![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesНебольшой отрезвляющий пост для любителей транскриптома. Подобную информацию уже где-то раньше встречала, но не помню где и, кажется, неполную. А тут опять наткнулась в Genom express. Пусть теперь тут лежит.
Поситали, значит, мРНКу и белочки, которые с нее считываются. Вот что обнаружилось (прошу прощения за корявый перевод, некогда возиться):
Как мы видим, выраженная в цифрах скорость транскрипции в этой эпической картине занимает весьма скромное место: происходит медленно, быстро валится, а при этом трансляция разворачивается во всей своей красе. Самое вкусненькое, конечно же, происходит между тыщами белочков , которые находятся в один момент в клетке (не перестаю удивляться: куда это все помещается?!), что-то делают: синтезируют, передают сигналы и молекулы, строят комплексы, что-то разрушают, куда-то встраиваются, катализируют, связываются, транспортируются из клетки, в клетку, в разные части клетки и тыды и тыпы.
В этом смысле, регуляция трансляции привлекает все больше внимания.
По материалам Schwanhausser, B. et al. (2011) Global quantification of mammalian gene expression control. Nature
Поситали, значит, мРНКу и белочки, которые с нее считываются. Вот что обнаружилось (прошу прощения за корявый перевод, некогда возиться):
Как мы видим, выраженная в цифрах скорость транскрипции в этой эпической картине занимает весьма скромное место: происходит медленно, быстро валится, а при этом трансляция разворачивается во всей своей красе. Самое вкусненькое, конечно же, происходит между тыщами белочков , которые находятся в один момент в клетке (не перестаю удивляться: куда это все помещается?!), что-то делают: синтезируют, передают сигналы и молекулы, строят комплексы, что-то разрушают, куда-то встраиваются, катализируют, связываются, транспортируются из клетки, в клетку, в разные части клетки и тыды и тыпы.
В этом смысле, регуляция трансляции привлекает все больше внимания.
По материалам Schwanhausser, B. et al. (2011) Global quantification of mammalian gene expression control. Nature
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2011-10-14 07:12 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:14 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:сила
From:(no subject)
From:Щас прям.
Date: 2011-10-14 02:51 pm (UTC)Клетка внутри не очень-то жидкая, цитоскелета там дофига и больше и он в постоянном движении.
no subject
Date: 2011-10-14 07:16 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:17 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:17 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:18 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:19 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 07:22 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:29 am (UTC)2. Все сложно.
3. Если кто-то с умным видом рассуждает об экспрессии генов, можно с не менее умным видом заявить, что от экспрессии до функции белка большая такая пропасть. п.1 и п.2.
4. Обыватель, береги свои белки!
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 07:41 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 07:43 am (UTC)страница 10
(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 07:43 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:25 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 08:36 am (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 08:40 am (UTC)Для того же ДНК и придумала жизнь, чтобы с РНК не париться.
Хотя вирусы РНК в качестве носителя вовсю используют, но у них код короткий, ему лишние перестановки и искажения часто только на пользу идут - отбор быстро фиксирует нужное и отсекает нежизнеспособные варианты.
А вот бактерии и особенно эукариоты пошли по другому пути - для них важно позасовывать в ДНК побольше всяких возможностей, а потом их управляемо оттуда извлекать.
(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 11:33 am (UTC)no subject
Date: 2011-10-14 09:16 am (UTC)стеснительно
Date: 2011-10-14 10:14 am (UTC)Re: стеснительно
From:no subject
Date: 2011-10-14 12:27 pm (UTC)А ещё есть post-translational modifications.
Кошмар, в общем...
no subject
Date: 2011-10-14 02:54 pm (UTC)Меня всегда колбасило от использования real time PCR в качестве показателя уровня экспрессии белка.
no subject
Date: 2011-10-14 05:27 pm (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2011-10-14 05:09 pm (UTC)мне вот интересно как оно умудряется починить иногда то что наломалось. у меня это, откровенно говоря, вообще в голове не укладывается.
no subject
Date: 2011-10-14 05:31 pm (UTC)состоящий из 34350 различных аминокислот — самый большой из известных нам белков. Молекулярная масса белка равна приблизительно 2 993 442.763 а. е. м. Эмпирическая химическая формула этого белка — C132983H211861N36149O40883S693. Период полураспада (время, требующееся для исчезновения половины содержащегося белка в клетке после его синтеза) равен примерно 30 часам (в ретикулоцитах животных)Он играет важную роль в процессе сокращения поперечно-полосатых мышц. Ген титина содержит самое большое количество интронов.
Все из Вики.
Период полураспада - значит копий больше двух минимально, куда это все умещается. И упоминавшееся тут "бутылочное горло" аминокислот: откуда их столько берется?
И наибольшее количество интронов: значит пре-мРНК еще длиннее7
РНК-эпигенетика
Date: 2011-10-18 02:46 pm (UTC)Белок ожирения помог открыть новое научное направление
http://science.compulenta.ru/640797/
"...по-видимому, к ДНК-эпигенетике скоро прибавится РНК-эпигенетика. Оказалось, что не только ДНК является обладательницей регулирующих метильных модификаций; такие же модификации может нести и скопированная с ДНК матричная РНК, на которой и происходит синтез белка. "