[personal profile] progenes
Кому опять охота почитать про актуальные проблемы ГМО жмет сюда.

1. Африка, Кения, засуха, голод и ГМО.

В Кении опять жарко, сильнейшая засуха за последние 60 лет. Цены на кукурузу подпрыгнули на 160%. Народ натурально голодает. Однако в 2009 году Кения приняла анти-ГМО закон. Не-ГМ кукуруза может завозиться с соседних африканских стран, но денег нет. Можно покупать ГМ-кукурузу дешевле на 30%, но есть закон. Кенийский парламент недавно разрешил ввоз ГМО кукурузы в виду голода. Понятно, что такое решение вызвало кучу возражений. Вот, что об этом думает кенийский science journalist Kimani Chege. Примечательны комментарии к заметке: опять дают ссылки на ермаковских хомяков.

Один из анти-ГМО аргументов - опять таки зловредная Монсанта, которую хлебом не корми, дай кого-то поработить с помощью ГМО. “Farmers demand a stop to importation of GM maize. Patented seeds and chemical fertilizers threaten the livelihood of smallholders”, said Lavi. И дальше... Нет, вы почитайте! Это просто замечательно, какой дальше черт спрятался в мелочах. Цитирую...

"Meanwhile, in America, Monsanto opened its newest corn breeding facility today in Othello, WA on Wednesday July 6. The new 15,000 square-foot facility, which employs five full-time and approximately 100 part-time and seasonal workers, is the first of its kind for Monsanto in the United States. The breeding station will be devoted exclusively to using double haploid advanced breeding technology to help Monsanto’s breeders provide better corn seeds for farmers. Within the next 10 years, about 50 percent of new corn lines in North America will have gone through Othello."

Вот какой вывод напрашивается неискушенному читателю? Ну, типа, нам, африканцам, всякое ГМО подсовывают с целью заставлять ежегодно покупать семена, а сами хороший advanced newest corn breeding facility безо всякого ГМО. Так вот, знаете, что такое double haploid и зачем он? Это чистая линия, которая используется для скрещивания для проявления в первом поколении эффекта гетерозиса, о котором я раньше писала. "better corn seeds for farmers" - это гетерозисные семена, которые что? Надо покупать каждый год.

2. Бразилия и ГМО.
Аграрии Бразили взяли уверенный курс на интродукцию ГМО в сельском хозяйстве. На поля допущено 3 вида растений с 16тью модификациями. Только в этом году разрешение получили 5 новых трансгенных сорта. За четыре года площади с трансгенной кукурузой удвоились. А в этом году труженики Бразилии достигли новых рекордных показателей в посевах ГМО. В процентах от всех площадей 82,7% засеяно трансгенной соей, 64,9 % трансгенной кукурузой (в 2008 году 5%) и 39,7% трансгенным хлопчатником. Использование достижений современной биотехнологии позволило удвоить годовую продукцию зерновых и повысить благосостояние трудящихся: 90% фермеров, возделывающих ГМО культуры содержат мелкие фермерские хозяйства.

3. А в это время в Германии...
за первенство в борьбе против ГМО схлестнулись две партии - "зеленые" и NPD (ультра-националисты). Дело происходит на Саксонщине в округе Майсен, где в местный парламент 5 мест в предвыборной борьбе отвоевали бравые национал-демократы, обогнав при этом на одно место зеленых. В тяжелой предвыборной борьбе в 2008 году зеленые подняли на знамена запрет трансгенной кукурузы на Саксощине. Впрочем, им пришлось посостязаться на этом электоральном поле, поскольку национал-демократы тоже как бы против трансгенной кукурузы на Саксонщине. Мало того, уже будучи в парламенете, NPD перехватили инициативу и выдвинули законопроектик. И тут случился казус - благородный порыв национал-демократов никто в местном парламенте не поддержал. В связи с этим национально-озабоченные парламентарии написали гневную статью в свою газету, где призывают "зеленых" к ответу. Статья называется "GRÜNE im Kreistag Meißen offensichtlich für den Anbau gentechnisch veränderter Lebensmittel" "Зеленые в парламенте Майсена очевидно ЗА возделывание ГМО".
Tags:

По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 01:25 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
С чего начать?
Ну - давайте начнём с сайта Маркова и обзоров - чтобы не лезть в школьные учебники:

macroevolution.narod.ru/zh_lamark.pdf

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 01:36 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Сначала вы прочитаете статью по метилированию, на которую я дала вам ссылку.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 01:51 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Полный текст обязательно читать? ;)

Individual Article (Electronic Only)
EUR 34.95

Насколько я понял из аннотации статьи, Вы с соавторами показали, что за метилирование ДНК ячменя при развитии семени отвечают ферменты, деятельность которых регулируется генами-регуляторами более высокого уровня.

И? Что из этого следует?

Книга всё равно пишет сама себя - и за экспрессию генов-регуляторов тоже кто-то должен отвечать. Кто это, как не внешняя среда?

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:13 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
"Синтез, локализация и работа факторов транскрипции часто регулируется принятием молекулярных сигналов извне. Например, в клетку поступил сигнал - атака патогена или гормон. Он воспринимается какими-то рецепторами на поверхности клетки (которые тоже гены). Дальше, вроде падающих домино-фишек, сигнал передается молекулярному каскаду (которые тоже гены) до ядра и включает синтез нужных факторов транскрипции (напоминаю, это тоже гены), которые потом включают ген Х, продукт которого может непосредственно влиять на патоген."

Да вы матушка, скрытая неоламаркистка... ;)

Про CRISPR-кассеты можете сказать своё мнение?
Я пока эту статью с polit.ru нашёл, думал чёкнусь.

Ведь это же чистый ламаркизм по схеме среда->белок->РНК->ДНК.
Гнуснейшее нарушение центральной догмы молекулярной биологии. ;)

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:17 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
во всяком случае с тех пор, пока я занимаюсь биологией, то есть последние 20 лет, никто даже не пытался утверждать, что окружающая среда не играет роли в реализации генетической информации. генетическая программа ВСЕГДА разворачивается в окружающей среде.

мне кажется, что у вас какие-то неправильные представления о современной молекулярной биологии и генетике

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:23 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Ну - насчёт моих представлений насчёт современной молекулярной биологии - я не знаю - со стороны виднее.

Навроде бы как центральная догма пока стоит:
http://en.wikipedia.org/wiki/Central_dogma_of_molecular_biology

Белку пока отказано в праве воздействия на РНК, а тем более - на ДНК.
Хотя химия и здравый смысл при этом нервно курят в сторонке. ;)

Просто наши с Вами трехдневные пляски касательно ГМО-еды и бактерий - они как раз тоже вокруг этой идеи незримо крутятся.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:28 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
http://progenes.livejournal.com/1468.html#cutid1

нигде они не крутятся. смотрите. условия внешней среды. стресс. родители наметилировали допустим даже гены, которые помогут потомкам пережить этот стресс. есть конкретные примеры: радиация, активируются реперативные системы (можно померять) в помощью метилирования и передаются потомкам. это как бы "подготовка" детей к повышенной радиации. но если больше радиационный фон не поднимать, а выращивать "детей" в нормальных условиях, то эта активация сохраняется 4 поколения максимум, при этом постепенно сходит на нет. вот и весь ламаркизм. это кратковременно фиксируемые в поколениях эффекты.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:40 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
А если негативные условия сохранятся во втором и в последующих поколениях?
Как быть с опытами Шапошникова, который издевался на тлями, растя их на жутко непригодном субстрате в партеногенетических линиях и таки получил новый вид?

Просто признавая "длительные модификации" генома до признания обратного воздействия белок->ДНК уже один шаг.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 02:58 pm (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Непригодный субстрат - это новые условия среды. Берем бактерии и выращиваем их в новых условиях. Какая-то часть мутирует и наиболее приспособленные выживают. Чем этот опыт отличается от известных бабочек на закопченных березах индустриальной Англии?

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 03:19 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Очень быстро, направленно и в партеногенетических линиях:

http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9E%D0%BF%D1%8B%D1%82%D1%8B_%D0%93._%D0%A8%D0%B0%D0%BF%D0%BE%D1%88%D0%BD%D0%B8%D0%BA%D0%BE%D0%B2%D0%B0_%D0%BF%D0%BE_%D0%B8%D1%81%D0%BA%D1%83%D1%81%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%B9_%D1%8D%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D1%8E%D1%86%D0%B8%D0%B8

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-08-31 03:22 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Хотя - в случае Шапошникова и тлей можно и поспорить, что там творилось у них в геноме.
Не было у Шапошникова тогда генных секвенторов. ;)

А вот случай со Streptococcus thermophilus и его CRISPR-кассетами - так там даже молекулярный механизм нарушения центральной догмы известен.
Вот тут интересен Ваш комментарий.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-01 07:55 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Кстати, с тлями недавно выяснилась ещё одна замечательная подробность:

http://elementy.ru/news/431313?page_design=print

Гены синтеза каротиноидов они получили путём горизонтального переноса от грибов.
И, если в случае малярийного комара и его плазмодия и оппосума и кровососущего жука горизонтальный перенос произошёл, судя по всему, во время длительного "сожительства" видов, то в случае с тлями, насколько я понял из обзора, непонятно, насколько тесно тля сожительствовала с грибком, который наделил её столь ценным приобретением.

Так что - я бы не зарекался по-поводу того, что горизонтальный перенос генов "невозможен" или "маловероятен". Насколько я понимаю, при увеличении количества прочтённых геномов количество таких доказанных горизонтальных переносов будет только возрастать, причём не только в случае прокариотических клеток, но и эукариотов - тоже.

А если учесть, что 70% ДНК, секвентируемого из различных сред, вообще не опознаётся, как принадлежащая каким-либо известным прокариотам, то, насколько я понимаю, достаточно большой сегмент бактерий и вирусов до сих пор находится для учёных в "серой" зоне, о которой они вообще мало что знают.

PS.
Знание-сила.
Просто надо копать глубже и откидывать землю подальше. :)

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-25 01:15 pm (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
CRISPR-кассеты реализуют ламарковый механизм на вполне себе эволюционной основе.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-26 07:13 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Я нигде не отрицал значения современной теории эволюции. ;)
Я лишь подчеркнул, что не стоит подходить к ней догматически.
Воображаемая картина того, что ДНК организма заключено в некой недоступной "башне из слоновой кости", которая стоит, подобно незыблемому гранитному утёсу в бушующем океане среды, как минимум идеалистича.

Если столь примитивные организмы, как бактерии, реализовали столь изощрённые ламарковские механизмы воздействия на свой геном, как CRISPR-кассеты, это лишь показывает, что у всех организмов вполне возможно существование пока неоткрытых регуляторных последовательностей в геноме.

Просто, скорее всего, у высших эукариот, в силу очень высокой сложности их генома, и регуляторные механизмы для учёта влияния среды должны быть достаточно изощрёнными.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-27 06:16 pm (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
Как бы не относиться к CRISPR-кассетам - да, они действуют по ламарковским принципам, но всё же по чисто молекулярно-биологическим механизмам.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-28 07:39 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Конечно, по молекулярно-биологическим механизмам. :)
Глупо сейчас тянуть в современность из классического ламаркизма XIX века "безусловное стремление организмов к совершенству", теорию пяти флюидов или отрицание вымирания видов.
Мой комментарий касался, если Вы посмотрите выше, исключительно проблеме нарушения Центральной Догмы.
В случае CRISPR-кассет она нарушается. Причём - в явном виде.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-09-30 03:03 pm (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
Насколько я понимаю механизмих действия CRISPR, здесь всё же не происходит передачи генетической информации от белка в ДНК, что подразумевает центральная догма МБ. Ламаркизм здесь заключается в "научении" путём поглощения генетического кода бактериофагов, то есть передача информации по типу ДНК -> ДНК - что догме не противоречит.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-07 10:08 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Да, согласен. Увлёкся и протупил.
Но механизмов нарушения центральной догмы уже накопано немало. Вот, как пример:
http://shvarz.livejournal.com/302737.html

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-07 02:48 pm (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
Так опять же ж - здесь нет передачи информации от белка к ДНК; есть лишь процесс модификации уже готовой ДНК вируса; обычная работа фермента.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-07 03:02 pm (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
С точки зрения теории информации это не играет никакой роли.
Нет белка - информация копируется без проблем, есть белок - информация в ДНК модифицируется. Есть белок-антагонист - информация опять-таки копируется без проблем.
Дальше можете составить двоичную матрицу 00, 01, 10 и 11 и понять, что само по себе размножение/неразмножение вируса уже несёт в себе информацию о белке. :)

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-09 07:36 am (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
Нет уж, давайте разговаривать в одном терминологическом поле. Центральная догма говорит о чём? о невозможности передачи информации от белка к нуклеиновых кислотам. В данном случае, передаётся ли информация? нет, наоборот, белок действует как фермент, фактически ДНКаза, которая режет ДНК на части. Информация не передаётся - нарушения догмы нет. Раньше думали, что догму нарушают прионы, но сейчас известно, что в их размножении нуклеиновые кислоты вовсе не участвуют.

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-10 06:35 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Нет, она его на части не режет.
Белок заменяет основание цитидин в ДНК вируса на урацил.
Безусловно, с точки зрения "осмысленности" данного действия белок делает дурацкую операцию, но по факту, согласно теории информации, он передаёт информацию в ДНК.

Для понимания того, что происходит - представьте себе, что солнце светит на ваш дом, а вы читаете книгу в комнате. Внезапно, около полудня, свет исчезает. Ваше заключение? Что-то закрыло свет солнца - либо густая туча, либо луна в новолуние. ;)

Сама туча является источником света? Нет.
Вы получили информацию? Да.
Какое количество информации вы получили? 1 бит. (да/нет)
Почему не больше? Потому что для того, чтобы понять, что случилось (гроза или затмение) - надо выйти наружу и посмотреть.
Дальше - выходите

Re: По поводу неоламаркизма

Date: 2011-10-10 04:26 pm (UTC)
From: [identity profile] ilya-gie.livejournal.com
Ну, с точки зрения теории информации, происходит не передача информации, а её уничтожение: была смысловая последовательность - стала бессмысленная. Энтропия увеличилась. Следовательно, догма не нарушена (хотя сама по себе догма не так уж и важна).

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 17th, 2025 10:33 am
Powered by Dreamwidth Studios