![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesС большим удивлением обнаружила сегодня в новостях ликование про полное секвенирование генома сои. Думаю, что за фигня - месяца три как последовательности открыты и в свободном доступе для всех жаждущих, а может и раньше, чем три месяца, но раньше мне дела до них не было. Я уже успела натягать оттуда нужных мне сиквенсов и докторант даже гены по ним наклонировал. А теперь оказывается это в Нейчер наконец опубликовали. Ну что ж, вполне логичный ход событий: сначала последовательности, потом научная публикация, потом ликование в прессе.
Но бывает и по-другому. Тут мне в комментариях подсказывают, намедни секвенировали россиянина (в прошлом году было это намедни). Вроде дело было в РНЦ «Курчатовский институт» в центре конвергентных нано-био-инфо-когнитивных (НБИК) наук и технологий. Так вот, поулюлюкали эти нано-био-инфо, а статьи научной нет, как нет и доступа до геномных последовательностей. Селяви.
Но бывает и по-другому. Тут мне в комментариях подсказывают, намедни секвенировали россиянина (в прошлом году было это намедни). Вроде дело было в РНЦ «Курчатовский институт» в центре конвергентных нано-био-инфо-когнитивных (НБИК) наук и технологий. Так вот, поулюлюкали эти нано-био-инфо, а статьи научной нет, как нет и доступа до геномных последовательностей. Селяви.
Tags:
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
no subject
Date: 2010-01-15 09:02 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:05 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:07 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:35 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 03:57 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:00 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:18 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:32 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:01 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:03 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:09 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:11 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 12:47 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 12:47 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:12 am (UTC)А проанализировать традиционно сами не могут.
p.s. А публиковать собираются в Acta Naturae , что так же очень подозрительно.
no subject
Date: 2010-01-15 09:55 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 10:27 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 10:48 am (UTC)Впрочем, с зарубежными коллегами тоже всяко бывает. Я тут охочусь за одной статьёй в PNAS. Статья эта была в другой статье цитирована как in press ещё осенью. С тех пор на сайте PNAS её нет как нет...
no subject
Date: 2010-01-15 03:38 pm (UTC)Есть.
Скрябин К.Г., Прохорчук Е.Б. и др. Комбинирование двух технологических платформ для полногеномного секвенирования человека // Acta Naturae, #3, стр. 113 - 119.
no subject
Date: 2010-01-15 04:03 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:50 pm (UTC)все жирнее и жирнее!
Date: 2010-01-15 05:02 pm (UTC)Re: все жирнее и жирнее!
Date: 2010-01-18 07:50 am (UTC)А поскольку я человек крайне далёкий от Вашей тематики, то статью себе не скопировал.
Кстати, скажите мне как человеку несведующему:
1. Все в данном постинге команду Прохорчука ругают. Почему?
2. Почему Вы сомневаетесь в результатах исследований? Во всяком случае мне так показалось.
no subject
Date: 2010-02-13 08:33 pm (UTC)Комбинирование — в том смысле, что геном прочтен на двух аппаратах — от Applied Biosystems и от Illumina. В Курчатнике закупили массу сверхдорогостоящего оборудования, на котором некому работать, и оно стоит там, пылится. Так что эта их работа -фактически первая, просто калибровочная считай. Поэтому в статье, кстати, нет вообще никаких попыток анализа прочтенного — только технические моменты, касающиеся длин фрагментов, степени покрытия, доли ошибок, числа SNP и т. д. (Видимо, более подробная статья, предназначенная уже для более рейтингового журнала, еще готовится.)
А насчет того, что последовательность не выложена в интернет, в статье написано, что выложена: на сайте russiangenome.ru (http://russiangenome.ru/). Правда, там написано, что сайт в разработке:-(
no subject
Date: 2010-01-15 04:33 pm (UTC)Забавно, забавно. :-))
no subject
Date: 2010-01-15 03:52 pm (UTC)http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=372493
no subject
Date: 2010-01-15 04:00 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:09 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:11 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:16 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 04:17 pm (UTC)Аааааааааа!
Date: 2010-01-15 04:34 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 05:38 pm (UTC)Полное в прямом смысле, или так же, как с Homo Sapiens? Там уже несколько лет назад ликовали, что геном полностью прочли. А если глянуть хорошо (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/assembly/grc/human/), так еще процентов 10 не секвенировано и до сих пор.
Или у растений нет участков, с трудом поддающихся современным методам секвенирования?
no subject
Date: 2010-01-15 05:45 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 06:01 pm (UTC)Чего там такого может быть в российском геноме? Лучше бы какого-нибудь нганасана или нифха. Их осталось всего ничего, беречь надо.
no subject
Date: 2010-01-15 10:25 pm (UTC)http://riftsh.livejournal.com/118790.html
простыми словами
Date: 2010-01-16 05:50 am (UTC)Считаю долгом проинформировать, т.к. при ТАКОЙ масштабной аудитории, быть может, нужно и замечание самого автора - то бишь Вас.
Re: простыми словами
Date: 2010-01-16 05:56 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-20 12:20 pm (UTC)http://www.myconservatives.com/campaigns/return-my-dna
Якщо вже бачили, то вибачаюсь.
no subject
Date: 2010-01-20 12:21 pm (UTC)