[personal profile] progenes
Небольшой отрезвляющий пост для любителей транскриптома. Подобную информацию уже где-то раньше встречала, но не помню где и, кажется, неполную. А тут опять наткнулась в Genom express. Пусть теперь тут лежит.

Поситали, значит, мРНКу и белочки, которые с нее считываются. Вот что обнаружилось (прошу прощения за корявый перевод, некогда возиться):


Как мы видим, выраженная в цифрах скорость транскрипции в этой эпической картине занимает весьма скромное место: происходит медленно, быстро валится, а при этом трансляция разворачивается во всей своей красе. Самое вкусненькое, конечно же, происходит между тыщами белочков , которые находятся в один момент в клетке (не перестаю удивляться: куда это все помещается?!), что-то делают: синтезируют, передают сигналы и молекулы, строят комплексы, что-то разрушают, куда-то встраиваются, катализируют, связываются, транспортируются из клетки, в клетку, в разные части клетки и тыды и тыпы.

В этом смысле, регуляция трансляции привлекает все больше внимания.

По материалам Schwanhausser, B. et al. (2011) Global quantification of mammalian gene expression control. Nature

Date: 2011-10-14 08:25 am (UTC)
From: [identity profile] potan.livejournal.com
Итересно, хоть одна клетка додумалась хранить мРНК что бы по сигналу нужный белок синтезировать?

Date: 2011-10-14 08:36 am (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
навалом. Белки которые надо по первому писку синтезировать, например при реакции на заражение вирусом.

Date: 2011-10-14 08:53 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Насколько я знаю, такие мРНК никто не хранит.
Многие антивирусные белки (те же интерфероны) напрочь отрубают у клетки программу "плодись и размножайся". Поэтому хранить такую дрянь иначе, нежели в неактивном гене собственного ДНК, себе дороже. :(
Кроме того, интерфероны ещё и мРНК гнобят своим присутствием, так что там процесс вообще с обратной связью.

С другой стороны, у прокариот "транскрипция-трансляция" - это вообще один процесс, поэтому там вообще никто мРНК не хранит - она сразу готова идти в рибосому и нести в цитоплазму "разумное, вечное, доброе".

Date: 2011-10-14 11:00 am (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
Интерфероны хранятся в виде насплайсованого РНК, который параллельно душит собственную трансляцию. Как только механизм удушения оттягивается на антивирусную реакцию, в клетке случается интерфероновый взрыв и перекрывание всего возможного синтеза белка кроме cap-independent. Для этого существует фигня под названием IRES.
про прокариоты мы здесь вообще не говорим, там все проще, на то они и простейшие :)

Date: 2011-10-14 11:10 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
О как. Какой элегантный механизм.
Век живи, век учись.

А кроме интерферонов - кто ещё для себя хранит "в загашнике" свою мРНК?

Date: 2011-10-14 11:14 am (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
так на вскидку не скажу, просто интерфероны на соседнем столе гоняли. Но они неодиноки. Любой белок быстрого реагирования так или иначе хранится в виде РНК. Начинать бодягу с транскрипцией - слишком долго, держать в виде белка слишком накладно - в клетке и так не протолкнуться. А так вынимаешь из кармана РНКу и давай строчить транскрипцией.

Date: 2011-10-14 08:40 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
А как их хранить? РНК достаточно нестойкая структура, любой худо-бедно активный фермент её быстро разрушает. :(
Для того же ДНК и придумала жизнь, чтобы с РНК не париться.

Хотя вирусы РНК в качестве носителя вовсю используют, но у них код короткий, ему лишние перестановки и искажения часто только на пользу идут - отбор быстро фиксирует нужное и отсекает нежизнеспособные варианты.

А вот бактерии и особенно эукариоты пошли по другому пути - для них важно позасовывать в ДНК побольше всяких возможностей, а потом их управляемо оттуда извлекать.

Date: 2011-10-14 08:44 am (UTC)
From: [identity profile] potan.livejournal.com
Деградация ДНК - процесс управляемый. Можно связывать ее с белком, который защитит от ферментов и рибосом, а по сизналу будет отцепляться.

Date: 2011-10-14 08:55 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Наверно, скорее "деградация РНК".

Date: 2011-10-14 09:17 am (UTC)
From: [identity profile] potan.livejournal.com
Опечатался.

Date: 2011-10-14 08:48 am (UTC)
From: [identity profile] murrka.livejournal.com
полураспад РНК глобина более 24-х часов

Date: 2011-10-14 09:00 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Я сравнивал время жизни мРНК и ДНК и белков.
По факту - самое "живучее" соединение ДНК.
Потом следуют белки, потом - связанная РНК, потом - свободная РНК.
Меньше всего живут всякие мелкие молекулы - навроде того же АТФ.
У него вообще время жизни минутами измеряется, пока её кто-то в АДФ не уконтрапупит ;)

Date: 2011-10-14 09:01 am (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Вы сравнивали? А как вы сравнивали?

Date: 2011-10-14 09:09 am (UTC)
From: [identity profile] crustgroup.livejournal.com
Разумеется - по книжкам и источникам.
"Биохимию человека" Марри, Греннера и Родуэлла вот почитываю. :)
Я же писал - я не профессионал, а любитель. Просто любитель.

Date: 2011-10-14 09:14 am (UTC)
From: [identity profile] progenes.livejournal.com
Это похвально, но есть исключения из правил - очень стабильные белки. Опять таки, идея сохранения отдельных матричных РНК волнует умы уже давно.

Date: 2011-10-14 11:33 am (UTC)
From: [identity profile] mfreidin.livejournal.com
Есть такие ядерные спеклы. Так хранятся мРНК, которые затем по первому зову....

Profile

progenes: (Default)
progenes

March 2025

S M T W T F S
      1
2345678
9101112131415
1617 1819202122
23242526272829
3031     

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 14th, 2025 04:40 am
Powered by Dreamwidth Studios