Про Аватар.

[progenes]

Все посмотрели уже Аватар? Понравилось? А теперь смотрите сюда и слушайте. Если дело пойдет и дальше так, то фиг вы получите не только клонированных инопланетян, но и людишек даже в ближайшие тыщу лет!

Приблизительно в 2001 году у нас в группе стартовал проект по визуализации развития ячменного семени. Идея заключалась в том, чтобы накрошить семя на тонкие срезы, все заснять и сложить с помощью информатиков в 3D модель. Это программа-минимум. Программа-максимум заключалась в том, чтобы сделать точный анатомический атлас семени и интегрировать в модель места работы определенных генов. Лет пять бодались, получилась убогая картинка, которая не обогатила человечество знаниями ни на йоту. Вот такая.


Взяли на проект нового цитолога и новых информатиков, дали им лазер для нарезки. Накрошили и собрали модель чуток получше. Но показать вам ее я не могу, потому что биологи поссорились с информатиками по поводу на каком сервере вывешивать картинки - у нас в институте, или у них в недружественном университете. Пока не решат, человечество так и не узнает, что там в ячменном семени внутри. Впрочем, ничего нового там тоже не нашли, просто красиво. Я видела.

UPD: оказалось, что самые красивые картинки ньювасюковцы Pattern Recognition Group выложила у нас на сайте: Projects=>Automatic Generation of 3-D and 4-D Models. Выглядит душераздирающе.

Теперь касательно реализации программы-максимум про те гены, которые там работают. Я там каким-то боком, поэтому расскажу, меня прет. Вырезали лазером ткани очень махонькие из этих срезов. Выделили из них РНК и загибридизовали на ячменный чип на котором 43 тысячи генов. Звучит наверное очень красиво и удивительно. Но пока все интеллектуальные силы информатиков брошены на конструирование 3D-эффектов Аватаров, я тут обливаюсь горючими слезами. Я уже вижу, какие генные последовательности включились в этом гребаном семени, я головой и ручками в Экселе посчитала. Но как только я решила посмотреть, что именно это за гены, то тут (цензоред) меня ждало жестокое разочарование. Потому что из всех 43 тыщ генов автоматически определены едва 5%. А остальное 95% неидентифицированное нечто по 60 нуклеотидов длинной. И вот уже вторую неделю я терзаю всемирное биоинформатическое комьюнити в надежде, что может какая биоинформатическая сволочь их когда-то где-то определила, иначе все эти чипы (цензоред)коту под хвост. Мне "пшеничные" спецы смеются гомерически в лицо, потому что у них дела обстоят еще хуже, у них и этой информации нету.

А в это время, в Германии финансирование немецкого кинематографа больше, чем финансирование науки. А бюджет одного голливудского Аватара будет поболе финансирования всей мировой биоинформатики. Поняли? Так что клонированные аватары в ближайшем будущем только в кино.

Comments

[progenes.livejournal.com]

Вот у меня тоже сильное подозрение, что весь прогресс кино и ограничится. Ладно бы у нас какой захудалый университетик, у нас как бы самая передовая мировая лаборатория по вопросу развития ячменного зерна. Круче уже нету. Возятся, секвенируют что-то, но таааак любительски все это смотрится на фоне голливудских флюоресцуирующих пейзажей.

[voidozer.livejournal.com]

Ну да, зато киношный аватар умеет приносить деньги прямо сейчас в отличии от научных проектов.

[btr-a.livejournal.com]

миллиардная выручка обязывает..
а тут когда ещё будет результат, и наплевать, что выручка будет поболее

[ex-tripgun357.livejournal.com]

прорвёмся. пока автора аватаров заказывают себе новое железо для художеств, "старое" становится более доступным. если так и дальше пойдёт, "семки рубить" можно будет и на телефоне.

[zametilprosto.livejournal.com]

Читал где-то, что Парк Юрского периода и последующая всемирная динозавромания резко увеличила ассигнования (частные в первую очередь) на палеонтологию.

Может, Аватар поможет клонированию ячменя?

[popol-v.livejournal.com]

Мда, обидно. Надо бы какую-нибудь войнушку устроить. Чтоб и гонка вооружений была, и противостояние систем. >_>

[maxim.livejournal.com]

Спочатку побудують мозок, а потім вже все інше.

[btr-a.livejournal.com]

не так уж и "черти сколько",
а про применение - может выведут ячмень, который на марсе посадят..

[802-11.livejournal.com]

Модель просто шикарная, спасибо за ссылку.

Да, бюджеты это здорово. Особенно в сравнении. А у вас нет случаем точных цифр/источника насчет
>в Германии финансирование немецкого кинематографа больше, чем финансирование науки. А бюджет одного голливудского Аватара будет поболе финансирования всей мировой биоинформатики.
?

[stetson-hat.livejournal.com]

Странно, неужели с растениями так плохо, что такая куча 60-к сделана с неидентифицированных генов? Даже не верится. Человеческие чипы тоже по 30-50 тысяч генов, но они все известны.

Кстати, только сегодня смотрел предметы ф-та биоинженерии МГУ по специальности "биоинженерия":

генной инженерии;
биоинженерии микроорганизмов, растений и животных;
клонирования и трансплантации клеток;
белковой инженерии;

так что клонировали, клонируют и будут клонировать!

[achernitsky.livejournal.com]

Как-то в 70 я молодым специалистом попал на конференцию по эмбриологии. Так там одна бабулька показывала трехмерные реконструкции эмбрионов на ранних стадиях, которые она из тончайшем проволоки ваяла.

И никаких компьютеров

Re: не так уж и "черти сколько",

[btr-a.livejournal.com]

учитывая то, что атомы были ещё "открыты" древними греками в 5 веке, то 60 лет ничто

[progenes.livejournal.com]

(сойдите, пожалуйста, с больного мозоля) Как только появится нормальная аннотация ячменного чипа, я дам знать. Это при том, что уже из стен инстутута выпорхнула парочка биоинформатический профессоров, защитилась дюжина постдоков, но до сих пор (цензоред) нормального человеческого тула для анализа чипов не разработали. Я своими ручками держала за горло несколько живых биоинформатиков на тему "дайте, суки, скрипт, а то задолбалась в экселе считать", но они выдрались из моих лап живыми.

[progenes.livejournal.com]

Точно ссылки нет, это днями тут по коридору один немецкий завлаб бегал с газетой и гневно вопил. Я с его слов.

[progenes.livejournal.com]

Во-во, наши цитологи картинки компилируют каким-то софтом-обносками с развлекательных порталов.

[progenes.livejournal.com]

Некоторые лобзиком выпиливают.

[progenes.livejournal.com]

Щось мені підказує, що мозок будують приблизно так само, як і модель насіння.

[progenes.livejournal.com]

(мрачно) разве что клонированию инопланетян поможет

[802-11.livejournal.com]

Ох, вот это да. Трехмерный принтинг, вручную, из проволоки. Карго-культ наоборот.
Но знаете, советские "бабульки" и "дедульки" из этого ряда это вообще была такая армия классных спецов по деланию сумасшедших вещей из ничего. Армия умов, которую "мы" потеряли.

[802-11.livejournal.com]

А, понятно. Ну ничего, думаю, можно поискать цифры и нарисовать их даже при возможности. Спасибо.

[802-11.livejournal.com]

Оу, с газетой. Интересно, с какой. А не сгонять ли мне в Дрезден за газетой :з (я тут в Праге рядом).

[progenes.livejournal.com]

Откровенно говоря мне самой интересно. Я было сунулась посмотреть источники финансирования и бюджет немецкой науки, но там так все хитро запутано, что было лень разбираться. У меня тут ячменные гены все ресурсы в голове заняли.

[802-11.livejournal.com]

Понимаю. Буду гуглить.)

[pogorily.livejournal.com]

Общество спектакля.
===
И уж истинный упадок претерпевал здравый смысл. В Соединенных Штатах стали считать выдающимися людьми артистов развлекательного жанра и профессиональных атлетов. Им поклонялись и видели в них лидеров: они высказывали свое мнение по самым разным вопросам и относились к себе столь же серьезно, как и все окружающие. В конце концов, если спортсмену платят больше миллиона в год, почему бы ему не считать себя важной персоной... а стало быть, всем интересно знать его мнение о внутренней и внешней политике, хотя он выдает свое невежество и безграмотность всякий раз, едва открывает рот. Ведь большинство его фанатов столь же невежественны и безграмотны - болезнь прилипчива.
===
Хайнлайн "Уплыть за закат".

У меня есть смутное, но все крепнущее убеждение, что эта цивилизация обречена. Что она разделит судьбу Римской империи, которая пала под довольно слабыми ударами варваров, истинная причина ее падения - сгнила изнутри. И вместе с ней пала вся античная цивилизация. Византия и арабы (которых числят в "преемниках" античности) - это совсем другое.

Кстати, наша наука - преемник арабской (которая в свою очередь преемник античной).
Не зря алгебра - аль-джебр, алкоголь - аль-кехаль, аглоритм от имени Аль Хорезми, астрономических терминов арабского происхождения и не сосчитать. И все это рухнуло в транду. Дикие, невежественные нынешние мусульмане - потомки тех самых, кто двигал знание и прогресс когда-то (не все они были арабами, науку двигали и в Средней Азии, и в других местах - всюду куда арабы принесли ислам, от Аму-Дарьи на западе до Испании на востоке).

[intracer.livejournal.com]

А самому (with little help from your friends) написать и в опенсорс выложить?