Генетическая структура европейской популяции.

[progenes]

Я уже писала о технических возможностях анализа человеческого генома. Совсем недавно завершился еще один масштабный проект анализа геномных различий у европейцев - Population Reference Sample POPRES: исследовались одновременно около 500 тыс отдельных различий в ДНК (single nucleotide polymorphism SNP) у около 3 тыс европейцев. После того, как эти различия были зафиксированы, ими занялись математики, которые с помощью метода главных компонент сгруппировали различия по двум координатам. В результате образовались паттерны "подобных различий". И что вы думаете? Они чудесным образом совпали с...

современной географической картой.


Большие цветные блямбы показывают медиану в национальной популяции. Буквами показано отдельных индивидуумов. Можно сравнить с географической картой и поразиться, что в некоторых случаях генетическое различие совпадает с предсказанным местом его географического местоположениея с точностью до 100 км.


Однако внимание, в случае Украины, Дании, Финляндии, Латвии и Словакии речь идет всего об одном представителе.

Выводы:

1.В Европе наблюдается относительная генетическая гомогенность, а те различия, которые мы наблюдаем, обусловлены определенной географической изоляцией.
2. То, что отдельные этнические группы попадают в различные кластеры, свидетельствует не только о культурном различии, но с определенной долей о биологическом различии.
3. Некоторые группы попадают в отдельный неперкрывающийся с другими кластер, как например испано-португальская группа не перекрывается со шведской. Некоторые перекрываются в равной мере как ирландия с британцами. Однако в некоторых случаях наблюдается ассиметричное перекрывание : югославы внедряються в греческий кластер, но не наоборот.

Источник Genes mirror geography within Europe в журнале Нейчер.

Comments

[pstas.livejournal.com]

Современные границы Европы - очень недавняя вещь. Неужели генетические маркеры подстраиваются под границы так быстро? Или государства образуются на основе генетических различий между людьми?

[progenes.livejournal.com]

Откровенно говоря, меня этот факт тоже сильно удивил. Это не генетические маркеры "подстраиваются". Это просто еще раз доказывает тот факт, что человечество продолжает эволюционировать, причем значительно быстрее, чем мы подозреваем. http://progenes.livejournal.com/19709.html#cutid1

[bdag-med.livejournal.com]

Тут, видимо, еще одна штука - политические границы не столь уж недавние и произвольные (можно вспомнить раздел империи Карла Великого), они подстраиваются под физическую географию, в частности. Стоит смотреть на это по-другому, есть границы политические, есть границы физгеографические, есть границы популяционные, есть границы культурные и тд., ни одна не главнее.

[kondybas.livejournal.com]

Если взять в руку какашку и крепко сжать, то получится фигурка, точно соответствующая руке.

Если взять выборки и изначально их рассортировать по принадлежности к современному политическому делению, то в статистической картине обнаружится, что выборки привязаны к политическому делению. Что в данные заложишь - то и найдешь. Это не потому, что какашки непременно нужно брать в руки, или руки ни на что не годятся, кроме, как какашки мять задумчиво. Просто есть вещи, которые неминуемо приводят к определенным результатам.

[progenes.livejournal.com]

Только рассматривая картинки, можно и не понять смысл. Тогда я рекомендую почитать. Многое проясняется.

[kondybas.livejournal.com]

У меня профессор, читавший основы электротехники в КПИ, отличался феноменальными способностями. Он в уме делал вычисления в комплексных числах до второго знака после запятой, и ни одна контрольная работа с липовыми значениями мимо него не проскакивала. Разумеется, это последствия долгой практики. У меня практика в теорвере и матстатистике покороче, но откровенные, бросающиеся в глаза ляпы я не пропускаю.

[progenes.livejournal.com]

Суровый , но справедливый. Я ж ссылочку на оригинал дала, да? Тыц туда. Там есть Supplementary Information. Хопа, глядишь, и все стало на свои места. Это значительно проще, чем в уме вычислять до второго знака. У меня вопросов нет, в статье все корректно до последней запятой. И с точки зрения статистики тоже.

[kondybas.livejournal.com]

"..To read this story in full you will need to login or make a payment (see right).."

[progenes.livejournal.com]

Отож бо і воно. Если по делу, то товарищи ученые четко и недвусмысленно объяснили, что кластеризация русской популяции весьма условна за малым количеством проб. Тут какое дело. Вот я сейчас иду смотреть свою популяцию гороха. Особенности биологических проб заключаются в значительной вариабельности. Среди сотни растений обязательно встретится выродок, который будет выделяться мелким ростом, причин этому может быть тысяча. Я могу его отбраковать и сказать, чтобы не портил мне статистику. Но я этого делать не буду, а оставлю во внимании, с целью установить причины его уродливости. Однако с выводами повременю. Точно также с этими отдельными образцами. Конечно, можно выбросить эти одиночные примеры и сделать вид, будто их нет. Но даже если я их выброшу, то общая картина со статистической достоверностью немецкой популяции не поменяется, правильно? Но мы потеряем информацию о том, что по предварительным результатам поляки с русскими упали в один кластер, хотя и не станем шибко спекулировать не тему почему так случилось.

[kondybas.livejournal.com]

Старая шутка гласит: даже простейшая выборка (1,3,5,7,9,11,13) наглядно демонстрирует, что все нечетные числа - простые. А девятка - это так, погрешность эксперимента :)

[1inuxoid.livejournal.com]

посмеялся, спасибо :)