Про геномы

[progenes]

С большим удивлением обнаружила сегодня в новостях ликование про полное секвенирование генома сои. Думаю, что за фигня - месяца три как последовательности открыты и в свободном доступе для всех жаждущих, а может и раньше, чем три месяца, но раньше мне дела до них не было. Я уже успела натягать оттуда нужных мне сиквенсов и докторант даже гены по ним наклонировал. А теперь оказывается это в Нейчер наконец опубликовали. Ну что ж, вполне логичный ход событий: сначала последовательности, потом научная публикация, потом ликование в прессе.

Но бывает и по-другому. Тут мне в комментариях подсказывают, намедни секвенировали россиянина (в прошлом году было это намедни). Вроде дело было в РНЦ «Курчатовский институт» в центре конвергентных нано-био-инфо-когнитивных (НБИК) наук и технологий. Так вот, поулюлюкали эти нано-био-инфо, а статьи научной нет, как нет и доступа до геномных последовательностей. Селяви.

Comments

[progenes.livejournal.com]

(украдкой утирает краешком халата невольно накатившуюся слезу умиления) Комбинирование двух технологических платформ, говорите?

[staroobrad.livejournal.com]

Я крайне далёк от всего этого, просто на днях видел журнал оный, а поскольку тов. Прохорчук и Ко пишут и про генетические особенности староверов, я себе списал ссылку.

все жирнее и жирнее!

[progenes.livejournal.com]

пишут и про генетические особенности староверов?!!! дайте почитать!

Re: все жирнее и жирнее!

[staroobrad.livejournal.com]

Про староверов слышал в одном из интервью, посему и заинтересовался. Нашёл статью, но там про наших ничего не написано - она сугубо научная.
А поскольку я человек крайне далёкий от Вашей тематики, то статью себе не скопировал.
Кстати, скажите мне как человеку несведующему:
1. Все в данном постинге команду Прохорчука ругают. Почему?
2. Почему Вы сомневаетесь в результатах исследований? Во всяком случае мне так показалось.

[batch2k.livejournal.com]

Комбинирование — в том смысле, что геном прочтен на двух аппаратах — от Applied Biosystems и от Illumina. В Курчатнике закупили массу сверхдорогостоящего оборудования, на котором некому работать, и оно стоит там, пылится. Так что эта их работа -фактически первая, просто калибровочная считай. Поэтому в статье, кстати, нет вообще никаких попыток анализа прочтенного — только технические моменты, касающиеся длин фрагментов, степени покрытия, доли ошибок, числа SNP и т. д. (Видимо, более подробная статья, предназначенная уже для более рейтингового журнала, еще готовится.)

А насчет того, что последовательность не выложена в интернет, в статье написано, что выложена: на сайте russiangenome.ru (http://russiangenome.ru/). Правда, там написано, что сайт в разработке:-(