Генетическая структура европейской популяции.

[progenes]

Я уже писала о технических возможностях анализа человеческого генома. Совсем недавно завершился еще один масштабный проект анализа геномных различий у европейцев - Population Reference Sample POPRES: исследовались одновременно около 500 тыс отдельных различий в ДНК (single nucleotide polymorphism SNP) у около 3 тыс европейцев. После того, как эти различия были зафиксированы, ими занялись математики, которые с помощью метода главных компонент сгруппировали различия по двум координатам. В результате образовались паттерны "подобных различий". И что вы думаете? Они чудесным образом совпали с...

современной географической картой.


Большие цветные блямбы показывают медиану в национальной популяции. Буквами показано отдельных индивидуумов. Можно сравнить с географической картой и поразиться, что в некоторых случаях генетическое различие совпадает с предсказанным местом его географического местоположениея с точностью до 100 км.


Однако внимание, в случае Украины, Дании, Финляндии, Латвии и Словакии речь идет всего об одном представителе.

Выводы:

1.В Европе наблюдается относительная генетическая гомогенность, а те различия, которые мы наблюдаем, обусловлены определенной географической изоляцией.
2. То, что отдельные этнические группы попадают в различные кластеры, свидетельствует не только о культурном различии, но с определенной долей о биологическом различии.
3. Некоторые группы попадают в отдельный неперкрывающийся с другими кластер, как например испано-португальская группа не перекрывается со шведской. Некоторые перекрываются в равной мере как ирландия с британцами. Однако в некоторых случаях наблюдается ассиметричное перекрывание : югославы внедряються в греческий кластер, но не наоборот.

Источник Genes mirror geography within Europe в журнале Нейчер.

Comments

[kondybas.livejournal.com]

Если взять в руку какашку и крепко сжать, то получится фигурка, точно соответствующая руке.

Если взять выборки и изначально их рассортировать по принадлежности к современному политическому делению, то в статистической картине обнаружится, что выборки привязаны к политическому делению. Что в данные заложишь - то и найдешь. Это не потому, что какашки непременно нужно брать в руки, или руки ни на что не годятся, кроме, как какашки мять задумчиво. Просто есть вещи, которые неминуемо приводят к определенным результатам.

[progenes.livejournal.com]

Только рассматривая картинки, можно и не понять смысл. Тогда я рекомендую почитать. Многое проясняется.

[kondybas.livejournal.com]

У меня профессор, читавший основы электротехники в КПИ, отличался феноменальными способностями. Он в уме делал вычисления в комплексных числах до второго знака после запятой, и ни одна контрольная работа с липовыми значениями мимо него не проскакивала. Разумеется, это последствия долгой практики. У меня практика в теорвере и матстатистике покороче, но откровенные, бросающиеся в глаза ляпы я не пропускаю.

[progenes.livejournal.com]

Суровый , но справедливый. Я ж ссылочку на оригинал дала, да? Тыц туда. Там есть Supplementary Information. Хопа, глядишь, и все стало на свои места. Это значительно проще, чем в уме вычислять до второго знака. У меня вопросов нет, в статье все корректно до последней запятой. И с точки зрения статистики тоже.

[kondybas.livejournal.com]

"..To read this story in full you will need to login or make a payment (see right).."

[progenes.livejournal.com]

Отож бо і воно. Если по делу, то товарищи ученые четко и недвусмысленно объяснили, что кластеризация русской популяции весьма условна за малым количеством проб. Тут какое дело. Вот я сейчас иду смотреть свою популяцию гороха. Особенности биологических проб заключаются в значительной вариабельности. Среди сотни растений обязательно встретится выродок, который будет выделяться мелким ростом, причин этому может быть тысяча. Я могу его отбраковать и сказать, чтобы не портил мне статистику. Но я этого делать не буду, а оставлю во внимании, с целью установить причины его уродливости. Однако с выводами повременю. Точно также с этими отдельными образцами. Конечно, можно выбросить эти одиночные примеры и сделать вид, будто их нет. Но даже если я их выброшу, то общая картина со статистической достоверностью немецкой популяции не поменяется, правильно? Но мы потеряем информацию о том, что по предварительным результатам поляки с русскими упали в один кластер, хотя и не станем шибко спекулировать не тему почему так случилось.

[kondybas.livejournal.com]

Старая шутка гласит: даже простейшая выборка (1,3,5,7,9,11,13) наглядно демонстрирует, что все нечетные числа - простые. А девятка - это так, погрешность эксперимента :)

[1inuxoid.livejournal.com]

посмеялся, спасибо :)