось чином задіяний в клітинному диханні. Це ще одна перевага генетики - якщо є ген, то він обов'язково щось регулює в культурі клітин. Треба тільки вправно це інтерпретувати. Починаючи з 2008 року, щороку нагора видавали по дві сотні статей про FTO. Здавалось, що до подолання головної хвороби цивілізації подати рукою.

Але всю малину псував один нюанс - мутації в гені, що пов'язують з ожирінням, розташовані в некодуючій частині гену - інтроні. Саме тому важко пояснити функціональність самого гену. Аж вийшла свіженька стаття, де, нарешті, розкопали, як ці дротики між собою пов'язані. Виявилось, що на ДНК, яка зовсім не шнурок, а клубок, ця некодуюча частина гену FTO робить петлю, що взаємодіє з промотором зовсім іншого гену Irx3 і посилює експресію саме цього гену. А вже ген Irx3 безпосередньо регулює вагу. Кодуюча частина гену FTO до ожиріння відношення не має взагалі.

Мишки, яких розстріляли їх з дробовика, у яких виключили ген Irx3, дійсно худенькі і стрункі, навіть коли багато їдять і небагато рухаються. Працює цей ген безпосередньо в мозку мишей, підтверджуючи давно відому тезу -  схильність до повноти розташована в голові.
______________________________________________________________________


Когда-то я ссылалась на смешную и интересную статью "Может ли биолог починить радио". Прекрасный повод повторить урок. Напомню, для того, чтобы установить, какая деталь поломалась, биолог накупит кучу подобных радио, расстреляет их из дробовика и начнет сравнивать полученные эффекты с поломанным приемником.


Наконец, найдетcя проводок, удаление которого приведет к прекращению вещания. Его назовут СОК ( случайно открытый компонент) и установят, что СОК необходим для связи длинного выдвигающегося объекта с приемником. Длинный объект назовут СВК (самый важный компонент) и его длина будет прямо пропорциональна к качеству звука. Продолжение этой истории читайте по линку.

С геном FTO произошла примерно такая же история. На этот ген наткнулись, исследуя мутации, связанные с ожирением. Кроме прочтения целого генома, есть много различных более дешевых методов, один из которых генотипирование одиночных нуклеотидных замен. Грубо говоря, заметили, что частые замены нуклеотидов (мутации ) в одном гене коррелируют с избыточным весом. Поэтому ген назначили основным генетическим козлом отпущения за лишний вес (Fat mass and obesity - associated protein).

Что он конкретно делает и как связан с развитием ожирения было не очень ясно, поэтому на только что открытую научную делянку набросились ученые. Прежде всего заказали мышей и расстреляли их из дробовика выключили у них ген FTO. И... ничего не произошло. Разве что пальцы на лапках склеились ( FTO - аббревиатура от fused toes). Решили, что это из-за различия мышей и людей. У биологов всему есть объяснение. Это преимущество биологии перед точными науками .

Неудачи не отпугнули ученых и  вскоре появились работы на культурах человеческих клеток (например) где якобы показано, что ген каким-то образом задействован в клеточном дыхании. Это еще одно преимущество генетики - если есть ген, то он обязательно что-то регулирует в культуре клеток. Надо только умело это интерпретировать. Начиная с 2008 года, ежегодно нагора выдавали по две сотни статей о FTO. Казалось, что до преодоления главной болезни цивилизации подать рукой.

Но всю малину портил один нюанс - мутации в гене, которые связывают с ожирением, расположены в некодирующей части гена - интроне. Именно поэтому трудно объяснить функциональность самого гена. И, наконец, вышла свеженькая статья, где раскопали, как эти проводки между собой связаны. Оказалось, что на ДНК, которая вовсе не шнурок, а клубок, эта некодирующих часть гена FTO делает петлю, которая и взаимодействует с промотором совсем другого гена Irx3, усиливая его экспрессию. А уже ген Irx3 непосредственно регулирует вес. Кодирующая часть гена FTO к ожирению отношения не имеет вообще.

Мышки, которых расстреляли их из дробовика у которых выключили ген Irx3, действительно худые и стройные, даже когда много едят и не много двигаются. Работает этот ген непосредственно в мозге мышей, подтверждая давно известный тезис -  предрасположенность к полноте расположена в голове.

Page 1 of 3 << [1] [2] [3] >>

Date: 2014-03-28 01:58 pm (UTC)
From: [identity profile] baron6011.livejournal.com
Вы не поверите, но только вчера порекомендовал коллеге прочитать статью про биолога и радио))

Date: 2014-03-28 01:58 pm (UTC)
From: [identity profile] vinsenty.livejournal.com
Вышел апрельский номер журнала "Вокруг света" с темой "Содержит ГМО" и вашим интервью.
Image

Date: 2014-03-28 02:01 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
О! Интересно. Спасибо.

Date: 2014-03-28 02:02 pm (UTC)
From: [identity profile] lazybear.livejournal.com
Интересно, спасибо! Интересно, а всё-таки в голове расположена предрасположенность больше есть, меньше двигаться или как-то по другому перерабатывать поступающие калории, что они перестают откладываться?

Date: 2014-03-28 02:03 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Сильная статья. Маст рид.

Date: 2014-03-28 02:03 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Второе. Как-то по другому перерабатывать поступающие калории, что они перестают откладываться.

Date: 2014-03-28 02:04 pm (UTC)
From: [identity profile] marina-fr.livejournal.com
Клёво.
Гарно!

Date: 2014-03-28 02:05 pm (UTC)
From: [identity profile] marina-fr.livejournal.com
А ссылочку можно?

Date: 2014-03-28 02:06 pm (UTC)
From: [identity profile] upjohn.livejournal.com
>у которых выключили ген Irx3

А Fat10 - это он же?

Date: 2014-03-28 02:07 pm (UTC)
From: [identity profile] lazybear.livejournal.com
Круто! Ну когда же вы (биологи), наконец, осчастливите человечество? :)

Date: 2014-03-28 02:08 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Нет, Fat10 - убиквитин, а Irx3 вроде фактор транскрипции, если я не ошибаюсь.

Date: 2014-03-28 02:09 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Ссылочку на что именно? Текст вроде весь перелинкован.

Date: 2014-03-28 02:09 pm (UTC)
From: [identity profile] upjohn.livejournal.com
Тогда предлагаю надеяться, что лекарств против ожирения будет в 2 раза больше!

Date: 2014-03-28 02:10 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Нуууу. Фактор транскрипции в иерархии круче убиквитина.

Date: 2014-03-28 02:16 pm (UTC)
From: [identity profile] quite-so-lovely.livejournal.com
У нас тут гомеопатия продаётся, работает на людях с сильным ожирением. При чём даже реальные клинисследования прошла. На людей с умеренным лишним весом не действует.

Date: 2014-03-28 02:17 pm (UTC)
From: [identity profile] geterogen.livejournal.com
Я так розумію, що коли знайдуть той білок, який цей Irx3 формує, то будуть ліки проти анорексії? :)

Схоже, нам з братом від бабці той Irx3 вимкнений дістався, бо що вона була шилом, що ми такі товстелезні... ))

Date: 2014-03-28 02:18 pm (UTC)
From: [identity profile] aosypov.livejournal.com
Руся, а тебе не встречалась где-нибудь хорошая критика той статьи со стороны биолога?

Date: 2014-03-28 02:19 pm (UTC)
From: [identity profile] dennis_chikin.livejournal.com
Ну, как бы, про те же, к примеру, инсулин/адреналин - не новость.
Вот еще бы чувствительностью к ним прицельно управлять...

Date: 2014-03-28 02:24 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Навпаки, у бабці був вимкнений, а ви десь мутацію в некодуючу частину FTO десь підхопили. Може від дідуся.

Date: 2014-03-28 02:26 pm (UTC)
From: [identity profile] geterogen.livejournal.com
"товстелезні" малось на увазі ))

Date: 2014-03-28 02:28 pm (UTC)
From: [identity profile] geterogen.livejournal.com
ага, а на людей с сильным с средним головным мозгом тоже не действует

Date: 2014-03-28 02:28 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Именно этой статьи - не встречалась. Идея статьи вовсе не описание подходов биологов, а голубые мечты о системной биологии. А системная биология хорошо, но это все еще пока мечты. Потому что вместо кропотливой экспериментальной работы по расстрелу приемников, системщики бросились компилировать из того, что есть. А есть всего-лишь 30% известных функций генов. И получается такой гигантский паззл с кучей белых пятен.

Date: 2014-03-28 02:29 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
ааааа, от щасливчики.

Date: 2014-03-28 02:31 pm (UTC)
From: [identity profile] bobra-zhelatel.livejournal.com
Да, объект исследования у биологов на порядок сложнее чем у технарей. С неочевидными и нерегулярными внутренними взаимосвязями. Популярные статьи и книги по генной инженерии и молекулярной биологии всегда читал как захватывающий детектив. Спасибо, что держите нас в курсе.
Page 1 of 3 << [1] [2] [3] >>

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 14th, 2026 02:41 pm
Powered by Dreamwidth Studios