![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
progenesВсе посмотрели уже Аватар? Понравилось? А теперь смотрите сюда и слушайте. Если дело пойдет и дальше так, то фиг вы получите не только клонированных инопланетян, но и людишек даже в ближайшие тыщу лет!
Приблизительно в 2001 году у нас в группе стартовал проект по визуализации развития ячменного семени. Идея заключалась в том, чтобы накрошить семя на тонкие срезы, все заснять и сложить с помощью информатиков в 3D модель. Это программа-минимум. Программа-максимум заключалась в том, чтобы сделать точный анатомический атлас семени и интегрировать в модель места работы определенных генов. Лет пять бодались, получилась убогая картинка, которая не обогатила человечество знаниями ни на йоту. Вот такая.
Взяли на проект нового цитолога и новых информатиков, дали им лазер для нарезки. Накрошили и собрали модель чуток получше. Но показать вам ее я не могу, потому что биологи поссорились с информатиками по поводу на каком сервере вывешивать картинки - у нас в институте, или у них в недружественном университете. Пока не решат, человечество так и не узнает, что там в ячменном семени внутри. Впрочем, ничего нового там тоже не нашли, просто красиво. Я видела.
UPD: оказалось, что самые красивые картинкиньювасюковцы Pattern Recognition Group выложила у нас на сайте: Projects=>Automatic Generation of 3-D and 4-D Models. Выглядит душераздирающе.
Теперь касательно реализации программы-максимум про те гены, которые там работают. Я там каким-то боком, поэтому расскажу, меня прет. Вырезали лазером ткани очень махонькие из этих срезов. Выделили из них РНК и загибридизовали на ячменный чип на котором 43 тысячи генов. Звучит наверное очень красиво и удивительно. Но пока все интеллектуальные силы информатиков брошены на конструирование 3D-эффектов Аватаров, я тут обливаюсь горючими слезами. Я уже вижу, какие генные последовательности включились в этом гребаном семени, я головой и ручками в Экселе посчитала. Но как только я решила посмотреть, что именно это за гены, то тут (цензоред) меня ждало жестокое разочарование. Потому что из всех 43 тыщ генов автоматически определены едва 5%. А остальное 95% неидентифицированное нечто по 60 нуклеотидов длинной. И вот уже вторую неделю я терзаю всемирное биоинформатическое комьюнити в надежде, что может какая биоинформатическая сволочь их когда-то где-то определила, иначе все эти чипы (цензоред)коту под хвост. Мне "пшеничные" спецы смеются гомерически в лицо, потому что у них дела обстоят еще хуже, у них и этой информации нету.
А в это время, в Германии финансирование немецкого кинематографа больше, чем финансирование науки. А бюджет одного голливудского Аватара будет поболе финансирования всей мировой биоинформатики. Поняли? Так что клонированные аватары в ближайшем будущем только в кино.
Приблизительно в 2001 году у нас в группе стартовал проект по визуализации развития ячменного семени. Идея заключалась в том, чтобы накрошить семя на тонкие срезы, все заснять и сложить с помощью информатиков в 3D модель. Это программа-минимум. Программа-максимум заключалась в том, чтобы сделать точный анатомический атлас семени и интегрировать в модель места работы определенных генов. Лет пять бодались, получилась убогая картинка, которая не обогатила человечество знаниями ни на йоту. Вот такая.
Взяли на проект нового цитолога и новых информатиков, дали им лазер для нарезки. Накрошили и собрали модель чуток получше. Но показать вам ее я не могу, потому что биологи поссорились с информатиками по поводу на каком сервере вывешивать картинки - у нас в институте, или у них в недружественном университете. Пока не решат, человечество так и не узнает, что там в ячменном семени внутри. Впрочем, ничего нового там тоже не нашли, просто красиво. Я видела.
UPD: оказалось, что самые красивые картинки
Теперь касательно реализации программы-максимум про те гены, которые там работают. Я там каким-то боком, поэтому расскажу, меня прет. Вырезали лазером ткани очень махонькие из этих срезов. Выделили из них РНК и загибридизовали на ячменный чип на котором 43 тысячи генов. Звучит наверное очень красиво и удивительно. Но пока все интеллектуальные силы информатиков брошены на конструирование 3D-эффектов Аватаров, я тут обливаюсь горючими слезами. Я уже вижу, какие генные последовательности включились в этом гребаном семени, я головой и ручками в Экселе посчитала. Но как только я решила посмотреть, что именно это за гены, то тут (цензоред) меня ждало жестокое разочарование. Потому что из всех 43 тыщ генов автоматически определены едва 5%. А остальное 95% неидентифицированное нечто по 60 нуклеотидов длинной. И вот уже вторую неделю я терзаю всемирное биоинформатическое комьюнити в надежде, что может какая биоинформатическая сволочь их когда-то где-то определила, иначе все эти чипы (цензоред)коту под хвост. Мне "пшеничные" спецы смеются гомерически в лицо, потому что у них дела обстоят еще хуже, у них и этой информации нету.
А в это время, в Германии финансирование немецкого кинематографа больше, чем финансирование науки. А бюджет одного голливудского Аватара будет поболе финансирования всей мировой биоинформатики. Поняли? Так что клонированные аватары в ближайшем будущем только в кино.
Tags:
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2010-01-11 07:52 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-12 10:50 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-12 12:59 am (UTC)А по делу: у меня есть программист знакомый, который нам за очень нестрашный прайс написал очень приличную SQL базу на дельфи, ну в общем тут Аким поправляет что я пишу неправильно, но плевать. Факт тот, что я смогла сама ему сформулировать, что я хочу, и он это сделал. Потом потестировали вместе, доработали напильником, и пашет база вот уже четвертый год без единого нарекания. Он на момент написания нам базы преподавал в Универе питерском теорию написания баз. :) Ну короче это я к чему, теоретически если твое начальство будет готово выделить разумную сумму, он на это согласится, а ты сможешь внятно, четко, по пунктам, с примерами и по-русски сформулировать все, что хочешь, и возьмешь на себя перевод на немецкий интерфейса, то может чего и получится.
no subject
Date: 2010-01-12 10:07 am (UTC)Ну и правильно! ГОВНО!!!! миллионы мух не могут ошибаться!!!
no subject
Date: 2010-01-12 10:09 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-12 07:11 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-13 07:05 am (UTC)(no subject)
From:no subject
Date: 2010-01-13 06:39 am (UTC)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19958483?itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_RVDocSum&ordinalpos=2
no subject
Date: 2010-01-13 07:04 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-14 08:10 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 08:59 pm (UTC)Это, если что, сарказм. Да. Кэмерону надо было вместо осуществления своей мечты, вложить деньги в осуществление вашей. Определённо :)
Что ж люди все такие завистники! Нравится вам ваше дело? Делайте его, не смотрите на других, не завидуйте чужим деньгам. Не нравится вам ваше дело? Зачем вы тогда его делаете и с жёлчью пишете о других?
Короче, не считайте чужое бабло, не разрушайте чужие мечты, не указывайте людям, что для них важнее, они без вас разберутся.
no subject
Date: 2010-01-16 06:51 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 09:40 pm (UTC)no subject
Date: 2010-01-15 11:19 pm (UTC)А можно и вообще запретить или отбить охоту к изобретательству - брать деньги за изобретения у самого изобретателя (уже опробовано).
no subject
Date: 2010-01-16 12:55 am (UTC)биоинфоматика
Date: 2010-01-16 03:35 am (UTC)Re: биоинфоматика
Date: 2010-01-16 09:28 am (UTC)Re: биоинфоматика
From:Re: биоинфоматика
From:Re: биоинфоматика
From:Re: биоинфоматика
From:Божий дар и яичница.
Date: 2010-01-16 06:37 am (UTC)Вот в разработку новых моделей автомобилей вкладываются такие же деньги. Что, предлагаете годик обождать, дать на науку?
Или там, на застройщикам годик не строить дома на продажу?
Отчего вы считаете чужие деньги?
Re: Божий дар и яичница.
Date: 2010-01-16 06:50 pm (UTC)Re: Божий дар и яичница.
From:no subject
Date: 2010-01-16 12:58 pm (UTC)А именно капитализму и нужны ваши гены, социализм вон северокорейский молча морит людей вообще без генетики, одни пушки да танки делает. А фильмы - они начинались между прочим с энтузиазма, с талантов, и были очень скромны по бюджетам. Просто развитие сделало своё дело, а вам, как исследователю - стыдно самой до этого не додуматься. Очень стыдно.
no subject
Date: 2010-01-16 04:50 pm (UTC)но пока мало реальных данных
А вы не могли бы прислать excel файл с описанием agilent чипа на igor_t_ruсобакаyahoo.com
Для начала хотелось бы оттранслировать имена типа "HV_CEb0009P15f" в нормальные GI
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucest/8903858
...из касты злобных биоинформатиков
no subject
Date: 2010-01-16 06:48 pm (UTC)(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:(no subject)
From:no subject
Date: 2010-01-16 11:50 pm (UTC)Пока дали 500 млн. руб. на эскизный проект. Это меньше чем заплатили Кетрин Зета-Джонс за право использовать ее лицо в рекламе T-Mobile. И куда мы так докатимся?
no subject
Date: 2010-01-22 05:13 am (UTC)no subject
Date: 2010-01-22 08:31 am (UTC)