![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesНебольшой отрезвляющий пост для любителей транскриптома. Подобную информацию уже где-то раньше встречала, но не помню где и, кажется, неполную. А тут опять наткнулась в Genom express. Пусть теперь тут лежит.
Поситали, значит, мРНКу и белочки, которые с нее считываются. Вот что обнаружилось (прошу прощения за корявый перевод, некогда возиться):
Как мы видим, выраженная в цифрах скорость транскрипции в этой эпической картине занимает весьма скромное место: происходит медленно, быстро валится, а при этом трансляция разворачивается во всей своей красе. Самое вкусненькое, конечно же, происходит между тыщами белочков , которые находятся в один момент в клетке (не перестаю удивляться: куда это все помещается?!), что-то делают: синтезируют, передают сигналы и молекулы, строят комплексы, что-то разрушают, куда-то встраиваются, катализируют, связываются, транспортируются из клетки, в клетку, в разные части клетки и тыды и тыпы.
В этом смысле, регуляция трансляции привлекает все больше внимания.
По материалам Schwanhausser, B. et al. (2011) Global quantification of mammalian gene expression control. Nature
Поситали, значит, мРНКу и белочки, которые с нее считываются. Вот что обнаружилось (прошу прощения за корявый перевод, некогда возиться):
Как мы видим, выраженная в цифрах скорость транскрипции в этой эпической картине занимает весьма скромное место: происходит медленно, быстро валится, а при этом трансляция разворачивается во всей своей красе. Самое вкусненькое, конечно же, происходит между тыщами белочков , которые находятся в один момент в клетке (не перестаю удивляться: куда это все помещается?!), что-то делают: синтезируют, передают сигналы и молекулы, строят комплексы, что-то разрушают, куда-то встраиваются, катализируют, связываются, транспортируются из клетки, в клетку, в разные части клетки и тыды и тыпы.
В этом смысле, регуляция трансляции привлекает все больше внимания.
По материалам Schwanhausser, B. et al. (2011) Global quantification of mammalian gene expression control. Nature
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2011-10-14 07:12 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:14 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:16 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:17 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:17 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:18 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:19 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:22 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:27 am (UTC)10 тыщ активных мРНК (минимум, а по-хорошему все 45 000 исходя из "периода полураспада") в час продуцируют (потенциально) 400 000 копий белка в час.
Даже если за сутки половина беков деградирует, много чего останется.
Кроме того, ещё один вопрос - 16 000 уникальных видов белков? И, наверное, не все продуцируются только в специфицеской клетке?
no subject
Date: 2011-10-14 07:29 am (UTC)2. Все сложно.
3. Если кто-то с умным видом рассуждает об экспрессии генов, можно с не менее умным видом заявить, что от экспрессии до функции белка большая такая пропасть. п.1 и п.2.
4. Обыватель, береги свои белки!
no subject
Date: 2011-10-14 07:33 am (UTC)...а также жирки и углеводики.
no subject
Date: 2011-10-14 07:39 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:41 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:43 am (UTC)страница 10
no subject
Date: 2011-10-14 07:43 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:48 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:57 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:25 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:25 am (UTC)Экспрессия гена всё же подразумевает появление продуктов транскрипции и трансляции, как ни крути.
Другой вопрос, что не факт, что эти продукты - особенно белки - обязательно в данной конкретной клетке смогут на что-либо влиять.
Например, я слабо себе представляю, на что могут повлиять белки-опсины на что-либо в функционале обычных клеток печени. :)
Хотя, насколько я понимаю, те генетики их уже активно используют в своей работе, например, вот так:
http://elementy.ru/news/431615
no subject
Date: 2011-10-14 08:29 am (UTC)как при этом мы не развалились - для меня загадкО.
(я понимаю, что размеры клетки наиболее приспособлены для броуновского движения, но тем не менее)
no subject
Date: 2011-10-14 08:34 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:36 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:40 am (UTC)Для того же ДНК и придумала жизнь, чтобы с РНК не париться.
Хотя вирусы РНК в качестве носителя вовсю используют, но у них код короткий, ему лишние перестановки и искажения часто только на пользу идут - отбор быстро фиксирует нужное и отсекает нежизнеспособные варианты.
А вот бактерии и особенно эукариоты пошли по другому пути - для них важно позасовывать в ДНК побольше всяких возможностей, а потом их управляемо оттуда извлекать.
no subject
Date: 2011-10-14 08:44 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:48 am (UTC)